RNA id: TCONS_00028235



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00028235
length 386
RNA type mRNA
GC content 0.46
exon number 3
gene id XLOC_014184
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 35013129 ~ 35017047 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GATCAATATTCGATATTTCTCCATAAATGTACGTTTTTAGATGTTTATAAAGGCTCGTGTAGGCAGTGTTGCTTCTATTTCTTTTACGTGTGTCTGTTTAACTACACTGGTTAGAAGAGTTTAAAGAAGGCGGATAAGCTACCGGCTAATGTGATCTTCACGCTCTCCTGAAGAAGGCCATGGCTCGTGGGCAGCAGAAGATCCAGTCCCAACAGAAGAATGCAAAAAAGGCAGCCGAGAAGAAGAAAGCTCAAGGAGCCGATCAGAAGACTGCAGCCAAAGCAGCGCTGGTCCACACATGTCCTGTGTGCAGGacACAGATGCCAGACCCCAAGACATTTAAACAGCATTTTGAAAGTAAACACCCAAAGTCCCCCATGCCTGCT

Function


GO:

id name namespace
GO:0008150 biological_process biological_process

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040808-48 Orthologous to human ZNF706 (zinc finger protein 706).

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000139342

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029979 lncRNA upstream 98413 34887575 ~ 34914799 (+) True XLOC_014181
TCONS_00029978 lncRNA upstream 261435 34749038 ~ 34751777 (+) True XLOC_014180
TCONS_00029977 lncRNA upstream 274847 34701677 ~ 34738365 (+) True XLOC_014178
TCONS_00029976 lncRNA upstream 731234 34280764 ~ 34281978 (+) True XLOC_014176
TCONS_00029975 lncRNA upstream 1214802 33795748 ~ 33798410 (+) True XLOC_014169
TCONS_00029980 lncRNA downstream 345185 35361480 ~ 35363590 (+) True XLOC_014185
TCONS_00028236 lncRNA downstream 352307 35368602 ~ 35369837 (+) True XLOC_014186
TCONS_00029981 lncRNA downstream 357238 35373533 ~ 35378466 (+) False XLOC_014187
TCONS_00029985 lncRNA downstream 357238 35373533 ~ 35379985 (+) False XLOC_014187
TCONS_00029987 lncRNA downstream 357238 35373533 ~ 35379985 (+) False XLOC_014187
TCONS_00028233 mRNA upstream 8265 35002479 ~ 35004947 (+) True XLOC_014183
TCONS_00028231 mRNA upstream 55027 34950200 ~ 34958185 (+) False XLOC_014182
TCONS_00028232 mRNA upstream 55324 34952582 ~ 34957888 (+) True XLOC_014182
TCONS_00028230 mRNA upstream 266334 34742706 ~ 34746878 (+) True XLOC_014179
TCONS_00028228 mRNA upstream 333474 34311374 ~ 34679738 (+) True XLOC_014177
TCONS_00028238 mRNA downstream 783089 35799384 ~ 35852390 (+) True XLOC_014190
TCONS_00028244 mRNA downstream 2102252 37118547 ~ 37119891 (+) True XLOC_014198
TCONS_00028245 mRNA downstream 2104196 37120491 ~ 37134211 (+) True XLOC_014199
TCONS_00028246 mRNA downstream 2119405 37135700 ~ 37139452 (+) True XLOC_014200
TCONS_00028247 mRNA downstream 2442315 37458610 ~ 37492517 (+) True XLOC_014201
TCONS_00028229 other upstream 266479 34742706 ~ 34746733 (+) False XLOC_014179
TCONS_00028225 other upstream 805932 34207162 ~ 34207280 (+) True XLOC_014173
TCONS_00028221 other upstream 877517 34135607 ~ 34135695 (+) True XLOC_014171
TCONS_00028217 other upstream 1247487 33732162 ~ 33765725 (+) False XLOC_014168
TCONS_00028194 other upstream 2194638 32814320 ~ 32818574 (+) True XLOC_014160
TCONS_00028237 other downstream 762547 35778842 ~ 35778957 (+) True XLOC_014189
TCONS_00028239 other downstream 1186783 36203078 ~ 36203195 (+) True XLOC_014193
TCONS_00028240 other downstream 1226496 36242791 ~ 36242908 (+) True XLOC_014194
TCONS_00028243 other downstream 1663796 36680091 ~ 36680207 (+) True XLOC_014197
TCONS_00028250 other downstream 2653365 37669660 ~ 37669774 (+) True XLOC_014206

Expression Profile


//