G243411


Basic Information

Item Value
gene id G243411
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000057
NCBI id null
chromosome length 6014843
location 194141 ~ 200678 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU276242
AGCTTCTGCCAGACCACCTTCCGTATTATATGTACAACGAAAGTGTAAAACTCTTGCAGTTCAAAACACTTATGCTTCGTCCTATGCCTTCCCTATTCAACTTATGGAAAAAGTGTAACTGACATGATGCAGTTTACACTTCGTAACTTGAATACGGAAGGCAGTCTGACAGAAGCTAGATATTTTACTTCATAACTTGTTAAATATGGATTTTTTTTTTACACAAATGCATCGTTTCGCTTCAGAAGGCCTTTATTAACCCCCCGGAGCCGTGTGGAGTATGTTTATGATGGATGGATGTGGATGGAGACACTTTCTTCAGCTTCATACTTGTTGATCCCGTTCACTGCCATTATAAAGCTTGGATGTGTCAGGATATTTATTAAAATATCTTCGATTGTGTTCATCAGAAAGAAGAAAGTCATATACACCTAGGATGGCTTGAGGGTGAGTAAAGCTTGGACTAATTTTCATTTAAAAGTGAACTAATCCTTTAAACTATATTATTGATGAAAATAATACAAGAAAAATAAAGCTGCAGGTTATTATTAATAATGCAATGATGTTTTTGAAAAAAAAAATGTAATTAATATTAATGTTTCAAATAACAGCATTGCTGTTTGAGCTGTGTGTGCTGAAGCTGAATGCACTCTGGTAAACTGAAGCGCTTTGTGGGTTAATTAACTGCATCCTATTTGAGATTTAATCAGATACTTATGCAACATAAACATAATATTACAAGTTATATCTGGACAAAATTACACAAATGCACAAGTGAACTTGAACTAAGTTACGCCAGAATGTGTAACTCCTGTTGTGGATGCGCTCTTCCCGAAACAACATGCAGAAACACAGCAACTAAACCCAAAGAATTCAATGTTTAATTACAATACTGTTCTCATTATAATGCTATGTATATGATAGTCAATCATAGTTATTAATGTTGTGCATTTCTGTTTGAGCTGCGTGCGCTGAAGCTAAAGATGATCACTGGTAAACTGAAGCACTTTACTACCATGTTAATTAACTTATTTATTCGGTTTAATATATTGACCTAATTTTCTTATCGGGCCTATAACCATAACATTAAAAATGACTATATATCAGCTGATGGCGATATATCATGCATCCCTAATTTTAAAATATATTCAAATAGATAACAATTATTTAAAATTATAATATTAATTGACTATATAAATGATAGAGTGGCCAGAAAAGATATTTCTTAAAACAGTTTACTTCCTTTTTGTTTTTCTGCCTCTCAAGACACCATTAGATCAGCAGCAGAAGTTCTTACTGAGAGAAATAACGCAGCTTCTACACAACCATTAATGTGAGGATGGCAGTCTGCGTCAGGGCTCTTCAAATCACTTTCTTGGTCCACATGAATATGGCATCATTATGTAAGAGGGCTTCCCCCAGATCTTTCATCACTGTTATGAACCTGACATCTTGCTTATCGAGGGAAACATCAGTAGGCAGGTTTTGAGTTCCACTGAAGAGCACATCGGAGTCCGGAGAGACTGATACATTGCTCATATTCTTATCATTTATGTGATTTACATTACAGTATTCTTCATTTAGCAGATGCCTTCTTATCCAAACTAACTTACAGTAGGTTTGTACTTTTAGGGAAACCTGGAGCAACCTGGAACTTCGATGGTCATATTATGTCCTCAAAAGTCTTTCTTCAGGACTAATTATGCAATCGCCCCAGTACATTTATTTGCCAAAGGTTTATATATCCCATTTTTCTCATTTAATTATGTTCATGTTGCTCAGTTAATCTAGGTCTTTCTATTTTCTGTAAAAAAAAAAAAAATGAAAATGAACAACCACCACTGACATTTTCATTTACATAAACTGAGAGTGCAATATATTAAAATAATTAAAGTATTTATTATTTATTATAAATAATGAAGTCAATTTCATAACCCCAATAACTGAATGATCTTCATTGTTTACAGTTTTTATTATCAATGAATTTACATGAGTTTTTTAGTTTGTAATTACAGGGTTTTTAAAACAAAGATAAAACGTTTCTGTTTTTAGTACATCGTTGTCGTGTAAATGCACCCTAAAGGAATAGTTCACCGAAAAATACAAATTCTGTCATTCCTTTCTCTATTCTGTGGAGCACAAAATATATTTTGAAAAATATATTTATGTCCATACAATGAACAAAAACATTCTTCAAACTGTATTATTTTTGTGTAAACTATCCTTTTAACACGTAGTTAAGGTTTTCTTCAGATCCTTAACCTTGTGTATGGGTGATAGTAACGCTAGTAGTGATTTCCATTCCTGAGATTTAATGTTTTCAGATATTGAGATAGAAACTATTGTACTGAACAAAACGAGCCCGATGATGTAACGCTGTTTAAGTGGCTAAGCGTTCCCTAACAAACCCAGAGGGAATTCAGCCTAACTATACCTCTGATCTCTCATTTTCCTCATGCGTGCTTTAGTGGATTTTGAGATTGAGCACTGATTGTCTCTTCGCAGCATTGCTCGCTGTGGTGATCCCTCTGTGCCTTGTTACAAGACACAAAAACAATTGATTCGCAAAGCGCTCAATTCTCAATTTAAAAATAATAAAAATGAGACCTCTTTATATGTGTGTGTGATTTTCAGGAAGTTTTCGCAGTCCAGTTATGTGGGCAGGATTCTGCTGGCTGCTGTCAGACTCCGCCTGTCAGGTGATAGAGTGTGTTTTTGTGTGATTAAGTGAAGCCTTCCAGCAAAATAGTATAGCCTTGCCTCTCCAGAGGAACATAAATAGTGTTGCGCAGGTGAGGCAGCCCCACATTGCCATCTTTCAATCATCATATACTTCCTGGACATGTCGGTCTAACAATGTCAGTGGGTTTAATAATGATGGATCAGGTCTGTCAGCGAGCCATTATGGGCCACCTGTGAAAATGGCACTTAATTTGTGGTTGTTAATGCTTGTCGCTGTAGTTTCTTATGTGAGGTTGTAAATATCCCCGTTAATCCTGTCTTCACCGTGTGGGTTGGGAGTTGTATCGTCTTGATCACTCTGAATATGAGCTTCTTAGGATGTGATTTTCACCATGCAATAATAACCTTAACGGTCTCTTTCATGCAGGATATTGTGTTGTCAGCACAGTGTTTGAGGAAGCATAGGAGATTTTTAGGATAAGCTGGAGTTGAGCTCTTCATTAAAGCAAGAAGCTGCTGAGATGGAGTTTGCAATTTTACCAAAGTGAAGGGAGCAAGAGAGCAAAGAGAGAAGAGGAAGGAGTGCTTTTCTGTAACCAGGAAAGACTTTTTGTTATCTATACTAGGAATCTGAATGCCAACATCTGATAACATTGTAACATAGTGCAATTTCAGAAGTTTATTGTTGCAATTGGATGGTATTTTGCATACTATTTTAAAACAAAAGTAGGCAGTAAACTGTGTAACCTAGTAGTAATATGCTTGTATTCCTAGCAGGGTTATCATTATAAAATGTATGAAAATAGTTGCTTTTTGAGTTAAAGGGTTAGTTCACCCAAAAATTAAAATTATGTCATTAATTACTCACTCTCATGTCGTTCCACACCCGTAAATCATTCATTCATCTTCAGAACACAAATTAAGATATTTTTGATAAAATCCGATGGCTCAGTGAGGCCTCCATTGCCAGCAAGATAATTAACACTTTCAATGCTCAGAAAGCTACTAAAAATATATTTAAAACAGTTCATGTGACTACAGTGGTTCAACCTTAATGTTATGAAGCGACAAATACTTTTTGTGCGCCAAAAAAACAAAATAACAACTTTATGACAAAATCTAGTGATGGGCGAATCTTTTGTTTTGAATCAGTGGTTCGGAGCGTGTATCTGACTGCCAAAGTCACTTGAACCATTGAAGTTTCGAAACGTCTCGAAACACTTATGGCGTAACGAAGCTGCTTACTGAAATCACGTGACTTTGGCAGTATGATACACGCTCCGAACCACTGATTCAAAACAAAAGATTCGTAAAGCTTCGAAGCTTCATGAAGCAGTGTTTTGAAATCGCCCGTCACTAGATATTGTTGAATAAAGTCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCACACAAAAAGTATTCTCGTTGCTTCATAACATTGAGATTGAACCAGTGTAGTCACATGAACTGTTTTAAATATGTCTTTAGTACCTTTCTGGGCATTTGAAAGTGTTAATTATCTTGCTGGCAATGCAGGCCTCACTGAGCCATCGGATTTTATCAAAAATATCTTAATTTGTGTTCTGAAGATGAACGAAGGTCTTATGGGTGTGGAGCGACATGAGGGTCAGTAATTAATGACAGAATTTTAATTTTTGGGTGAACTAACCCTTTACGCAAAAGATGTTAAAAATCACAGTTAATATTGCTTTGTTTCTTCATTGATTTGATGCACTGCATTATGGAATACAGTATTCATTGATTACTTGAATATGACAAAATAGTAGGTCATCCAGGTATTCTTTGCATACAGAAAATATGCATGTATACTGTGCACAGTACATGCTGCAAAAATAGTAGTAGTGTAAATCCATTGTATGTTGTGTAAATGTCACTGTCATCAACTTAGTGTATACCTGCCTATTGATTTCCTTGTCTATGAAAACACCTGGTTATTTTTTTAGAAAGCTTTGATTGATGTATAGGGTTATCTGAGCTCATGACAGTAGCAGATGCATATGTTCAGGAATCAGGTGTTTTCCTGGGTGAAGCAGAGACATGGAAGTGAATCTGAAGTGACAGTTGTCATGTTACTGTGTCCAGGTCTGACTTGAGCTGCAGTCTGTCCCTACTGACGTGAGTTTGTGAAGGGAGGTGGGGTGTGTAATACAAAAAGCATTTAGTTGAGGAAAAAACATTCTGATCTTTAGCATCAGTGCCTTTTATTTCATGCGCCCAAGAAGTCAGTGGACAGCTATATTTATGTCAAACGTTTTTCAGCGTTGCTGTTATATCACTGTTTGATTAGGGAGTCCAGC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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU276242 True 6414 lncRNA 0.36 2 194141 200678

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000057_00187004_00188981 NA coding upstream 5098 186007 ~ 191434 (+)
CI01000057_00132905_00133478 NA coding upstream 60498 132905 ~ 133643 (+)
CI01000057_00047033_00083978 PAX7, PAX7B, PAX7A coding upstream 110163 47033 ~ 83978 (+)
CI01000057_00020196_00026430 NA coding upstream 167442 20196 ~ 26699 (+)
CI01000057_00220530_00241371 KCNAB2A, KCNAB2 coding downstream 18787 219465 ~ 242544 (+)
CI01000057_00335633_00339359 AKR7A3 coding downstream 133329 334007 ~ 339497 (+)
CI01000057_00346063_00377661 IFFO2, IFFO2B coding downstream 144642 345320 ~ 378400 (+)
CI01000057_00388747_00398161 ALDH4A1 coding downstream 187628 388306 ~ 398819 (+)
CI01000057_00407250_00407817 NA coding downstream 206492 407170 ~ 408216 (+)
G243422 NA non-coding upstream 32033 94117 ~ 162108 (+)
G243415 NA non-coding downstream 199513 400191 ~ 404669 (+)
G243477 NA non-coding downstream 220158 420836 ~ 421940 (+)
CI01000057_00485167_00494040 NA non-coding downstream 283501 484167 ~ 494565 (+)
G243434 NA non-coding downstream 296066 496744 ~ 497326 (+)
G243509 NA non-coding downstream 362134 562812 ~ 563039 (+)
CI01000057_00417827_00418207 NA other downstream 217061 417700 ~ 418655 (+)
G243557 NA other downstream 754165 954843 ~ 955195 (+)
G243558 NA other downstream 755385 956063 ~ 958371 (+)
CI01000057_02395285_02396439 NA other downstream 2193920 2394598 ~ 2396561 (+)
G243975 NA other downstream 2375775 2576453 ~ 2576852 (+)

Expression


Co-expression Network