G473441


Basic Information

Item Value
gene id G473441
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000330
NCBI id null
chromosome length 4651236
location 533307 ~ 542647 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU543344
TCTTAGTAGTTTTAAACAAGCTTTATTTTATGTATGGAAAATATAATTTCTAATTTATTACCTTAGATTTCAAAACACTGCTTCAGGAAGCTTCGGAGCGTAATGAATCTTGGGTCGAATCATGATTTGGATCGTGTGTCAAACCGCCAAACTGCTGAAATCACGTGACTTTGGCGCTCTGAACTGCTGATTCGACACAAAAGATTCATAAAGCTCCGAAGCTTCATGAAGCAGTGTTTTGAAATCGGCCATCACTATATAAGTCGTTATATTGTTTTTTTGGCGCACCAAAAATATTCTCGTCGCTTTATAATATTAATATTGAACCACTGTACTCACATGAACTGATTTAAATATGGTTTTAGTACATTAATGGATCTTGAGAGAGGAAACGTCATTGCTGGCTATGCAGGCCTCACTGAGCCATCGGATTTCAACAAAAATATCTTAATTTGCGTTCCGAAGATTAACAAAGGTCTTACGGGTGTGGAACGGCATGAGGGTGAGTAATAAATGACAGAATTTTCATTTTTGGGTGAACTAACCCTATAAATATGTGATTGACAATTTGTACATCATTTTTATGTACATCACAAATGACAAATCTTGTAGAAGTGTTTTGACGCTAGCTTTTTGTGACTTGTTTTTACTACTAAATTGTTTCGTAAAGTGGGACCGGTGTTGTTGCTAGTTGTCTGCAATCTAATTAAGTGCTTCTAGTTTAATGTTTTTCTCTCAGTTTGGCTTTATTGCTTTATTAAGCAGCAGATTTGATTTTTGAAGGCTTTGTTATTCGACTCTGTTGGTATCTGCAAAATATGCCCACAGTGACGAGTATATTTGTTTGATACTAACAGCCCAATCTCATTCTGTTGACTAATTAGGCAATTAGAAACTGTCAGTATGCAATGCTAGATTCATCTTTCCTGTGGCATTTCATTTTTGTCTTGTTTGTCAGACAAGCGTGTCACTGTAGTTATGAACTGTGCATAAATTGCAAAGGGATTCACTCTTTCCCACCAAAGGGGACAAAACTGACCTCTCTTCCTGTATTTGAGGGCTGCTCTCTTGGTCCCTGGGCTAGACTGTGGCCCCTGAGATTGCTTAAATGTCAAAGGTGCTGTGATGTTAACATTTTTTTAAGCCATGCAGACTGTTCCAATACAAACCCTATTCAACATACGACTCTGAAACTGATTTTCCTGGAAAGCAAACATTGTGAGTCAGCTTATATCTCCCAGATGACTAAAGGAAGTGGTTTGGTGATAAATCAGCCAGGATATGTTATCTAGAGGTGTCCTGACAGCAGTTTTCATAGCCTTACCAACACTTCATAAAAAAATATTAGACTAATCCACAGATGAAAATGGAGAATTTGTTTTTTAAAAAACCTACTTTGTTTATTACAATTTGTACCATTTTTTTTTGTATAATATTCAAGTTTTCATTTCAAGACCGTGGTCTTTTAAATAGCTTTATGATATGTCATTTTGGTGACTTAAAGTGCCCCATTATGCTTTTTTTGAATATTACCTTTTTTGTCTTCCAAAAGAAAGAACCGATTCTGAACTGCCTGAAACAAGTCGCCAATAATTCAAGTCTTATGGGGCGTTGACACCAGACTCGACTTGCGCGTGCTATTTGCAGGTAGTTGGACGCTTGAACATTTTGAGTTTACTCGCTTCATTCGTGCGTGAAATTCACTTCACAACAGATGCGAATTTGTGTCATGGGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGTCTCCCTCAGACTCTTCCACTTCTTTCTGCACACTTCCTCTGAATAAACACATCAACTCGTCAGCGGGAAAGTAGTTGTAAAATATGGCGAATAAGCTCAATTTACCGGCTTTAGCTATCTTGTAGTCTCAATATGTATATATATATATATATATAGCTCAAATTAAGTAAAGAACATTTTTTACAACTTACCAGATTGTCTGACCTCCTCACTTACTTCCTTCCTTCCAAGCAAGATCCTTTTTATTCCTGTTTCTATAAAAGTACGAAGATGTATCATACAGCTCCAGGTATCCACATGCGGCGATGATGATTTTGTCCTCCATTGTTGTTTCGGATTTCTGCCTCCGCTCGCTACGTCGTAATCACGTCACTACTAGAGCAAGCTCCTGATTGGTTAACGCGGCACGAATATTCGCCAAAGTTCAGATTTTTCAACTCGCGTGAATCACGCGTTACGCATGTCAAAAGCCCGAAACGCTCAATTCGCGCCGCATCATTCACGCGAATTGCGTCATTCGCGCCGCAGGATGTCTATCGCGTCTTTGCATTGAATTAATATGTAAATCACTCGCGCTTAACGCTTCATTTGCGCCTGGTGTGAACGCACCATTAGTTTCTACACAAACTTATGTAGGTTTGTAACAAATTTGCATAATGCCCACCATGGTCTTCATTGGCTGCCGGCGAACAACCCTCAAACACTGTAGTTGTAGCTGAGGCCTGGATGAGTTTGGGCCATCTGACCAATCAGAGCAGAGTCAACCAATCACAACAGACTGTTCTATCTGACCAATCAAAGCAGCCTTCCTCTTCAATTGCCTTCAATCACACGGTAAGTCACTCTGAAAAGCCACTTGCTTTCCACTTTGGGACATGGTGTAAACTGATATTTTTGAGCATTGGATGCCAGGGAGGAAAATTGTGCCTTTTATTATAATCTGCTTCCTAAGGGCAGTTTGGGTAGAACTGTTATACAGTACCTGCAACCAGTGTTTTAGTGGTTAGGGTTCATTAATTGAAGAAAATTTCCTGTTGCTTCATCAGAGCTGTTGGTTTTGAGATGTTATTGTATTTGATTGACAGTTTGGTGGGAATGGCCTGCTGAATCAGAGCTGTAATCTGCAAACCTTCAGTTGGTTTTTGGATTCTGTGAATTTCAGTTGCCCTCATTACTAAGTAATGAGTGTTTAAATGCTGACACTGGTAGTCTCAGTCTTCCTATGATAAATCAACAGGATGTCAAAATGATTTTTATCATATTGATCTGAATCAGTTTTTTTTTGTTTGTTTTGTTTTAAAGATCTCATTACCTAAATCTCATTCTCATAACTGTAATGTAAAACAAAATAGACATATTATTTGAATTTTAAAGTATACATTAATACTGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTTAAATTTTATACTAGAAGTAAAAGTTCTTATAGTAGAAGTTAAATTTATTTTGAAATGTCAGACAGACTACTACTTTAGGGGTAGTTTTGGGGATAGTACCTAGTTATAACCTAGATTGTAGTTACTATAAGCACATAGGGTAACACACTATAGTATAGGGAACATGTATTCACTATTAACTACGACTTTTCCCTCAATAAACTAATTTACTGCTATTAATAGATAGTAAGGTAGTTGTTAAGTTTAGGTATTGGGTAGGATTAAGAATGTAGAATAAGGTCATGCCGAATAAGGCATTAATATGTGCTTAATAATTACTAATAAACAGCCAATATTCTAGTAATATTCATGCTAATAAGCAACTTAAAAGACCCTAAAATAAAGTGTTACCGCACATAGTATGTACATGCAGAGTAGGACTGTAAAATAAGGTGCTACCGAATATTTTATTATATAGTCTCAAGATAAGAATTTGTCTTTTAGAAACTTGTTGGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATCATCAAGATTTATTTTTCAATGTTGTAAATTTTCATTTTCATTATATTTTCACATCAGCAACACAATTATTAATATTAATGTATAAATATATCGGCGATACAGTTAAAATTTTGTTAGACTGGAATGAGGTTTTTCCCAGTTTTTTCAGCATTTAAATACGGATGTACAAAATGATGGGTTTTTTTTTCTGTTGAATTTGATAGCGTGCGTGTGTGTGTTTATGCACAGTGTTGTTCACACCAAGATTTTATTTTTCAAATCGATGAAATTAGTTTTTTCAGACAAATACAAAGTTCTGTTATGAAACTCTAGATGGCACAGGCTAACAGGTCCTTTAACTCAACCTGCTCGTAATCACATCATTATCTATAGGGCACAGCTGATTGGTCCCTGCTGTATCAGTAGCCAATGAGTTTGCTGCTCAACCTTCAAAATACTTGTGTAGCATTTGCCTTAGCAGTGCTGTGCACTTCAGAAACCCTCCATCTTCCCCAGCTCCACCTGTATAGATCTGCTATGGGTAATTCATGTACGCTATATTGTACAGCAGCAGCATGTCTTACTTGCTCACAGCAGCGTGTCGTGTATGTATTGGCAGTAACAAGTCCCATACTTGCTCTGCAGCAGCAGTGTAGCAGATCTATTCCGCCAAGACCAAACATATCAACATTGTCATACCCATTATCATGCCAAACACTCTGAGAGTTGTCATGACAGAAATATAAATAGTTTCTATAAAATATACATTTCTTCGTAAAACTACAATTATAATCTAAAATTTAAGATATATGTAGCAAGATTTGTGTTCAGAGAAGGAGGTGGGAACCGGCGAACGTTCAACTTTAATCCAAAAATAAACAAACAACAAAAAATGAAAGTAAAATGGCAGCCCCTCACGGACGACTGCCGCATATAAACATAATAAAACACCCAACATCTCTCGTCCTTCACTGTAGTCACTCCTCCTTTTATCCTTCCGGATGGTTGTTAGGGTGTTGCTAGCTGGTTACTAGGGAGTTATGGGTGGGTGGTTGCTAAGATGGCACCTCCGTGACACTCGAGACCGGTGTGGTGCTCCGTTCCCACAGCTTTCGGCCCCACCCTGCTTGCCACATACCCCCATCACACTTTGCAGGCCGGGGGCAGCCACGAGATTGCCCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAGCAAAAAGCAATGGTAGATAAATGCTGTCCTTCCTTAAAGATCCGACTCTCTTTTCTCATCCGAGATTAACAGCACCCATTAAGTAACGCTCAGCACTTTTGTCCCCTGTCTGTTGTAATCTTGGTGGATGGCTGCTGTTAAATGTAATTAGTTTTGGCTGCTAATAATTGAATGTCTCTCAACAAGGGAGTCACTGACTCATGGCCACAGAAAGCTTGTTTTAGTGGAAGGATCACTCACTTTCTCAAACTAAATCTGCTGTATATGCTGAAGCTTTAAATTCGCTAAGTATATCCAGGAGCTTGAATCTCCCACATAAGGGAATGCTGGGGGAAAGTTGTATAGCCCGAGGAAGAATTCTTCAGTTTAAAGTTTTCAGTTTTAAGAGATGAACGGGTGAAGAGGTTGAACAGTCTAGACTACAGCCCTGAGGTGGATAATCAATTGATGATCCTGAACTTGGAGCTTTCAGGTTTACAGAATAGATTTTCAGTTTTTTTTAATATATTATGATAGCAGTACTCTTACTCTTAAACAAACCACAGAACTGTTCTGAGATGTTGCAACTTTCAGCCTTATTTTCCCGTAATCTTGTTCACTGAGTTCATTGACTTTGCCCTTGAGATATGCAGCGACCTTCTTTGGAGGACAATAAAAGCATCATCCATTTATGAACACTCCGCTGTCATTCATCAGCTCACAATGGGACTCAAAAGATGCTTCGCATTTATTTTGATCCCATTATGTGGCCTGATGGTAAAAGAGAGGTTTTTATATTTCTGAATGGGATTTTCTGTTTTACAGCCCTTGGAATAGGTTCTTAAAGTTCACCGTTTTTAGCTTTTGTTTACATTGGTGAAATGGGAGGCTTATTGAAAATGATTTAATGGGTTATAGCTTGAGATTTCATTTCACTGGGACACAGCACAAATAGATGGCAATAATAATAGTGCTCAAATGAATTTGGATGGAGATGATGGTTGATATTGGTCTTATTTGTCGAGATGAAATCAATGTTTGGCGACGGGAGTAAAAGAAATGAGGTTTTCATTGGGAATGCATTCTAAAAGATTCAATTTAATTGCAGAGTAGAGGTGAATGAGCTGAGGAAATAGAAAACTCAATAATGGTGAATATGTTCTAACTGGAGACGTGCTCAAGTACCTTGAGAATTCAGAAGTGACAGCAGGGATTGATCATAAAAACACAATAATTGTGTGACATTGCACCAGCATAATAGTAAGAGATTTACTACCCTCAATAGTATATACTGTATTTGCTCTGAATTTTTTTCTTCAGTCACTGTTGTCGCAAAGTAAGTTTTTAATGCACAAAGCAATATTTACCTACAGATATTATACTAAAATGTTTTAATACTTGAAAAATTCCACATGAAGTCTTCTGGGAAAATTTTGATGACGCAAACTTTTGTCTGCCACATCAAAGATGTGGTGCAACCAATGTACTGTAACATGCAAAAAAACAAAAACAAACAAAAGATACAGGAAATCAATCAATCAATCAATCAAGCAGTTGTTTTTGTGACAAGGAAAGGTTAGTTTAGGTAGAATGTCATGTGGTGCAATTCCCTGAAAACATAATATTTATGAGCTATGTATTCATTGTATTTGTAAAAAATACTTTTTACCTTGAAAAACAGATTTAAAGACATTTTTGGAAAAAAAAAATCTATTCAAGGTGTTTGGAAATAGGTTATTACTTTTTACTTGGTGGTTACACCACATGACATTTTTACAGTCATTCCTTTGAAACTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACATTATGAAACCAACATAAATACAAAGAATACATTTTAAGAATACTTTTTTTATTTTATTTTATTTTTTTCTTACTGCCATTAACCCAGTTAGAATAGACCCTTTTAGTGCCAACGTCACAATTACGGCACCGCATTAACTGGAGGCAAAACAAAGGGAAAACTGGAGGCGGCCGATACAAACCAGCACAGAATCGTGGCTACATAAGGAGCTTAACGTCATATTGTTGTGTTGTTGAGTGTCAGAATCACTGGAGTACAGTCTCCTTTTTGAAATTTTATCGCATACCTGCTGCCATTGCCAGACAGCTTAAACGCAATAAAACGAGCGGACTGGACAGAAACGATCATGAAAAATGCTTAAATGATCAGTTAAAGGATTGGTTCACTTCAGAATTAAAATTTCCTGATAATTTACTCACCCCCATGTCATCCAAGATTTTAATGTCTTTCCTTCTTCAGTCGAAAAGAAATTAAGGTTTTTGAGGAAAACATTCCACGATTTTTCTCCATATAGTGGACTTAAAAAAAAAAACAGTTGAGAACCACCAATCTATAGAGATATGCACTGAAACATTGTGTATATCTCCTCATCATGTTGTCTTTTATAAACATCTTCAGGCAGAGTTGTTTGGCTCAGGTTGTTGTTTTGTTGTTGTTTGTGTGATCCGTTTGCCAGTATGAATACAAAGTGTTTTTGTCCCCTGTGGCTAAACCACGGTTTTGAGCAGTAACACTTATTTTAGTGCCTGACCTTAGCAAGCATTTGTTATTTTCCTTCCTCAGATGCACAGCTCGGTCTCACCACCTGCTCACATCCCACACAATAAAATTAGCATTTGCACACTGAGCTTTACAACATTTGCTATAGTTCAGTGTACTGAAGTTTGCCCCCCTTACACCGTGTCTACACCAGACGCGACCGTTGTCGCTCGCGTCACAACAGCTAAAAGCTGTTTACACTGGACGCAACAAAGCACCCATTGCCAAGCATTTGTCCTTCGTTTCAGTACTTCATAAATAGAATCAGTTTACTGTCAGAGTTTCGTGTCTAATTAATGTATTAATGTTTAATATTCTAATTGACAGCATAATTAAAGAAAAAATTATTCTGATTCGAAGCGGAATATTTTGTGCCGGACTGCTTCACAAACAAGGGTCAATTCAACGTTGGATTAAAAACGATTAAAGATTAATTAAATTAAAGATTAACATGATGGCACATGCTAGTCGATGAGTTGAATCAACTCCACAGCAACTACATAAATTTACTAACCGTTCAGAAATGTCCAGTTTCATTCTAAAAGTTGTAACTTCTTCCTGAGTCTCTCCATCAGTGTCCGACTCCGGTTTGAACAATGTAAGGCTGAACACCGTTACTGACAATCATCATTTTGGCTGCGTGAGATTCTCCGGCTTTGTTGTTGTTGAGCAACTGAAGCACAAGCTATTAAAGCTCCACCCTCTTCTAGAAAGCGGGCCGGGAGCAGCAGCTCATTTGCATTTAAAGGACACACACAAAATCGGCGTGTTTTTGCTCACACCCAAATAGGGGCAAATTTGACAAGCTATAATAAATGATCTGTGGGGTATTTTGAGCTGAAACTTCACAGACACATTCTGGGGACACCAGAGACTTATATTACATCTTGTAAAATGGGCATTATAGGTTCCCTTCAAGTTATTGAACTGATAAAATCATCAGAGCAGTGCTGACAACACTTTTCTGTGCGATTGTGTGTCCGTACTGTATGTGTGTGTGTTTGAGGGAGCGGGAGATGTGATTTCCGTACATAATAAAACATGATATTGTTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGGAAAAAATTTGTCATTTTCATCCTATTGTTTACCATATTTATTTGCTTGGTCGGTGTCGTTACGGGTAGGCATGTGACGGTATCAAATTTTCATGTTGTGATTAATTGCTGAAGCTTTTATCACGGTATACGGTATTATCACGATATTGAAATAAGTTGTAAAAAAAAGTGTTGTCATAGTATAACAGGTTTAAAAACTCGACAGACAAGACAGAGCAGGTTACTTGCGATATGAAACAAACTCAAATTTCAAAATTTCAAATATTGTAATTTTTAAAAAAATTTAAACAATAAATACCATTTTATGGCTCTTTCATGTGTCGTGACAGATCGCTGTAGCGCCTCAATTCAAGCGCCTCGTGAACAGATCATCTCTTCCTACTAGTTCATTTATAGCATCAAATAAACGTGAATGAACATCAGAAAGAATGTTGTTGTCAACCAATCAAATTCAAGCATTCAACAGCACCGTAGTATAAGTAATATTGCATCATTGAATTTACTGCACTGTCATTGGATGAGAATAAAAAATTTTAACTGAATTGAGTTGGATGATGACACTATTGTCTTCTGTAGACATGCTTTATAACTGAATCAACTCATTCAAATTTTGCTATATCGACACGGTTATTGAACTGAATTGAATCAATATTGAACTGACTCGAGCTGAATAACAACACTATTGTGTTCTGTAGAGCTGCTTATAGCTGAATTGTATTTCATTTAAAAATTTATGGACTTCACACAGTTATTAACTGACTTGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU543344 True 9320 lncRNA 0.37 2 533307 542647

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000330_00483566_00485212 MGC80058, TMEM86A, TMEM86A.L coding upstream 46877 483566 ~ 486430 (+)
CI01000330_00432956_00445829 NA coding upstream 86716 432956 ~ 446591 (+)
CI01000330_00346321_00365907 NA coding upstream 167125 346260 ~ 366182 (+)
CI01000330_00303555_00322321 NA coding upstream 210719 303226 ~ 322588 (+)
CI01000330_00289880_00292698 NA coding upstream 240234 288119 ~ 293073 (+)
CI01000330_00698127_00755584 ABTB2B, ABTB2 coding downstream 155480 698127 ~ 755584 (+)
CI01000330_01043094_01051071 LDH-A, LDHA coding downstream 500447 1043094 ~ 1051071 (+)
CI01000330_01112605_01119220 NA coding downstream 569958 1112605 ~ 1120106 (+)
CI01000330_01162093_01168098 RASSF7A coding downstream 619446 1162093 ~ 1168325 (+)
CI01000330_01180674_01200580 PHRF1 coding downstream 638027 1180674 ~ 1200921 (+)
G473443 NA non-coding upstream 1704 501369 ~ 531603 (+)
G473495 NA non-coding upstream 154600 363033 ~ 378707 (+)
G473444 NA non-coding upstream 162104 334908 ~ 371203 (+)
CI01000330_00228943_00261563 MRPL23 non-coding upstream 263097 226619 ~ 261658 (+)
G473357 NA non-coding upstream 387560 135693 ~ 145747 (+)
G473440 NA non-coding downstream 95349 637996 ~ 649459 (+)
G473545 NA non-coding downstream 216220 758867 ~ 759225 (+)
G473546 NA non-coding downstream 216997 759644 ~ 759968 (+)
G473662 NA non-coding downstream 519113 1061760 ~ 1067201 (+)
G473648 NA non-coding downstream 671043 1213690 ~ 1217964 (+)
CI01000330_02046876_02054740 NA other downstream 1504134 2046781 ~ 2054740 (+)
G474750 NA other downstream 1851510 2394157 ~ 2399678 (+)
G474771 NA other downstream 1957455 2500102 ~ 2510170 (+)
G474777 NA other downstream 1968809 2511456 ~ 2514764 (+)
G474807 NA other downstream 2052399 2595046 ~ 2598105 (+)

Expression


Co-expression Network