RNA id: TCONS_00035075


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00035075
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_017723
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 51516202 ~ 51516318 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gaccacagccatatcaccctgcagcccaagactggttacacACTAAAGCTAAGCATGCCTGAGGCTcctcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176911

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036748 lncRNA upstream 33519 51481968 ~ 51482683 (+) True XLOC_017722
TCONS_00036745 lncRNA upstream 105023 51407080 ~ 51411179 (+) False XLOC_017720
TCONS_00036746 lncRNA upstream 107170 51407354 ~ 51409032 (+) False XLOC_017720
TCONS_00036747 lncRNA upstream 107170 51407514 ~ 51409032 (+) True XLOC_017720
TCONS_00035069 lncRNA upstream 107200 51407080 ~ 51409002 (+) False XLOC_017720
TCONS_00036749 lncRNA downstream 131276 51647594 ~ 51667197 (+) False XLOC_017724
TCONS_00036750 lncRNA downstream 131322 51647640 ~ 51667197 (+) True XLOC_017724
TCONS_00036430 lncRNA downstream 418985 51935303 ~ 52016412 (+) False XLOC_017727
TCONS_00036431 lncRNA downstream 452129 51968447 ~ 51977873 (+) False XLOC_017727
TCONS_00036432 lncRNA downstream 479783 51996101 ~ 52061098 (+) False XLOC_017727
TCONS_00035074 mRNA upstream 33611 51479263 ~ 51482591 (+) False XLOC_017722
TCONS_00035073 mRNA upstream 35938 51478939 ~ 51480264 (+) False XLOC_017722
TCONS_00035072 mRNA upstream 39353 51471921 ~ 51476849 (+) True XLOC_017721
TCONS_00035071 mRNA upstream 40048 51466046 ~ 51476154 (+) False XLOC_017721
TCONS_00035070 mRNA upstream 50131 51464670 ~ 51466071 (+) False XLOC_017721
TCONS_00035076 mRNA downstream 214340 51730658 ~ 51753885 (+) True XLOC_017725
TCONS_00035077 mRNA downstream 297114 51813432 ~ 51874288 (+) False XLOC_017726
TCONS_00035078 mRNA downstream 316712 51833030 ~ 51874288 (+) True XLOC_017726
TCONS_00035084 mRNA downstream 873540 52389858 ~ 52447533 (+) False XLOC_017733
TCONS_00035083 mRNA downstream 873540 52389858 ~ 52447533 (+) False XLOC_017733
TCONS_00035066 other upstream 304154 51211932 ~ 51212048 (+) True XLOC_017717
TCONS_00035033 other upstream 2483084 49033004 ~ 49033118 (+) True XLOC_017695
TCONS_00035023 other upstream 2902766 48613321 ~ 48613436 (+) True XLOC_017687
TCONS_00035022 other upstream 2903832 48612257 ~ 48612370 (+) True XLOC_017686
TCONS_00035021 other upstream 2904892 48611195 ~ 48611310 (+) True XLOC_017685
TCONS_00035099 other downstream 1403538 52919856 ~ 52919986 (+) True XLOC_017742