RNA id: TCONS_00000318


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00000318
length 90
RNA type processed_transcript
GC content 0.37
exon number 1
gene id XLOC_000173
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 13002978 ~ 13003067 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tctaACTCCAGATCAGTCTGTTCTGAGAAATAAAATCTCCATCAGCCTCCTTCTTCACACACAGAGAAATATTTTTGTACTGTGAGTTTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000159014

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00003040 lncRNA upstream 65889 12924626 ~ 12937089 (+) False XLOC_000172
TCONS_00003041 lncRNA upstream 65889 12924667 ~ 12937089 (+) False XLOC_000172
TCONS_00003042 lncRNA upstream 65889 12924717 ~ 12937089 (+) False XLOC_000172
TCONS_00003043 lncRNA upstream 65889 12924726 ~ 12937089 (+) False XLOC_000172
TCONS_00003044 lncRNA upstream 65889 12931294 ~ 12937089 (+) False XLOC_000172
TCONS_00002816 lncRNA downstream 475270 13478337 ~ 13481536 (+) False XLOC_000175
TCONS_00002815 lncRNA downstream 475270 13478337 ~ 13481536 (+) False XLOC_000175
TCONS_00003045 lncRNA downstream 476066 13479133 ~ 13482234 (+) False XLOC_000175
TCONS_00002818 lncRNA downstream 478568 13481635 ~ 13482509 (+) False XLOC_000175
TCONS_00002817 lncRNA downstream 478568 13481635 ~ 13482509 (+) True XLOC_000175
TCONS_00000313 mRNA upstream 205568 12766351 ~ 12797410 (+) False XLOC_000170
TCONS_00000312 mRNA upstream 206400 12763920 ~ 12796578 (+) False XLOC_000170
TCONS_00000314 mRNA upstream 209385 12767318 ~ 12793593 (+) True XLOC_000170
TCONS_00000311 mRNA upstream 209520 12763461 ~ 12793458 (+) False XLOC_000170
TCONS_00000310 mRNA upstream 239008 12763461 ~ 12763970 (+) False XLOC_000170
TCONS_00000319 mRNA downstream 84730 13087797 ~ 13089102 (+) True XLOC_000174
TCONS_00000320 mRNA downstream 927558 13930625 ~ 13952084 (+) True XLOC_000176
TCONS_00000321 mRNA downstream 1017378 14020445 ~ 14026780 (+) True XLOC_000178
TCONS_00000322 mRNA downstream 1070824 14073891 ~ 14158563 (+) True XLOC_000179
TCONS_00000323 mRNA downstream 1250051 14253118 ~ 14254166 (+) True XLOC_000180
TCONS_00000315 other upstream 149715 12848061 ~ 12853263 (+) False XLOC_000171
TCONS_00000316 other upstream 149965 12848072 ~ 12853013 (+) True XLOC_000171
TCONS_00000309 other upstream 266944 12735920 ~ 12736034 (+) True XLOC_000169
TCONS_00000307 other upstream 459503 12543359 ~ 12543475 (+) True XLOC_000167
TCONS_00000306 other upstream 571536 12431328 ~ 12431442 (+) True XLOC_000166
TCONS_00000325 other downstream 1334144 14337211 ~ 14337313 (+) True XLOC_000182
TCONS_00000334 other downstream 1670710 14673777 ~ 14673871 (+) True XLOC_000192
TCONS_00000335 other downstream 1691494 14694561 ~ 14694655 (+) True XLOC_000193
TCONS_00000336 other downstream 1698669 14701736 ~ 14701830 (+) True XLOC_000194
TCONS_00000337 other downstream 1705809 14708876 ~ 14708970 (+) True XLOC_000195