RNA id: TCONS_00073437



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073437
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_037325
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 37877434 ~ 37877550 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TggcacagccatatcaccctgcagcccaagactggttaatccctgaagctaagcagggctgagctttGTCAGTAACTGGAtgtgagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185046

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075177 lncRNA upstream 369161 37506959 ~ 37508273 (+) True XLOC_037322
TCONS_00075176 lncRNA upstream 384520 37475147 ~ 37492914 (+) True XLOC_037321
TCONS_00075175 lncRNA upstream 885583 36991163 ~ 36991851 (+) True XLOC_037315
TCONS_00075174 lncRNA upstream 944902 36928055 ~ 36932532 (+) True XLOC_037312
TCONS_00075173 lncRNA upstream 947242 36928055 ~ 36930192 (+) False XLOC_037312
TCONS_00075178 lncRNA downstream 144340 38021890 ~ 38024061 (+) True XLOC_037326
TCONS_00073443 lncRNA downstream 281050 38158600 ~ 38161207 (+) False XLOC_037329
TCONS_00073452 lncRNA downstream 415369 38292919 ~ 38296930 (+) False XLOC_037333
TCONS_00073455 lncRNA downstream 430136 38307686 ~ 38308570 (+) True XLOC_037333
TCONS_00073462 lncRNA downstream 535198 38412748 ~ 38418111 (+) True XLOC_037337
TCONS_00073434 mRNA upstream 14871 37850360 ~ 37862563 (+) False XLOC_037324
TCONS_00073435 mRNA upstream 16941 37850424 ~ 37860493 (+) False XLOC_037324
TCONS_00073436 mRNA upstream 20527 37850446 ~ 37856907 (+) True XLOC_037324
TCONS_00073433 mRNA upstream 37084 37754845 ~ 37840350 (+) True XLOC_037323
TCONS_00073431 mRNA upstream 424306 37366973 ~ 37453128 (+) True XLOC_037319
TCONS_00073438 mRNA downstream 165787 38043337 ~ 38065147 (+) True XLOC_037327
TCONS_00073439 mRNA downstream 196532 38074082 ~ 38130085 (+) False XLOC_037328
TCONS_00073440 mRNA downstream 198301 38075851 ~ 38129345 (+) False XLOC_037328
TCONS_00073441 mRNA downstream 210781 38088331 ~ 38129359 (+) True XLOC_037328
TCONS_00073442 mRNA downstream 281020 38158570 ~ 38162095 (+) False XLOC_037329
TCONS_00073432 other upstream 465448 37411870 ~ 37411986 (+) True XLOC_037320
TCONS_00073428 other upstream 695877 37181440 ~ 37181557 (+) True XLOC_037317
TCONS_00073423 other upstream 1079600 36794719 ~ 36797834 (+) True XLOC_037311
TCONS_00073422 other upstream 1079606 36794719 ~ 36797828 (+) False XLOC_037311
TCONS_00073421 other upstream 1079659 36794719 ~ 36797775 (+) False XLOC_037311
TCONS_00073445 other downstream 281248 38158798 ~ 38161649 (+) True XLOC_037329
TCONS_00073446 other downstream 282896 38160446 ~ 38160572 (+) True XLOC_037330
TCONS_00073447 other downstream 283713 38161263 ~ 38161389 (+) True XLOC_037331
TCONS_00073451 other downstream 401833 38279383 ~ 38286788 (+) True XLOC_037332
TCONS_00073453 other downstream 415397 38292947 ~ 38311747 (+) False XLOC_037333