G250227


Basic Information

Item Value
gene id G250227
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000058
NCBI id null
chromosome length 5213219
location 3839079 ~ 3851329 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU283986
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU283986 True 12104 lncRNA 0.35 3 3839079 3851329

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000058_03684461_03827727 CADPS, CADPSA coding downstream 11352 3684461 ~ 3827727 (-)
CI01000058_03668662_03671701 FEZF2 coding downstream 166894 3668546 ~ 3672185 (-)
CI01000058_03239666_03330001 CDH4 coding downstream 509078 3239666 ~ 3330003 (-)
CI01000058_03154548_03160071 NA coding downstream 679008 3154539 ~ 3160071 (-)
CI01000058_03136045_03137264 PRELP coding downstream 701815 3135699 ~ 3137264 (-)
CI01000058_03904018_03906800 THOC7 coding upstream 52568 3903897 ~ 3908108 (-)
CI01000058_03950901_03956376 PSMD6 coding upstream 99572 3950901 ~ 3956376 (-)
CI01000058_03977379_03991942 PRICKLE2, PRICKLE2B coding upstream 125535 3976864 ~ 3991942 (-)
CI01000058_04100253_04135812 ADAMTS9 coding upstream 248384 4099713 ~ 4136508 (-)
CI01000058_04178879_04179912 NA coding upstream 326958 4178287 ~ 4181797 (-)
G250231 NA non-coding downstream 147 3835057 ~ 3838932 (-)
G250268 NA non-coding downstream 165113 3673736 ~ 3673966 (-)
G250260 NA non-coding downstream 184503 3654062 ~ 3654576 (-)
G250259 NA non-coding downstream 185089 3653681 ~ 3653990 (-)
G250223 NA non-coding upstream 1113 3852442 ~ 3898562 (-)
G250395 NA non-coding upstream 316483 4167812 ~ 4168126 (-)
G250326 NA non-coding upstream 456828 4308157 ~ 4310100 (-)
G250409 NA non-coding upstream 485531 4336860 ~ 4337089 (-)
G250410 NA non-coding upstream 491181 4342510 ~ 4342853 (-)
G250230 NA other downstream 142368 3688643 ~ 3696711 (-)
CI01000058_02859435_02860658 FAM72A other downstream 977886 2858483 ~ 2861491 (-)
G247592 NA other downstream 3184130 646443 ~ 654949 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
eurasian perch (Perca fluviatilis) G132021 NA non-coding NC_053124.1 CM020921.1 8177069 ~ 8183351 (-)