RNA id: TCONS_00035029



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00035029
length 267
lncRNA type antisense
GC content 0.38
exon number 2
gene id XLOC_017692
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 48893342 ~ 48894001 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTTATGGGACCTGCTGTTATGTTCTCCATCATTGCTAGCTCCTGCTGATGTTGTTTTCTGTAATGCGTTCATCTTATACAAACCATTACATCTTATTCATTTCTCACTACCATTACCCATAATTGAGCAATCTGATGATTATgttgaagaaaataaatatttcaaacgtCAACACTTCTCCTGCCCTCCTGATTCTCTGACCGGAATCTGGTCCATATTTGGCCGCCTCAACCAGTGGAAAATTTACATGTAGTAAGGTTTACTACA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000162966

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00035028 lncRNA upstream 5809 48886477 ~ 48887533 (+) True XLOC_017691
TCONS_00036426 lncRNA upstream 309743 48578432 ~ 48583599 (+) True XLOC_017683
TCONS_00036425 lncRNA upstream 314334 48571307 ~ 48579008 (+) False XLOC_017683
TCONS_00036424 lncRNA upstream 314334 48571307 ~ 48579008 (+) False XLOC_017683
TCONS_00036423 lncRNA upstream 322241 48570460 ~ 48571101 (+) True XLOC_017682
TCONS_00035031 lncRNA downstream 24453 48918454 ~ 48979756 (+) False XLOC_017693
TCONS_00036708 lncRNA downstream 24453 48918454 ~ 48979756 (+) False XLOC_017693
TCONS_00036709 lncRNA downstream 24453 48918454 ~ 48979756 (+) False XLOC_017693
TCONS_00035030 lncRNA downstream 24453 48918454 ~ 48979756 (+) False XLOC_017693
TCONS_00036710 lncRNA downstream 24453 48918454 ~ 48984813 (+) False XLOC_017693
TCONS_00035027 mRNA upstream 86614 48803248 ~ 48806728 (+) True XLOC_017690
TCONS_00035026 mRNA upstream 107351 48782068 ~ 48785991 (+) True XLOC_017689
TCONS_00035024 mRNA upstream 118275 48739154 ~ 48775067 (+) False XLOC_017688
TCONS_00035025 mRNA upstream 118748 48754045 ~ 48774594 (+) True XLOC_017688
TCONS_00035019 mRNA upstream 348110 48543492 ~ 48545232 (+) True XLOC_017680
TCONS_00035034 mRNA downstream 187966 49081967 ~ 49103317 (+) True XLOC_017696
TCONS_00035035 mRNA downstream 225632 49119633 ~ 49175503 (+) False XLOC_017697
TCONS_00035036 mRNA downstream 893583 49787584 ~ 49800330 (+) False XLOC_017701
TCONS_00035037 mRNA downstream 893583 49787584 ~ 49801935 (+) False XLOC_017701
TCONS_00035038 mRNA downstream 893583 49787584 ~ 49801983 (+) False XLOC_017701
TCONS_00035023 other upstream 279906 48613321 ~ 48613436 (+) True XLOC_017687
TCONS_00035022 other upstream 280972 48612257 ~ 48612370 (+) True XLOC_017686
TCONS_00035021 other upstream 282032 48611195 ~ 48611310 (+) True XLOC_017685
TCONS_00035020 other upstream 282875 48610352 ~ 48610467 (+) True XLOC_017684
TCONS_00035014 other upstream 911071 47982137 ~ 47982271 (+) True XLOC_017671
TCONS_00035033 other downstream 139003 49033004 ~ 49033118 (+) True XLOC_017695
TCONS_00035066 other downstream 2317931 51211932 ~ 51212048 (+) True XLOC_017717
TCONS_00035075 other downstream 2622201 51516202 ~ 51516318 (+) True XLOC_017723
TCONS_00035099 other downstream 4025855 52919856 ~ 52919986 (+) True XLOC_017742

Expression Profile


//