RNA id: TCONS_00035020



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00035020
length 116
RNA type snRNA
GC content 0.41
exon number 1
gene id XLOC_017684
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 48610352 ~ 48610467 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ACACTCATGTTTCTCTTCAGATCGTataaatctttcgccttttactaaagatttccgtggggaggaacacAATGAGTATAACCTAATTTTTTGATGCCCTGCCTATCGGTGGGGCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118935

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036426 lncRNA upstream 26753 48578432 ~ 48583599 (+) True XLOC_017683
TCONS_00036425 lncRNA upstream 31344 48571307 ~ 48579008 (+) False XLOC_017683
TCONS_00036424 lncRNA upstream 31344 48571307 ~ 48579008 (+) False XLOC_017683
TCONS_00036423 lncRNA upstream 39251 48570460 ~ 48571101 (+) True XLOC_017682
TCONS_00036422 lncRNA upstream 40529 48568254 ~ 48569823 (+) True XLOC_017681
TCONS_00035028 lncRNA downstream 276010 48886477 ~ 48887533 (+) True XLOC_017691
TCONS_00035029 lncRNA downstream 282875 48893342 ~ 48894001 (+) True XLOC_017692
TCONS_00035031 lncRNA downstream 307987 48918454 ~ 48979756 (+) False XLOC_017693
TCONS_00036708 lncRNA downstream 307987 48918454 ~ 48979756 (+) False XLOC_017693
TCONS_00036709 lncRNA downstream 307987 48918454 ~ 48979756 (+) False XLOC_017693
TCONS_00035019 mRNA upstream 65120 48543492 ~ 48545232 (+) True XLOC_017680
TCONS_00035018 mRNA upstream 162512 48413712 ~ 48447840 (+) True XLOC_017677
TCONS_00035017 mRNA upstream 470411 48129759 ~ 48139941 (+) True XLOC_017676
TCONS_00035016 mRNA upstream 470412 48116476 ~ 48139940 (+) False XLOC_017676
TCONS_00035015 mRNA upstream 505089 48100261 ~ 48105263 (+) True XLOC_017675
TCONS_00035024 mRNA downstream 128687 48739154 ~ 48775067 (+) False XLOC_017688
TCONS_00035025 mRNA downstream 143578 48754045 ~ 48774594 (+) True XLOC_017688
TCONS_00035026 mRNA downstream 171601 48782068 ~ 48785991 (+) True XLOC_017689
TCONS_00035027 mRNA downstream 192781 48803248 ~ 48806728 (+) True XLOC_017690
TCONS_00035034 mRNA downstream 471500 49081967 ~ 49103317 (+) True XLOC_017696
TCONS_00035014 other upstream 628081 47982137 ~ 47982271 (+) True XLOC_017671
TCONS_00035012 other upstream 850444 47759786 ~ 47759908 (+) True XLOC_017669
TCONS_00035009 other upstream 1203088 47407150 ~ 47407264 (+) True XLOC_017664
TCONS_00035005 other upstream 1504095 47106094 ~ 47106257 (+) True XLOC_017658
TCONS_00035004 other upstream 1505479 47104710 ~ 47104873 (+) True XLOC_017657
TCONS_00035021 other downstream 728 48611195 ~ 48611310 (+) True XLOC_017685
TCONS_00035022 other downstream 1790 48612257 ~ 48612370 (+) True XLOC_017686
TCONS_00035023 other downstream 2854 48613321 ~ 48613436 (+) True XLOC_017687
TCONS_00035033 other downstream 422537 49033004 ~ 49033118 (+) True XLOC_017695
TCONS_00035066 other downstream 2601465 51211932 ~ 51212048 (+) True XLOC_017717

Expression Profile


//