XLOC_013604 (treh)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_013604
gene name treh
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 43846936 ~ 43884044 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00026743
TCAGATCTACTGCACTGGAGAAGTCCTCCGACAGGTCCAGATGGCTAAACTGTTTGATGATGACAAGTACTTTGTAGATATGACGTTAACTACAGCTCCCGGTGAGTCAAACATGTTTGGTTTGTTCTGATACTCGTCAGAAGCCCATCAGTGATTTTTTCCCCCCCTCTTCCCTTTCCTTGTATAGAGGTTGTGTTGGAGGCCTTTACCAATCTGAGTTCAGTATTCCCAGACAAGGCCGTACCATCTCTTGAGTTAAAGAAATTCCTGCAAACATACTTTAAGGAGCCGGGCAATGAGTTTGAGCGGTGGACTCCTACAGACTGGCATTCAAAGCCAAACTTTTTATCCAAAGTGTCTGACTCAAAATATCGCAGCTGGGCTGAAGAGCTCCACAGTTTGTGGAAGTCGCTTGGTCGAAAGATCCGTGATGATGTGAGAGACCACCCAGAGCTGTACTCGCAGATTTACACCCCACACCCAGTGGTTGTGCCCGGGGGCCGCTTTAGGGAACTTTATTACTGGGACTCCTATTGGGTAATTAATGGTCTCCTTTTATCTGAGATGACTGAGACAGCCAGAGGAATGATTCTCAACTTTGTGTACTTGGTAGAAAGATATGGCATTGTCCCAAATGGTGGTCGTGTTTATTATGAGCGGCGCAGTCAGCCTCCATTTCTTCCTCTAATGGTGGAACGCTTCTACGAGGCCACCGGAGACAAAGACTTCCTCAGGCAGGTTTTGCCAGCACTGGAAAGAGAGTACAGCTTTTGGATGCAGAATCGGTCGGTTGATGTGATGACGAGTGAACTGACTCACATCCTGAATCGATATAATGTGCCGGTGGACCATCCCAGGCCTGAGTCCTACAGTGACGATGTAGAGCTGGCTGAGGGTCTGTCAACAGAGGCTCAGAAGCAGCTCTGGATGGACTTGACGTCTGGTGCGGAGTCCGGATGGGATTTCTCCTCTCGCTGGTTTATTGACGACACGGGCAGAAACAACGGCAGCCTCAGAGACACACAGACGAGCTCCATCCTGCCTGCTGACCTCAATGCCATCATGTGCCGCAACGAGCGTCTGCTGGCCTCCTTTCACAGGAGTCTGGGTAATGAAGAGAAGGCCCTGAAATACGAGAAGGCTCTCTCTGCTAGAATTAAAGCTGTGGAGAGTCTGCTGTGGGATGCAGAGAAAGGGGCCTGGTTTGATTACAACCTGGTAAACAAGACCCGTCACCTGTCCTTCTACCCGTCTAACCTGGCACCTCTGTGGGCACAGTGTTACTCTAAGTCGGAGATGAGCGATCAGGCTGTCCAGTACCTGAGGGATAGCGGAGGTCTGGATTATCCTAATGGCATTCCCACCTCTCTCAGTGACAGTGGTCAGCAGTGGGATATGCCCAACGCCTGGCCTCCACTCCAGCACATCATCATTGAAGGTCTCTCCGGGCTCCATTCAGCCCACGCTCAAGAGCTCGCCTTCAGCTTGGCCCAGCGGTGGATTCAGACCAACTGGCGGGCATTCATCAAATATGAAGCCATGTTTGAGAAGTACGATGTCAGCGGTGATGGAAAGCCCGGAGGAGGTGGCGAGTATGAAGTTCAGTTGGGATTTGGATGGACCAATGGGGTTGCTCTGCAGCTGTTGGATCAGTATGGTGATAGGCTGAGCTCTGGAGGGCGTGTCCCAGTGTGTTCCAGCGCTCTAATTGGACTGGTCTATGCCGTCTTAAAATCTCTATTCTGATCCTCATCTGTGATATGTCTGGAGGCTGAACAAGAAAAACACATGAGAAAATCCAGCATCACTATTCAACAGTTGAAGCTGAGTTCAATCAAtgtctttctgttttattttcaagCCTTTTGATCTCCTGGTTTGCCATTTATTTGTAGAATCAATTCACCTTTGTCTGAATGTACCTCAAGGGCCAGTCTTACATATTTCAACATTAAACTGTACTCG
>TCONS_00026744
GGCACACAGGTGTGTAATTAAGGCGAGTAGAACCTACGTCCCTTTAAGTTTTGTGTATTCCAGTCTTAGGTAGAATTTATTGTTCGTGGCAGTGACTGAGCGTTAAAAAGCAACATTGAAAACCATCCTATGTGGTTCGTGACAAAGTGTAACTGCCTGAGTCCTACAGTGACGATGTAGAGCTGGCTGAGGGTCTGTCAACAGAGGCTCAGAAGCAGCTCTGGATGGACTTGACGTCTGGTGCGGAGTCCGGATGGGATTTCTCCTCTCGCTGGTTTATTGACGACACGGGCAGAAACAACGGCAGCCTCAGAGACACACAGACGAGCTCCATCCTGCCTGCTGACCTCAATGCCATCATGTGCCGCAACGAGCGTCTGCTGGCCTCCTTTCACAGGAGTCTGGGTAATGAAGAGAAGGCCCTGAAATACGAGAAGGCTCTCTCTGCTAGAATTAAAGCTGTGGAGAGTCTGCTGTGGGATGCAGAGAAAGGGGCCTGGTTTGATTACAACCTGGTAAACAAGACCCGTCACCTGTCCTTCTACCCGTCTAACCTGGCACCTCTGTGGGCACAGTGTTACTCTAAGTCGGAGATGAGCGATCAGGCTGTCCAGTACCTGAGGGATAGCGGAGGTCTGGATTATCCTAATGGCATTCCCACCTCTCTCAGTGACAGTGGTCAGCAGTGGGATATGCCCAACGCCTGGCCTCCACTCCAGCACATCATCATTGAAGGTCTCTCCGGGCTCCATTCAGCCCACGCTCAAGAGCTCGCCTTCAGCTTGGCCCAGCGGTGGATTCAGACCAACTGGCGGGCATTCATCAAATATGAAGCCATGTTTGAGAAGTACGATGTCAGCGGTGATGGAAAGCCCGGAGGAGGTGGCGAGTATGAAGTTCAGTTGGGATTTGGATGGACCAATGGGGTTGCTCTGCAGCTGTTGGATCAGTATGGTGATAGGCTGAGCTCTGGAGGGCGTGTCCCAGTGTGTTCCAGCGCTCTAATTGGACTGGTCTATGCCGTCTTAAAATCTCTATTCTGATCCTCATCTGTGATATGTCTG
>TCONS_00026745
ATTCAACTCACTAAGATGCACTGCTTAATTGTCATTTCGTCGACCCTCCTCTTCTCATCCGGCGATGCACTCCTGGCTCCTTGTGACAGTCAGATCTACTGCACTGGAGAAGTCCTCCGACAGGTCCAGATGGCTAAACTGTTTGATGATGACAAGTACTTTGTAGATATGACGTTAACTACAGCTCCCGAGGTTGTGTTGGAGGCCTTTACCAATCTGAGTTCAGTATTCCCAGACAAGGCCGTACCATCTCTTGAGTTAAAGAAATTCCTGCAAACATACTTTAAGGAGCCGGGCAATGAGTTTGAGCGGTGGACTCCTACAGACTGGCATTCAAAGCCAAACTTTTTATCCAAAGTGTCTGACTCAAAATATCGCAGCTGGGCTGAAGAGCTCCACAGTTTGTGGAAGTCGCTTGGTCGAAAGATCCGTGATGATGTGAGAGACCACCCAGAGCTGTACTCGCAGATTTACACCCCACACCCAGTGGTTGTGCCCGGGGGCCGCTTTAGGGAACTTTATTACTGGGACTCCTATTGGGTAATTAATGGTCTCCTTTTATCTGAGATGACTGAGACAGCCAGAGGAATGATTCTCAACTTTGTGTACTTGGTAGAAAGATATGGCATTGTCCCAAATGGTGGTCGTGTTTATTATGAGCGGCGCAGTCAGCCTCCATTTCTTCCTCTAATGGTGGAACGCTTCTACGAGGCCACCGGAGACAAAGACTTCCTCAGGCAGGTTTTGCCAGCACTGGAAAGAGAGTACAGCTTTTGGATGCAGAATCGGTCGGTTGATGTGATGACGAGTGAACTGACTCACATCCTGAATCGATATAATGTGCCGGTGGACCATCCCAGGCCTGAGTCCTACAGTGACGATGTAGAGCTGGCTGAGGGTCTGTCAACAGAGGCTCAGAAGCAGCTCTGGATGGACTTGACGTCTGGTGCGGAGTCCGGATGGGATTTCTCCTCTCGCTGGTTTATTGACGACACGGGCAGAAACAACGGCAGCCTCAGAGACACACAGACGAGCTCCATCCTGCCTGCTGACCTCAATGCCATCATGTGCCGCAACGAGCGTCTGCTGGCCTCCTTTCACAGGAGTCTGGGTAATGAAGAGAAGGCCCTGAAATACGAGAAGGCTCTCTCTGCTAGAATTAAAGCTGTGGAGAGTCTGCTGTGGGATGCAGAGAAAGGGGCCTGGTTTGATTACAACCTGGTAAACAAGACCCGTCACCTGTCCTTCTACCCGTCTAACCTGGCACCTCTGTGGGCACAGTGTTACTCTAAGTCGGAGATGAGCGATCAGGCTGTCCAGTACCTGAGGGATAGCGGAGGTCTGGATTATCCTAATGGCATTCCCACCTCTCTCAGTGACAGTGGTCAGCAGTGGGATATGCCCAACGCCTGGCCTCCACTCCAGCACATCATCATTGAAGGTCTCTCCGGGCTCCATTCAGCCCACGCTCAAGAGCTCGCCTTCAGCTTGGCCCAGCGGTGGATTCAGACCAACTGGCGGGCATTCATCAAATATGAAGCCATGTTTGAGAAGTACGATGTCAGCGGTGATGGAAAGCCCGGAGGAGGTGGCGAGTATGAAGTTCAGTTGGGATTTGGATGGACCAATGGGGTTGCTCTGCAGCTGTTGGATCAGTATGGTGATAGGCTGAGCTCTGGAGGGCGTGTCCCAGTGTGTTCCAGCGCTCTAATTGGACTGGTCTATGCCGTCTTAAAATCTCTATTCTGA
>TCONS_00026746
gtGGAAAACATTTGAAATCGCCCATGTTAACTAATTTGAGAGAAGGGAATGGACAGAACAATTGAAAAGACTAACACTGGCTTCCTGGCCCCTTGTCTGTGAAACTTTCCTTTTGCAGAGGAGAAATTCACTCATTAATGGAAGGATAATTGAAGCTAATCTTCCTGCTTATAGCATCTGTGACCTGTTGCTTGAGTGACATTCATATTGAGATGTTCCACAAGAGACTTTTATATTGAGGAACAAGGAACTGGTAAAAAAATTTtgcttgaacttttttttttttttttttttgcttttgtgcgCTTTGGACACTGAGAAAGCTGTGGGAAGGACGACttgcaaattaatttttttgcaaGACCATCAAGAGAAAGTATTATCTCCACTGTTGTTTGTCGCTCACTGTTTCAAGAGAGAATATTTAAGTCATGAGTACAGCCAGAATGGAGAACCCAGTGATTCTGGGACTGTCCAATCAGAACGGCCAAATGCGAGGTTCTGTGAAGCCAGCAGGGGGTCCCGGTGGAGGTGGAGGGGGGTCCCAAACAACACAGCCTGCCCAGGTCAAAGCCTCTAGCACAGTCAACAATGGCAACTCCCAGCCTGTACCCACAGCCAACACTATCATCAAGCCTGGAGATGACTGGAAGAAGAATCTAAAGCTTCCTCCAAAAGATTTGCGAATGAAAACATCAGATGTGACGGCGACCAAGGGAAATGAGTTTGAAGATTATTGCCTAAAACGAGAGCTGCTTATGGGCATCTTTGAAATGGGCTGGGAGAAACCATCACCTATACAGGAGGAGAGCATTCCCATTGCGTTGTCTGGGAGGGACATTCTGGCCCGAGCCAAGAACGGCACAGGAAAAAGTGGCGCCTACCTCATTCCCTTACTTGAACGCATAGACCTGAAGAAAGACAGCATACAAGCGGTGGTCATTGTGCCCACTAGAGAACTGGCTCTTCAAGTGAGCCAGATCTGTATCCAGGTCAGCAAACACATGGGCGGGGTCAAGGTCATGGCAACTACAGGTGGAACCAACCTTCGTGATGACATCATGAGACTTGACGAAACTGTGCACGTCGTCATCGCCACTCCAGGAAGAATTTTAGACCTCATCAAAAAGGGAGTGGCCAAAGTGGGTCAAGTGCAGATGATCGTGTTGGATGAGGCAGATAAGCTCTTGTCGCAGGATTTTGTACAGATGATGGAGGAGATTCTGAGCTCTTTGTCTAAACAAAGGCAAATTTTGCTGTACTCTGCCACATTCCCACTGAGTGTGCAAAAGTTCATGAACTCCCATCTCCAGAAGCCCTATGAGATAAACCTGATGGAGGAGCTGACCCTGAAGGGGGTTACTCAGTATTATGCCTATGTGACTGAAAGGCAGAAAGTCCATTGCCTTAATACTCTATTCTCTAGGCTCCAAATCAATCAGTCTATAATCTTCTGCAATTCGTCCCAGCGAGTGGAACTCCTGGCTAAAAAGATCTCACAGCTTGGGTACTCCTGTTTCTACATTCATGCCAAGATGAGGCAGgaACACAGAAACCGCGTGTTCCATGATTTCAGAAACGGCTTATGTCGAAATCTCGTCTGCACTGATCTCTTCACGAGAGGAATTGATATTCAAGCTGTGAATGTGGTGATCAACTTCGATTTTCCCAAACTCGGGGAGACGTACCTTCATCGCATTGGCAGATCTGGCCGATTTGGACACTTGGGTCTTGCCATTAACTTGATCACTTATGATGACCGCTTTAACCTGAAAGGTATTGAAGAACAGCTGGGTACTGAAATCAAGCCCATTCCCAGCAGTATTGACAAGAGTCTATATGTGGCCGAGTACCACAGTGAGAGCGGAGAGGAGGTTAAACTGTGAGCAGGAGAGATCACCAATCCTTTGTCCCCTATCCCACCCTTTTCGTTCCCTACTGTGTCTAGGGAATaggggactttttttttcttttttttcccccctcctTTCAACTATATCTTATTTCTGTCTTCCTCTACTCCCACCTCCCtctttttttcgttttctttttttctctcctgtCTTGTGCCACCACAAGGAATGTCGTGTCGATGGCCCAATATTCGGGAAGGACTCATGGCCCACTAAAGGACTGCTATACCAATATTTTCATCCTGAAGAATTCAGATCACTTGATGAGGAGGGAAAGAGGGGACATGAGGATTTATCAcccaaggaaaaaaaaacaattcatcgCCTTTAAGCACATCCACACCCCACAGTCTCTGTCCCTCTGCTCGTATTCATGTTTCTAGTCATTTGAAACAAGTGCCTTAACAGTCTAACTTGTTCAAAAAGTAATAacctgatgattttttttttctcctcctcattcaacatcattttttTACTACTCTGGCTTTTTGGTGTTGCTTGTCTGCCCCTACACGTTTGGCATCAGAAGAATAATTTAGCATTTGTCACCTGTAGTTTATTGGGGCAACAAAGAAAAAGATTGCGCAGTGGGAGAGAGGATGAGGCAGCAAATTGTGCCGTACTTTGACTATGTTGTGAAAAGAAGCCCCTTGGAGAACTGAGATGAAATCAGTGAGCATAATGACAATGATAGGGGCTGATCTTCTTGTGGCAAGCTTTCAAAAGTCCCACACGGCTCAAGGATtcacaaggatttttttttttttgttcccttCATCTGCTCATGGAACATGCCATGCCTCTAGAGACCCGTAACTCTTTCCCCCTCTGTCTTCAGCGGGCCAACACTAAGAGACTAGACCAGACTCAGACCAGCCTTTCTCATTGGCCATGAGGAATCTCTCTTTGAGATGAATGTGGATTTCTTTCTTTTACTCCTccctcattttcttttttctatccTCCCAATTTCATCCTGATTTCAGTGCAGTTTTGCATTCTTGGGTAGGCACTCTGTCCTAAATGTGCCATTTATACAGATCTGGCgcatttgtaaacattttgtaaatacttcatttattttttttaaatggattgtTTTAAAGCAAGCTAAAAAGGCTGGATGAACATTtgagaagaatgttggaaagatCTTTAAAATCCAGGATCCTGTCAGCACTGGATGGCACTTTTGTTTGCTTATTCCCCCTTTTCCATCCCCCTTCATGGGGAaataagtttaaagtttaaacctTTCCTGGTAATGCACCGCCAGTGTTTTGTTATCGTAAGAAATGAGTTCACACttgctttattctttattttaaaactCGAGACTCCGTTCAAAGGTTTTGAGTGTAATCCTCTGGTGGTTTCAGCAGGTGGTGCAATTGTTCAGATTTGCAGTTATTAACTCATCCGTTTTCCAGTGTTGACATGTTTCCTGACGTGGGTCGCTCAAATAAATGGCCTCATTTGCGCGTTGTGAAAACATGAGGCTTAATTGCTTTCCAGCCTTTTGCTTGTAACACTGACTTATGAGCACTCAGCGGGGTCCCTGAGCCTGGGTGACTCTAATCATAgagataatttaatattttcatcaTGTAATAGTGCTACTCGCTGCAGTGCAGCTCAAATTGGCAACGTGCAAAAATCTAGAATTTCTAAGCGAGATGTGTAGCTGTTACATGGGTCTGTGTTCACTGCCACCGGCACTAGGACATGACTTCAAACAGACCGTTAAGGGTGGGAGGATCGAAAGACTTGGTGGTTCCCAttggaaaaaggaaaaaaaaatggacaaaaatataCTCAACTGGATGCCAAGACTTGATGGACTGACATAATGTAGCGGCAGAGACATGCAGTGCATTGTGAGTcagcaggcttttttttttttgtaaaaagacCATGTTCTTAAGATGCTGCACAGACTTTACAGAAGAATCTAAATCTTTGCAGTGAGAGCTGCACTTAAGTTTGAACTTTAGTTCAAGGGTTGGGCAATAATAAAGGCTGCACACGTGCTTGGAGCACTTCCTCGGTTAGGCTAGAGGTGTAAAGACCATAAGGgagtttaatctttattttatttaatttttttgaggaAGTATTGTGGCAGGGATGAGGGTATTTAACATGGGATGTGGGTATTACATGGGTGCTGATAaccaaatgatttattttttttattttttatttttttgcagcagaATATTCATCCCCATCACCCCAAACACTAATAGCCTTTAAAGATTTCTGAGTGATTTATTTTCCCCCTCTCTGGGGATTGAAATGGGCTTGCTTGAGACACTTTAGCCCTTCTGCTGCTTTGTCACTAAGTTATGCATTTGACCCGTGATGTTTTGAGGGTGTTTCCTTTTATATGGGGTGGGTTAAGCTTGGGAGGGATACAATTTATGTCTTTTTATGATTATTAGCACAATTTGCGTTAAATTCTTTACGTTGGACTTCAACATCACCAACGTCCCCATTAGATAGTCAATTACAGGTGagatgtttaattaatttttttttttttttttggattagtaTTGTCGACTGTGAAGGCTATTGATATAATTAAGGACGTTCGTACTAACCGTGTGGTTGGTTACCCAAATATTGGCCCAGATTATTATTTATCACAATCCTCAAAATGCAGCCTTTTCCACAGTGGCCATGCTTTAATCCGGCCTCATATTCTCTTCTCTATTGCGTTCCCCTCTGGTGTGCACAGATTGTTCGCCCAACTAATCCGCTTTGGTTTCTTCTGGGGGCTTTTTAAACCGATCTGCTCTAGAGAGGAGAATGCGAGTTTCTGGGCGTTTGGCAGCAGCCCAGTGTTTTTCAGTAACCACTTGCTGTGGAAGTCACAGTTCTTTCTTGTGATGCTGTAAATCAGCATGTGATTGGATGTGCTGTGGTCTTTGCCATGGTGGTTGgggttttgatttgttttattttcttttatttttttattttaagctttgGTTTTCCCTTTCATTTTGAAGAATAGAGTTGGAGAACATCTCACCTGTTTAAGAGTTGTTTTCTGAAGCTTAAGCTAATTACATAATGGAAATCCACTCATTCTTcagtgtattattttatttatttttatttaatttttgtattggGTGGgtgggaagtttttttttttttttttttttttttggctgcccTGATGTATCGTTCTAATTCCAGCACTTTCCATCTTTGTGTTCAGTGTTGGGAGTATTTGGATACATCAGTTTGGGTTGGTGGGTGGGAGGGATGTGGTAAATTGGcttaaaagaaaaattaagatGAACAATTAGGAGTTCAGGGTAAGGAATTCAATCTTTAACCTTTGCCCTCAAATTTGAgatgtttttctttctgtttggaTACTGCAAATGAACAACCAAATTCAAGAGAAATCCAAAGTATTGTTTTGTTTCTCCTTTTCAATTTGGACCGTTTCAATTGGCTTTTGTTTCTCAGTGATGCTGCATTTTTAAAGAGTTGAGATGTGTGAATGCAATGGTTAACATCTGTCATGGTTTTTGTTTGATAATAAAGCTCACTGAAGTTCCATGTATGTGTTTAAGGTgtctttattttgtaaaaaataaatgtttgaatttaGTGTTAAGTATACACATGTAAAACTACTGCATATGGAGGATCCGTGTCCTGCAGAATTTGGGATTAAGCAGATCCAGCACCTTTTCTGGATCACCCAGAGTGGTAATCACTGATTTTATACCCAGTGGTTGTGCCCGGGGGCTGCTTTAGGGCACTCTATAATGGGTTTTTTTAATCTTTGTATTTGTGAAATGGTTGTTAGACCTGCAGTTTTTTTCCTAGTGAATAAGACTTTGCTTTGTTGGAGCCAAAAAGGACACTTGCCCTCCATAATTGAGTTTAGACACTTGGAAGTTTATTGACAATATGAAATGCTTGTTTTATTCATGCAGAAACCACTTCTGTTGTACCTTGTCTTTGTATGGTGTAGTAAAGGCTACAGTAATGTACTTGCTCTAGACTTCAGCATTGAATGTCAAAGTAAACATTCCCCTTATGTAACATTTTAATGCTGCCACTTCCAGCAATCTGCATACTGATAGGCTTACGAGCCATTGAACATGATTCATTGGTGTAGTGCAGCTGACCTCTAACCCTCCTATCATTGATAAAAAGCTCAAGCTTTAAATCTCTGGCGATAGTTTACTGACTTCATTACTACTATAATTCAACTCACTAAGATGCACTGCTTAATTGTCATTTCGTCGACCCTCCTCTTCTCATCCGGCGATGCACTCCTGGCTCCTTGTGACAGGTTAGTTCCCATAACCAACCTTCATGGTCAAGATTTCATTATGCTTCTCTAAATTAGCCAATGAAATGGCACCATTAAAACATTGAGGTTGTTAATAGTTCCCACTAAACACCTTTTGTGAGTCTCTGACATGTCTAATGACTTCTGCATTTCATTGACCTTTAAAGATGGTCCTCAATGTGTTATAAAAGACTTCAAGAGCCACCAGATGGCATTCTCATTATGCCTGAACTTTGAGTCTGTGATAAAGCAGGTGGAGTGTTGAATGTTGCGAAGCTGAGCTTTGAACCTTCATCAAAGAACCGTAGTAGAGAGAGTGTTATTGATCTTGGTTTTATGAGCTTAACCTGTGAGTGCCAGACAAGAAGTGGGCAGACTAACAAGCTACCCTGTTACTCTGCGCATCAGCTGTCTGACATGTTTTTGTTGCCACCAGTCAGATCTACTGCACTGGAGAAGTCCTCCGACAGGTCCAGATGGCTAAACTGTTTGATGATGACAAGTACTTTGTAGATATGACGTTAACTACAGCTCCCG
>TCONS_00026747
TTTAAAGATGACTGGAAGCCATCTTACACACTCGCTTTACACCCCGAAATATGTCACAACTCTACACCTATaattcacaaacacaaacacactgaaagaTATTCTCTGCCACGTTTGgtGGAAAACATTTGAAATCGCCCATGTTAACTAATTTGAGAGAAGGGAATGGACAGAACAATTGAAAAGACTAACACTGGCTTCCTGGCCCCTTGTCTGTGAAACTTTCCTTTTGCAGAGGAGAAATTCACTCATTAATGGAAGGATAATTGAAGCTAATCTTCCTGCTTATAGCATCTGTGACCTGTTGCTTGAGTGACATTCATATTGAGATGTTCCACAAGAGACTTTTATATTGAGGAACAAGGAACTGGTAAAAAAATTTtgcttgaacttttttttttttttttttttgcttttgtgcgCTTTGGACACTGAGAAAGCTGTGGGAAGGACGACttgcaaattaatttttttgcaaGACCATCAAGAGAAAGTATTATCTCCACTGTTGTTTGTCGCTCACTGTTTCAAGAGAGAATATTTAAGTCATGAGTACAGCCAGAATGGAGAACCCAGTGATTCTGGGACTGTCCAATCAGAACGGCCAAATGCGAGGTTCTGTGAAGCCAGCAGGGGGTCCCGGTGGAGGTGGAGGGGGGTCCCAAACAACACAGCCTGCCCAGGTCAAAGCCTCTAGCACAGTCAACAATGGCAACTCCCAGCCTGTACCCACAGCCAACACTATCATCAAGCCTGGAGATGACTGGAAGAAGAATCTAAAGCTTCCTCCAAAAGATTTGCGAATGAAAACATCAGATGTGACGGCGACCAAGGGAAATGAGTTTGAAGATTATTGCCTAAAACGAGAGCTGCTTATGGGCATCTTTGAAATGGGCTGGGAGAAACCATCACCTATACAGGAGGAGAGCATTCCCATTGCGTTGTCTGGGAGGGACATTCTGGCCCGAGCCAAGAACGGCACAGGAAAAAGTGGCGCCTACCTCATTCCCTTACTTGAACGCATAGACCTGAAGAAAGACAGCATACAAGCGGTGGTCATTGTGCCCACTAGAGAACTGGCTCTTCAAGTGAGCCAGATCTGTATCCAGGTCAGCAAACACATGGGCGGGGTCAAGGTCATGGCAACTACAGGTGGAACCAACCTTCGTGATGACATCATGAGACTTGACGAAACTGTGCACGTCGTCATCGCCACTCCAGGAAGAATTTTAGACCTCATCAAAAAGGGAGTGGCCAAAGTGGGTCAAGTGCAGATGATCGTGTTGGATGAGGCAGATAAGCTCTTGTCGCAGGATTTTGTACAGATGATGGAGGAGATTCTGAGCTCTTTGTCTAAACAAAGGCAAATTTTGCTGTACTCTGCCACATTCCCACTGAGTGTGCAAAAGTTCATGAACTCCCATCTCCAGAAGCCCTATGAGATAAACCTGATGGAGGAGCTGACCCTGAAGGGGGTTACTCAGTATTATGCCTATGTGACTGAAAGGCAGAAAGTCCATTGCCTTAATACTCTATTCTCTAGGCTCCAAATCAATCAGTCTATAATCTTCTGCAATTCGTCCCAGCGAGTGGAACTCCTGGCTAAAAAGATCTCACAGCTTGGGTACTCCTGTTTCTACATTCATGCCAAGATGAGGCAGgaACACAGAAACCGCGTGTTCCATGATTTCAGAAACGGCTTATGTCGAAATCTCGTCTGCACTGATCTCTTCACGAGAGGAATTGATATTCAAGCTGTGAATGTGGTGATCAACTTCGATTTTCCCAAACTCGGGGAGACGTACCTTCATCGCATTGGCAGATCTGGCCGATTTGGACACTTGGGTCTTGCCATTAACTTGATCACTTATGATGACCGCTTTAACCTGAAAGGTATTGAAGAACAGCTGGGTACTGAAATCAAGCCCATTCCCAGCAGTATTGACAAGAGTCTATATGTGGCCGAGTACCACAGTGAGAGCGGAGAGGAGGTTAAACTGTGAGCAGGAGAGATCACCAATCCTTTGTCCCCTATCCCACCCTTTTCGTTCCCTACTGTGTCTAGGGAATaggggactttttttttcttttttttcccccctcctTTCAACTATATCTTATTTCTGTCTTCCTCTACTCCCACCTCCCtctttttttcgttttctttttttctctcctgtCTTGTGCCACCACAAGGAATGTCGTGTCGATGGCCCAATATTCGGGAAGGACTCATGGCCCACTAAAGGACTGCTATACCAATATTTTCATCCTGAAGAATTCAGATCACTTGATGAGGAGGGAAAGAGGGGACATGAGGATTTATCAcccaaggaaaaaaaaacaattcatcgCCTTTAAGCACATCCACACCCCACAGTCTCTGTCCCTCTGCTCGTATTCATGTTTCTAGTCATTTGAAACAAGTGCCTTAACAGTCTAACTTGTTCAAAAAGTAATAacctgatgattttttttttctcctcctcattcaacatcattttttTACTACTCTGGCTTTTTGGTGTTGCTTGTCTGCCCCTACACGTTTGGCATCAGAAGAATAATTTAGCATTTGTCACCTGTAGTTTATTGGGGCAACAAAGAAAAAGATTGCGCAGTGGGAGAGAGGATGAGGCAGCAAATTGTGCCGTACTTTGACTATGTTGTGAAAAGAAGCCCCTTGGAGAACTGAGATGAAATCAGTGAGCATAATGACAATGATAGGGGCTGATCTTCTTGTGGCAAGCTTTCAAAAGTCCCACACGGCTCAAGGATtcacaaggatttttttttttttgttcccttCATCTGCTCATGGAACATGCCATGCCTCTAGAGACCCGTAACTCTTTCCCCCTCTGTCTTCAGCGGGCCAACACTAAGAGACTAGACCAGACTCAGACCAGCCTTTCTCATTGGCCATGAGGAATCTCTCTTTGAGATGAATGTGGATTTCTTTCTTTTACTCCTccctcattttcttttttctatccTCCCAATTTCATCCTGATTTCAGTGCAGTTTTGCATTCTTGGGTAGGCACTCTGTCCTAAATGTGCCATTTATACAGATCTGGCgcatttgtaaacattttgtaaatacttcatttattttttttaaatggattgtTTTAAAGCAAGCTAAAAAGGCTGGATGAACATTtgagaagaatgttggaaagatCTTTAAAATCCAGGATCCTGTCAGCACTGGATGGCACTTTTGTTTGCTTATTCCCCCTTTTCCATCCCCCTTCATGGGGAaataagtttaaagtttaaacctTTCCTGGTAATGCACCGCCAGTGTTTTGTTATCGTAAGAAATGAGTTCACACttgctttattctttattttaaaactCGAGACTCCGTTCAAAGGTTTTGAGTGTAATCCTCTGGTGGTTTCAGCAGGTGGTGCAATTGTTCAGATTTGCAGTTATTAACTCATCCGTTTTCCAGTGTTGACATGTTTCCTGACGTGGGTCGCTCAAATAAATGGCCTCATTTGCGCGTTGTGAAAACATGAGGCTTAATTGCTTTCCAGCCTTTTGCTTGTAACACTGACTTATGAGCACTCAGCGGGGTCCCTGAGCCTGGGTGACTCTAATCATAgagataatttaatattttcatcaTGTAATAGTGCTACTCGCTGCAGTGCAGCTCAAATTGGCAACGTGCAAAAATCTAGAATTTCTAAGCGAGATGTGTAGCTGTTACATGGGTCTGTGTTCACTGCCACCGGCACTAGGACATGACTTCAAACAGACCGTTAAGGGTGGGAGGATCGAAAGACTTGGTGGTTCCCAttggaaaaaggaaaaaaaaatggacaaaaatataCTCAACTGGATGCCAAGACTTGATGGACTGACATAATGTAGCGGCAGAGACATGCAGTGCATTGTGAGTcagcaggcttttttttttttgtaaaaagacCATGTTCTTAAGATGCTGCACAGACTTTACAGAAGAATCTAAATCTTTGCAGTGAGAGCTGCACTTAAGTTTGAACTTTAGTTCAAGGGTTGGGCAATAATAAAGGCTGCACACGTGCTTGGAGCACTTCCTCGGTTAGGCTAGAGGTGTAAAGACCATAAGGgagtttaatctttattttatttaatttttttgaggaAGTATTGTGGCAGGGATGAGGGTATTTAACATGGGATGTGGGTATTACATGGGTGCTGATAaccaaatgatttattttttttattttttatttttttgcagcagaATATTCATCCCCATCACCCCAAACACTAATAGCCTTTAAAGATTTCTGAGTGATTTATTTTCCCCCTCTCTGGGGATTGAAATGGGCTTGCTTGAGACACTTTAGCCCTTCTGCTGCTTTGTCACTAAGTTATGCATTTGACCCGTGATGTTTTGAGGGTGTTTCCTTTTATATGGGGTGGGTTAAGCTTGGGAGGGATACAATTTATGTCTTTTTATGATTATTAGCACAATTTGCGTTAAATTCTTTACGTTGGACTTCAACATCACCAACGTCCCCATTAGATAGTCAATTACAGGTGagatgtttaattaatttttttttttttttttggattagtaTTGTCGACTGTGAAGGCTATTGATATAATTAAGGACGTTCGTACTAACCGTGTGGTTGGTTACCCAAATATTGGCCCAGATTATTATTTATCACAATCCTCAAAATGCAGCCTTTTCCACAGTGGCCATGCTTTAATCCGGCCTCATATTCTCTTCTCTATTGCGTTCCCCTCTGGTGTGCACAGATTGTTCGCCCAACTAATCCGCTTTGGTTTCTTCTGGGGGCTTTTTAAACCGATCTGCTCTAGAGAGGAGAATGCGAGTTTCTGGGCGTTTGGCAGCAGCCCAGTGTTTTTCAGTAACCACTTGCTGTGGAAGTCACAGTTCTTTCTTGTGATGCTGTAAATCAGCATGTGATTGGATGTGCTGTGGTCTTTGCCATGGTGGTTGgggttttgatttgttttattttcttttatttttttattttaagctttgGTTTTCCCTTTCATTTTGAAGAATAGAGTTGGAGAACATCTCACCTGTTTAAGAGTTGTTTTCTGAAGCTTAAGCTAATTACATAATGGAAATCCACTCATTCTTcagtgtattattttatttatttttatttaatttttgtattggGTGGgtgggaagtttttttttttttttttttttttttggctgcccTGATGTATCGTTCTAATTCCAGCACTTTCCATCTTTGTGTTCAGTGTTGGGAGTATTTGGATACATCAGTTTGGGTTGGTGGGTGGGAGGGATGTGGTAAATTGGcttaaaagaaaaattaagatGAACAATTAGGAGTTCAGGGTAAGGAATTCAATCTTTAACCTTTGCCCTCAAATTTGAgatgtttttctttctgtttggaTACTGCAAATGAACAACCAAATTCAAGAGAAATCCAAAGTATTGTTTTGTTTCTCCTTTTCAATTTGGACCGTTTCAATTGGCTTTTGTTTCTCAGTGATGCTGCATTTTTAAAGAGTTGAGATGTGTGAATGCAATGGTTAACATCTGTCATGGTTTTTGTTTGATAATAAAGCTCACTGAAGTTCCA

Function

symbol description
treh Predicted to enable alpha,alpha-trehalase activity. Predicted to act upstream of or within trehalose metabolic process. Orthologous to human TREH (trehalase).

GO:

id name namespace
GO:0008152 metabolic process biological_process
GO:0005991 trehalose metabolic process biological_process
GO:0004555 alpha,alpha-trehalase activity molecular_function
GO:0016787 hydrolase activity molecular_function
GO:0016798 hydrolase activity, acting on glycosyl bonds molecular_function
GO:0003824 catalytic activity molecular_function

KEGG:

id description
ko00500 Starch and sucrose metabolism
ko00537 Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored proteins

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070912-83 Predicted to enable mRNA binding activity. Acts upstream of or within response to heat and stress granule assembly. Located in cytoplasmic ribonucleoprotein granule. Orthologous to human DDX6 (DEAD-box helicase 6).
ZDB-GENE-070912-84 Predicted to enable alpha,alpha-trehalase activity. Predicted to act upstream of or within trehalose metabolic process. Orthologous to human TREH (trehalase).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000061338 ENSDARG00000077911

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00026743 False 1965 mRNA 0.49 13 43846936 43866001
TCONS_00026744 False 1064 mRNA 0.52 8 43847134 43857089
TCONS_00026745 False 1749 mRNA 0.51 15 43847155 43866526
TCONS_00026746 False 6780 mRNA 0.41 13 43865901 43880020
TCONS_00026747 True 5615 mRNA 0.41 14 43867183 43884044

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_013603 NA coding downstream 199503 43615707 ~ 43647433 (-)
XLOC_013602 NA coding downstream 254024 43589544 ~ 43592912 (-)
XLOC_013601 NA coding downstream 396595 43447319 ~ 43450341 (-)
XLOC_013600 NA coding downstream 987680 42858003 ~ 42859256 (-)
XLOC_013599 ttc36 coding downstream 1016373 42781622 ~ 42830563 (-)
XLOC_013605 NA coding upstream 8793 43892837 ~ 43894135 (-)
XLOC_013606 bcl9l coding upstream 12109 43896153 ~ 43993634 (-)
XLOC_013607 cdon coding upstream 169008 44053052 ~ 44129151 (-)
XLOC_013608 NA coding upstream 373713 44257757 ~ 44258660 (-)
XLOC_013609 pimr179 coding upstream 397579 44281623 ~ 44285539 (-)
XLOC_013384 BX323829.1 misc downstream 24304705 19542102 ~ 19542231 (-)
XLOC_013598 NA non-coding downstream 1240267 42460888 ~ 42606669 (-)
XLOC_013615 NA non-coding upstream 747527 44631571 ~ 44634146 (-)
XLOC_013616 NA non-coding upstream 760108 44644152 ~ 44647011 (-)
XLOC_013620 NA non-coding upstream 1629920 45513964 ~ 45522215 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000028_03677140_03686568 DDX6 coding CI01000028 null 3674444 ~ 3686976 (+)
bowfin (Amia calva) AMCG00004574 ddx6 coding CM030121.1 CM030121.1 53992451 ~ 54004550 (-)