RNA id: TCONS_00035014



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00035014
length 135
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_017671
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 47982137 ~ 47982271 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTCTGCCCCTatgacatttcattcatgcccctatGAAAAGGTTAAGTCagtggtcacccactgaagctaagcagggctgcgcctggtcagtatctggatgggagatcacatgggaaagctaggttgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121065

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036700 lncRNA upstream 269549 47555713 ~ 47712588 (+) False XLOC_017668
TCONS_00036699 lncRNA upstream 277402 47555700 ~ 47704735 (+) False XLOC_017668
TCONS_00036698 lncRNA upstream 277402 47555700 ~ 47704735 (+) False XLOC_017668
TCONS_00036420 lncRNA upstream 277402 47668588 ~ 47704735 (+) False XLOC_017668
TCONS_00036702 lncRNA upstream 277402 47668627 ~ 47704735 (+) True XLOC_017668
TCONS_00036703 lncRNA downstream 6180 47988451 ~ 48034675 (+) False XLOC_017672
TCONS_00036704 lncRNA downstream 8999 47991270 ~ 48034675 (+) True XLOC_017672
TCONS_00036421 lncRNA downstream 79475 48061746 ~ 48068088 (+) True XLOC_017673
TCONS_00036705 lncRNA downstream 90114 48072385 ~ 48083397 (+) True XLOC_017674
TCONS_00036706 lncRNA downstream 514269 48496540 ~ 48499747 (+) True XLOC_017678
TCONS_00035011 mRNA upstream 450268 47491247 ~ 47531869 (+) True XLOC_017666
TCONS_00035010 mRNA upstream 510542 47434709 ~ 47471595 (+) True XLOC_017665
TCONS_00035008 mRNA upstream 780035 47196506 ~ 47202102 (+) True XLOC_017663
TCONS_00035007 mRNA upstream 830271 47143900 ~ 47151866 (+) True XLOC_017660
TCONS_00035003 mRNA upstream 1035946 46925581 ~ 46946191 (+) True XLOC_017656
TCONS_00035015 mRNA downstream 117990 48100261 ~ 48105263 (+) True XLOC_017675
TCONS_00035016 mRNA downstream 134205 48116476 ~ 48139940 (+) False XLOC_017676
TCONS_00035017 mRNA downstream 147488 48129759 ~ 48139941 (+) True XLOC_017676
TCONS_00035018 mRNA downstream 431441 48413712 ~ 48447840 (+) True XLOC_017677
TCONS_00035019 mRNA downstream 561221 48543492 ~ 48545232 (+) True XLOC_017680
TCONS_00035012 other upstream 222229 47759786 ~ 47759908 (+) True XLOC_017669
TCONS_00035009 other upstream 574873 47407150 ~ 47407264 (+) True XLOC_017664
TCONS_00035005 other upstream 875880 47106094 ~ 47106257 (+) True XLOC_017658
TCONS_00035004 other upstream 877264 47104710 ~ 47104873 (+) True XLOC_017657
TCONS_00034982 other upstream 1468279 46508545 ~ 46513858 (+) False XLOC_017646
TCONS_00035020 other downstream 628081 48610352 ~ 48610467 (+) True XLOC_017684
TCONS_00035021 other downstream 628924 48611195 ~ 48611310 (+) True XLOC_017685
TCONS_00035022 other downstream 629986 48612257 ~ 48612370 (+) True XLOC_017686
TCONS_00035023 other downstream 631050 48613321 ~ 48613436 (+) True XLOC_017687
TCONS_00035033 other downstream 1050733 49033004 ~ 49033118 (+) True XLOC_017695

Expression Profile


//