RNA id: TCONS_00028264


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00028264
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_014217
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 38948572 ~ 38948686 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGACACAGACAAATCACCCTGAGCCCAAGACCggtactcactgaagctaagcaggtcagagcctggtcagtacctggatgaaagaccacatgggaaaactaggttgctgttaaaA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186431

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030015 lncRNA upstream 169811 38733094 ~ 38778761 (+) True XLOC_014215
TCONS_00030014 lncRNA upstream 170838 38733094 ~ 38777734 (+) False XLOC_014215
TCONS_00030013 lncRNA upstream 472707 38473440 ~ 38475865 (+) True XLOC_014214
TCONS_00030012 lncRNA upstream 480972 38455634 ~ 38467600 (+) False XLOC_014213
TCONS_00030011 lncRNA upstream 563948 38378399 ~ 38384624 (+) True XLOC_014212
TCONS_00028265 lncRNA downstream 327287 39275973 ~ 39285164 (+) False XLOC_014218
TCONS_00030016 lncRNA downstream 327287 39275973 ~ 39287333 (+) False XLOC_014218
TCONS_00030017 lncRNA downstream 327287 39275973 ~ 39290702 (+) False XLOC_014218
TCONS_00030018 lncRNA downstream 327287 39275973 ~ 39293345 (+) False XLOC_014218
TCONS_00030019 lncRNA downstream 328317 39277003 ~ 39293345 (+) True XLOC_014218
TCONS_00028261 mRNA upstream 481018 38422059 ~ 38467554 (+) False XLOC_014213
TCONS_00028257 mRNA upstream 620839 38168006 ~ 38327733 (+) False XLOC_014210
TCONS_00028258 mRNA upstream 620840 38168014 ~ 38327732 (+) True XLOC_014210
TCONS_00028256 mRNA upstream 690828 38167468 ~ 38257744 (+) False XLOC_014210
TCONS_00028252 mRNA upstream 1020531 37848830 ~ 37928041 (+) False XLOC_014207
TCONS_00028269 mRNA downstream 1077355 40026041 ~ 40039906 (+) False XLOC_014223
TCONS_00028270 mRNA downstream 1078273 40026959 ~ 40028071 (+) False XLOC_014223
TCONS_00028272 mRNA downstream 1120838 40069524 ~ 40113608 (+) False XLOC_014225
TCONS_00028273 mRNA downstream 1120838 40069524 ~ 40113935 (+) False XLOC_014225
TCONS_00028274 mRNA downstream 1122875 40071561 ~ 40113608 (+) True XLOC_014225
TCONS_00028262 other upstream 481921 38464131 ~ 38466651 (+) True XLOC_014213
TCONS_00028260 other upstream 521889 38422059 ~ 38426683 (+) False XLOC_014213
TCONS_00028259 other upstream 692180 38256276 ~ 38256392 (+) True XLOC_014211
TCONS_00028250 other upstream 1278798 37669660 ~ 37669774 (+) True XLOC_014206
TCONS_00028243 other upstream 2268365 36680091 ~ 36680207 (+) True XLOC_014197
TCONS_00028266 other downstream 926145 39874831 ~ 39874947 (+) True XLOC_014221
TCONS_00028268 other downstream 1077242 40025928 ~ 40055391 (+) False XLOC_014223
TCONS_00028276 other downstream 1167576 40116262 ~ 40126764 (+) False XLOC_014226
TCONS_00028293 other downstream 1388868 40337554 ~ 40344737 (+) False XLOC_014231
TCONS_00028303 other downstream 2009814 40958500 ~ 40958616 (+) True XLOC_014238