RNA id: TCONS_00020265



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00020265
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_010251
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 47012341 ~ 47012457 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATCCACGCCcaaatcaccctgcagcccaagaccggttacttacttaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacttgggaaaactatgttgctgttgaaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175343

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00022036 lncRNA upstream 182104 46826588 ~ 46830237 (+) True XLOC_010249
TCONS_00022035 lncRNA upstream 215015 46796426 ~ 46797326 (+) True XLOC_010247
TCONS_00021751 lncRNA upstream 218169 46791221 ~ 46794172 (+) True XLOC_010246
TCONS_00022034 lncRNA upstream 218175 46790677 ~ 46794166 (+) False XLOC_010246
TCONS_00022033 lncRNA upstream 442857 46556343 ~ 46569484 (+) True XLOC_010241
TCONS_00021753 lncRNA downstream 371338 47383795 ~ 47389378 (+) False XLOC_010255
TCONS_00021752 lncRNA downstream 371338 47383795 ~ 47389378 (+) True XLOC_010255
TCONS_00020271 lncRNA downstream 416332 47428789 ~ 47430917 (+) True XLOC_010256
TCONS_00021754 lncRNA downstream 751768 47764225 ~ 47764819 (+) True XLOC_010257
TCONS_00021755 lncRNA downstream 986375 47998832 ~ 47999411 (+) True XLOC_010258
TCONS_00020261 mRNA upstream 204327 46807214 ~ 46808014 (+) True XLOC_010248
TCONS_00020260 mRNA upstream 270562 46725087 ~ 46741779 (+) True XLOC_010245
TCONS_00020259 mRNA upstream 298289 46695777 ~ 46714052 (+) True XLOC_010244
TCONS_00020258 mRNA upstream 321135 46684855 ~ 46691206 (+) True XLOC_010243
TCONS_00020256 mRNA upstream 331171 46666074 ~ 46681170 (+) False XLOC_010242
TCONS_00020266 mRNA downstream 190965 47203422 ~ 47204301 (+) True XLOC_010252
TCONS_00020267 mRNA downstream 195234 47207691 ~ 47232146 (+) True XLOC_010253
TCONS_00020268 mRNA downstream 296399 47308856 ~ 47344147 (+) True XLOC_010254
TCONS_00020269 mRNA downstream 416264 47428721 ~ 47449911 (+) False XLOC_010256
TCONS_00020270 mRNA downstream 416278 47428735 ~ 47450004 (+) False XLOC_010256
TCONS_00020229 other upstream 1345489 45666735 ~ 45666852 (+) True XLOC_010222
TCONS_00020228 other upstream 1424011 45588214 ~ 45588330 (+) True XLOC_010221
TCONS_00020217 other upstream 2307187 44704372 ~ 44705154 (+) True XLOC_010213
TCONS_00020216 other upstream 2324406 44683065 ~ 44687935 (+) True XLOC_010212
TCONS_00020214 other upstream 2406901 44605326 ~ 44605440 (+) True XLOC_010211
TCONS_00020272 other downstream 1010836 48023293 ~ 48023408 (+) True XLOC_010259
TCONS_00020273 other downstream 1145852 48158309 ~ 48158423 (+) True XLOC_010260
TCONS_00020274 other downstream 1244556 48257013 ~ 48257130 (+) True XLOC_010261
TCONS_00020297 other downstream 2535314 49547771 ~ 49547886 (+) True XLOC_010272
TCONS_00020308 other downstream 3227866 50240323 ~ 50254974 (+) True XLOC_010278

Expression Profile


//