RNA id: TCONS_00031120


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031120
length 264
RNA type processed_transcript
GC content 0.43
exon number 3
gene id XLOC_015574
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 32701820 ~ 32719974 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GGAAGGTTTACAGAATCCAGTCAGATTGAAGCAAGACGCCACAGCCGGATTTCTGTACATCCATTTGCACAGTACTGTACAACAAGTTTCCTTTGCTGAGTTCCTTGGTCaggggtttaaacacattttctgtCCAGTACTGCAGTTGGAATTTTCCATCAacatttttatgaCAACCGATGTCCATGTCAAAAGAGCGTCTATTCTTCAAGCTCTCTTTACCTACCTTGGTGAGGATGAGGCATGCCTGGTGAAAGAATACAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000147720

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033589 lncRNA upstream 54447 32644925 ~ 32647404 (+) True XLOC_015573
TCONS_00033588 lncRNA upstream 64346 32637080 ~ 32637505 (+) True XLOC_015572
TCONS_00033587 lncRNA upstream 93824 32604867 ~ 32608027 (+) True XLOC_015571
TCONS_00033585 lncRNA upstream 310877 32385688 ~ 32390974 (+) False XLOC_015570
TCONS_00031131 lncRNA downstream 146790 32854201 ~ 32862149 (+) True XLOC_015583
TCONS_00033591 lncRNA downstream 159164 32866575 ~ 32883571 (+) False XLOC_015584
TCONS_00033592 lncRNA downstream 159165 32866576 ~ 32985766 (+) False XLOC_015584
TCONS_00033593 lncRNA downstream 159165 32866576 ~ 33029428 (+) False XLOC_015584
TCONS_00033594 lncRNA downstream 159176 32866587 ~ 33029428 (+) False XLOC_015584
TCONS_00031114 mRNA upstream 683480 32016256 ~ 32018371 (+) False XLOC_015566
TCONS_00031115 mRNA upstream 684257 32016516 ~ 32017594 (+) True XLOC_015566
TCONS_00031112 mRNA upstream 692135 31948352 ~ 32009716 (+) False XLOC_015565
TCONS_00031113 mRNA upstream 695539 31957554 ~ 32006312 (+) True XLOC_015565
TCONS_00031108 mRNA upstream 749850 31942426 ~ 31952001 (+) False XLOC_015565
TCONS_00031121 mRNA downstream 36396 32743807 ~ 32756706 (+) True XLOC_015575
TCONS_00031123 mRNA downstream 72727 32780138 ~ 32790887 (+) False XLOC_015577
TCONS_00031125 mRNA downstream 89462 32796873 ~ 32799083 (+) True XLOC_015578
TCONS_00031126 mRNA downstream 118824 32826235 ~ 32834441 (+) False XLOC_015579
TCONS_00031128 mRNA downstream 128268 32835679 ~ 32838894 (+) True XLOC_015580
TCONS_00031118 other upstream 93824 32604847 ~ 32608027 (+) False XLOC_015571
TCONS_00031110 other upstream 753396 31942459 ~ 31948455 (+) False XLOC_015565
TCONS_00031085 other upstream 1356655 31330923 ~ 31345196 (+) True XLOC_015548
TCONS_00031082 other upstream 1370893 31271082 ~ 31330958 (+) False XLOC_015548
TCONS_00031079 other upstream 1593437 31107929 ~ 31108414 (+) True XLOC_015547
TCONS_00031122 other downstream 51252 32758663 ~ 32760332 (+) True XLOC_015576
TCONS_00031124 other downstream 82952 32790363 ~ 32790886 (+) True XLOC_015577
TCONS_00031127 other downstream 119092 32826503 ~ 32827253 (+) True XLOC_015579
TCONS_00031140 other downstream 482173 33189584 ~ 33200368 (+) False XLOC_015585
TCONS_00031160 other downstream 1048967 33756378 ~ 33757568 (+) True XLOC_015600

Expression Profile

//