RNA id: TCONS_00030571



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00030571
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_015239
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 9875529 ~ 9875645 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


acacacagccatatcaccctgcagcatAAGACCGGCtactcactgaagccaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccactagggaatactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179465

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00030570 lncRNA upstream 36880 9838071 ~ 9838649 (+) True XLOC_015238
TCONS_00033483 lncRNA upstream 218482 9652353 ~ 9657047 (+) False XLOC_015236
TCONS_00033487 lncRNA downstream 409116 10284761 ~ 10285629 (+) True XLOC_015251
TCONS_00030592 lncRNA downstream 510834 10386479 ~ 10416272 (+) True XLOC_015252
TCONS_00033488 lncRNA downstream 687854 10563499 ~ 10564386 (+) True XLOC_015253
TCONS_00033489 lncRNA downstream 728868 10604513 ~ 10607329 (+) True XLOC_015254
TCONS_00030612 lncRNA downstream 1179671 11055316 ~ 11063844 (+) True XLOC_015262
TCONS_00030562 mRNA upstream 33289 9821757 ~ 9842240 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030565 mRNA upstream 33887 9821790 ~ 9841642 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030563 mRNA upstream 34007 9821770 ~ 9841522 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030566 mRNA upstream 36816 9822319 ~ 9838713 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030567 mRNA upstream 36816 9822337 ~ 9838713 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030572 mRNA downstream 43033 9918678 ~ 9941230 (+) False XLOC_015240
TCONS_00030573 mRNA downstream 43290 9918935 ~ 9941405 (+) True XLOC_015240
TCONS_00030574 mRNA downstream 70476 9946121 ~ 9957805 (+) True XLOC_015241
TCONS_00030575 mRNA downstream 95297 9970942 ~ 9982960 (+) False XLOC_015242
TCONS_00030576 mRNA downstream 98042 9973687 ~ 9983661 (+) False XLOC_015242
TCONS_00030569 other upstream 33665 9838032 ~ 9841864 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030568 other upstream 41723 9831338 ~ 9833806 (+) False XLOC_015238
TCONS_00030545 other upstream 1686129 8189285 ~ 8189400 (+) True XLOC_015223
TCONS_00030543 other upstream 1828272 8045416 ~ 8047257 (+) True XLOC_015221
TCONS_00030536 other upstream 2151588 7723870 ~ 7723941 (+) True XLOC_015217
TCONS_00030577 other downstream 98236 9973881 ~ 9982953 (+) True XLOC_015242
TCONS_00030590 other downstream 330356 10206001 ~ 10206118 (+) True XLOC_015249
TCONS_00030605 other downstream 1131012 11006657 ~ 11006790 (+) True XLOC_015261
TCONS_00030617 other downstream 1368241 11243886 ~ 11244007 (+) True XLOC_015265
TCONS_00030621 other downstream 1881279 11756924 ~ 11764998 (+) False XLOC_015269

Expression Profile


//