RNA id: TCONS_00000325



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000325
length 103
RNA type miRNA
GC content 0.33
exon number 1
gene id XLOC_000182
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 14337211 ~ 14337313 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


aaaagacgatattttgaagaatgctgaataaccattgacttccaaagaaTTAGGTTTTcctttatggaagtcaatggttaccagttttcagctttcttcagaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177692

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00003046 lncRNA upstream 254112 13997130 ~ 14083099 (+) True XLOC_000177
TCONS_00002818 lncRNA upstream 854702 13481635 ~ 13482509 (+) False XLOC_000175
TCONS_00002817 lncRNA upstream 854702 13481635 ~ 13482509 (+) True XLOC_000175
TCONS_00003045 lncRNA upstream 854977 13479133 ~ 13482234 (+) False XLOC_000175
TCONS_00002816 lncRNA upstream 855675 13478337 ~ 13481536 (+) False XLOC_000175
TCONS_00002819 lncRNA downstream 270521 14607834 ~ 14609880 (+) True XLOC_000190
TCONS_00003047 lncRNA downstream 432188 14769501 ~ 14770654 (+) False XLOC_000202
TCONS_00003048 lncRNA downstream 432294 14769607 ~ 14770654 (+) True XLOC_000202
TCONS_00003049 lncRNA downstream 514309 14851622 ~ 15021422 (+) True XLOC_000203
TCONS_00002820 lncRNA downstream 736087 15073400 ~ 15073664 (+) True XLOC_000204
TCONS_00000324 mRNA upstream 30373 14283692 ~ 14306838 (+) True XLOC_000181
TCONS_00000323 mRNA upstream 83045 14253118 ~ 14254166 (+) True XLOC_000180
TCONS_00000322 mRNA upstream 178648 14073891 ~ 14158563 (+) True XLOC_000179
TCONS_00000321 mRNA upstream 310431 14020445 ~ 14026780 (+) True XLOC_000178
TCONS_00000320 mRNA upstream 385127 13930625 ~ 13952084 (+) True XLOC_000176
TCONS_00000326 mRNA downstream 11086 14348399 ~ 14364710 (+) True XLOC_000183
TCONS_00000327 mRNA downstream 35367 14372680 ~ 14373891 (+) True XLOC_000184
TCONS_00000328 mRNA downstream 45271 14382584 ~ 14404555 (+) True XLOC_000185
TCONS_00000329 mRNA downstream 68785 14406098 ~ 14416435 (+) True XLOC_000186
TCONS_00000330 mRNA downstream 95121 14432434 ~ 14442902 (+) True XLOC_000187
TCONS_00000318 other upstream 1334144 13002978 ~ 13003067 (+) True XLOC_000173
TCONS_00000315 other upstream 1483948 12848061 ~ 12853263 (+) False XLOC_000171
TCONS_00000316 other upstream 1484198 12848072 ~ 12853013 (+) True XLOC_000171
TCONS_00000309 other upstream 1601177 12735920 ~ 12736034 (+) True XLOC_000169
TCONS_00000307 other upstream 1793736 12543359 ~ 12543475 (+) True XLOC_000167
TCONS_00000334 other downstream 336464 14673777 ~ 14673871 (+) True XLOC_000192
TCONS_00000335 other downstream 357248 14694561 ~ 14694655 (+) True XLOC_000193
TCONS_00000336 other downstream 364423 14701736 ~ 14701830 (+) True XLOC_000194
TCONS_00000337 other downstream 371563 14708876 ~ 14708970 (+) True XLOC_000195
TCONS_00000338 other downstream 378703 14716016 ~ 14716110 (+) True XLOC_000196