XLOC_015529 (pi15b)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015529
gene name pi15b
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 30368800 ~ 30376396 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00031042
GAGATTTGCATCTGCATCTGGATAACTGACtcagagctgctgctgctgctgcttcaccGCAAACTCCTGCAGATTCAACGTTAACTCCATAGAAGGGCTACTGTATTCACCAAAGAGGGATGAAGACCGTCAACTTTTTTACCGACTTGCTTCTTGTATTCATAGCTAGTGATGCGAGCGCTTGGGTTATCAGAAATGCGACCGAAACGCAAACCGGAACCAATCTCACTTTCAGTACATCGGAATTGGGGGATGATCAAGGAATAGGATCCAAACCCAAATCAAGGAGAAAACGGTACATTTCGCAAAGTGACATGATTGCAATTCTGGATTATCACAACAAGGTGCGTGCGAATGTTTTCCCACCTGCAGCCAACATGGAGTACATGCTTTGGGATGATGGACTGGCCAGGTCAGCAGAAGCATGGGCAGCCACCTGTATTTGGGAACACGGACCACCTTACCTTCTCCGATATCTGGGTCAAAACCTCTCAGTTCGAACTGGCAATTACCGCTCCATTCTTCAGCTGGTTAAACCATGGTACGATGAGGTCAGGGATTATATGTTTCCATACCCACGTGACTGTAATCCCCACTGCCCGATGCGCTGCTATGGACCCATGTGCACACATTACACACAAATGGTGTGGGCGTCATCAAACAGAGTTGGATGTGCCATCCAAACCTGCTTCAATATGGTAGTATGGGGTGCTGTGTGGAGAGAGGCAACGTACTTGGTCTGCAATTATTCCCCAAAgggCAACTGGATTGGTGAAGCACCATACAGAGTTGGTGTGCCATGCTCCGCCTGTCCTCCAAGCTACGGAGGTTCATGTAGTAACAACATGTGCTTTCCTGCTATCAACTCAAACTTCATGTACTGGTTTAAATGAGCCAATAATATAGTTACTGTGGGCATTTTGCAGTGATGTTGTACTATCTAATAGTTTCGATAAAAAGAAATTATAATATTGATGCAAATGTTAGCATCAATcattcactctcagaaataaaggtacaaaatctgtcactggtgtattacctttttaaaaggtacacttttgtaccatacTGGTGGAAATACACTTTTGTATCTTTAAGGttaacttttgtacttttaaggttgACTTACTGTGAGGTACACATTAAGTTCTACCAGAAAGTCCAGGGAGATAATTATGATACTGAATTACTTTTATTGATGAGTATTATTTGATAAGAGTATCATGAGACAGGATTTCTTTGGCGGAGGCCCCATCCATAGCTTGGTTTGAAAGCTTTTAGATCTAGCTACGTCTTTTGAGGATGAAGGCAGGGACGGAGCCTTACCCCTCTGGACAgggccaacctggtggtggtggggaCGATGGGTATACGTTTGCGTCGGTGCCTGCAACCAAATTAATGAAATGAATGGACAGCTTATATATTCCTTGTGTCTCGTGGCTATTGGTTGGAACTGATTGTGATGAGTCTTGTGACATTTAGGTCTTCCTAGAACTACCGCTAAAAGCTACATTTActgtgaggtacacatttgtactttttaggtattaatatgtaccttttaaaGACTAGTTAGGAACAAAACTTTATCCTTTGAAACGGTACTGCCCCAGtcacagattttgtacctttatttctaaaattGTTATGACAAATAAACCAAGATTGTTggtgtttaaataaaaatttcacccaaaaatataaattctgccatcatttaatcGCTTTTTACTTTTTCAAAAACTGTTTGAGGTTTTTTCTTCTAATAAGCACAAAAgtacatattttgaagaaagcaggaaacttctaatcattgactttcatagtatttgttttttttatctggaaTTCAATggttgcatgtgttttttttagctttcttgaaaatatattatattgtgttcagcaaaagaacaaagctcataaaggtttataaccatttGAGGATgagtttatttttgggtgaacctgCCTTATGtttaggatgaaaacatccactaaattaaacttcCCTACAGGGaacaattaaaaatgcatatggggtcatggctttgcaatcaaaaaattttattataatgGAAGCCAGTGGAGCCAAAACTGGCACAAATATAACggaagggtagtaaatttgcccacaGCCTATTGTTGAGttctttaaaataagatttgtcaccaaaaatcattctatttGCTAAAatacagagaaagttgtggccacaTTAACACTCAACAGCACCCCATAGTGGATGCAAACGTCCTCAACATATCATAAgggttaaataaattttatatagaGTTTCAATACAAATTGGttctaaatatattaattattattattatttgatctgTTTCAGTTAATATCAAGAGCTTgcataacacatttattaatttgtacaaTCAATTTTATACAAAAATGTTGAGTATGTGGAAAATGAGCAGATCATTTAACAATGCACAACAAATAAGATTGTACAAAATAATTCATACAAATCAGCCACTAACATAATATAGTTATGAAATGCTGTGATATTGGTCAGTTTTTCTTTATATGATTTAGTCTTTCACACAATGGTTACTACAAAAACGTAAACATGccacaaaagtattcaacattaaCAAgactttcatccattcattcgtttttttttttggctcagtccctttattcattaggctcttccagctgcaaccaagtagtGGGAAACACTACTCCATAACTCTAAACACTAATTCTCATTCACACTTAAACAATACGGCCATGGTCTGTGGACTGCaaggtaaaccggagcacccggaggaaacccacacaaacaaggggagaagatgcaaactccacacagaaaagctaactgacccagccagggctcaaaccagtgaccttcttgctttgaggtgacagtgctttcCACTGAGCCACCctcaataaataacataaaataatcaaatcaGAAGCTACATTTTATCAAGTTCACTTCACCAGTACGAATAACCCTATAACTAAGTTAAAATTGGCTGTGATGATTAGTTAAGGCATTACTTAATTCAATCGTTAGTAAATGATTACTCAAATTATATCAgcaatttcaaaacatttttgtcTTAATGTAATTATTAGCATTAAGTTAACAgaactcaatttaatttaaacatttaatcaatTAAGTCAGCAAATTTTACCTAATAGGACTCCTTTTATATTGATATGCATTTTGTACAGCAGATGTAGTAGCGTttttgtacagtatgtgatactatTGAACCCAGAAATGGTGCTAATGATAATGTCATTTTAATGTAACTGTTTTAGAAGCAGTCATCATCATATTGATGCTCGTTGATAGTTAATTATTCTTTTCTGGTGCACAGATCAAATCCGTTTACTTATCACTATATATAGCAATGTTTATATTCCAATATACAGCTATTTCTTAAAGGTTTTATATGTTCATTTTGTCAGGGGTTTTCCAAGGTGCTCAGACATTATTCCAGCTATTTTGTTCAGGTTAATTAAAAGGCAgcctcaattttttttacatggtttttaTAGCTGTCTGGGTAATTTCTGTAGCAAAACAAAGTATTCTAGGATTTTATAATGATAACATtgaatttgtaactttttattttattttatattggtcaTTAAAAGTTGTCACAAGTTATAGTGTTTTATGCTCTTGTatttctttgtgttttgttttaccaTATAGATTGGCAATCCATTTTAAATATCTGTGGAAAGGTGCTctgattttgtttgcttttctttttacAATTCTCTGCTTGTCTGAAAAGAGGAGGTTCGTCACTAAGCTTTtaaatttctaaaataattttatataaatttgtttGATATTATAGTTAATGCCAGACCACATAAGTTGTTTTTTCTTGCAATTGATGGCTCATTGAGATGATTATCAGCTGACATTTGTTGTACATTCCCAGCACATAGTAGCAGTATTTTAATGCCTGTAAATTAATTTACCCCCTTAAACAAGATACATTTTGTGTTGAGATAATTTACTCCAGTCCATTATGCAGTTTGTGTTATTTCTTATGAAGTGTTttgtattaaatgttttacattagTGCTGAAAATATTCTAATAAATATGTCTTTGCTATTTGGGAGAGTGTATATTTAAggtaaaatttgtgttatttaaatagttacatttacattattagtAAGTTTTAACATCAGAGTAGGTGGAAACTGCATATAAAACAGC
>TCONS_00031043
CTAGTGATGCGAGCGCTTGGGTTATCAGAAATGCGACCGAAACGCAAACCGGAACCAATCTCACTTTCAGTACATCGGAATTGGGGGATGATCAAGGAATAGGATCCAAACCCAAATCAAGGAGAAAACGGTACATTTCGCAAAGTGACATGATTGCAATTCTGGATTATCACAACAAGGTGCGTGCGAATGTTTTCCCACCTGCAGCCAACATGGAGTACATGCTTTGGGATGATGGACTGGCCAGGTCAGCAGAAGCATGGGCAGCCACCTGTATTTGGGAACACGGACCACCTTACCTTCTCCGATATCTGGGTCAAAACCTCTCAGTTCGAACTGGCAATTACCGCTCCATTCTTCAGCTGGTTAAACCATGGTACGATGAGGTCAGGGATTATATGTTTCCATACCCACGTGACTGTAATCCCCACTGCCCGATGCGCTGCTATGGACCCATGTGCACACATTACACACAAATGGTGTGGGCGTCATCAAACAGAGTTGGATGTGCCATCCAAACCTGCTTCAATATGGTAGTATGGGGTGCTGTGTGGAGAGAGGCAACGTACTTGGTCTGCAATTATTCCCCAAAgggCAACTGGATTGGTGAAGCACCATACAGAGTTGGTGTGCCATGCTCCGCCTGTCCTCCAAGCTACGGAGGTTCATGTAGTAACAACATGTGCTTTCCTGCTATCAACTCAAACTTCATGTACTGGTTTAAATGA

Function

symbol description
pi15b Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be active in extracellular space. Orthologous to human PI15 (peptidase inhibitor 15).

GO:

id name namespace
GO:0005576 extracellular region cellular_component
GO:0005615 extracellular space cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070912-590 Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be active in extracellular space. Orthologous to human PI15 (peptidase inhibitor 15).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000061292

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00031042 False 4240 mRNA 0.35 6 30368800 30376396
TCONS_00031043 True 728 mRNA 0.48 5 30369116 30373049

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015527 NA coding upstream 34287 30329405 ~ 30334513 (+)
XLOC_015526 si:dkey-82k12.13 coding upstream 82551 30281444 ~ 30286249 (+)
XLOC_015525 CR788254.3 coding upstream 88296 30277334 ~ 30280504 (+)
XLOC_015524 CR788254.1 coding upstream 91738 30276217 ~ 30277062 (+)
XLOC_015523 CR788254.2 coding upstream 98637 30269306 ~ 30270163 (+)
XLOC_015530 crispld1b coding downstream 3254 30379650 ~ 30395993 (+)
XLOC_015531 socs6b coding downstream 47032 30423428 ~ 30430345 (+)
XLOC_015532 neto1 coding downstream 87429 30463825 ~ 30480455 (+)
XLOC_015533 atpsckmt coding downstream 104511 30480907 ~ 30483209 (+)
XLOC_015534 march6 coding downstream 113450 30489846 ~ 30526721 (+)
XLOC_015521 NA non-coding upstream 171059 30197370 ~ 30197741 (+)
XLOC_015544 NA non-coding downstream 699180 31075576 ~ 31084080 (+)
XLOC_015545 CT955962.3 non-coding downstream 724048 31100444 ~ 31217778 (+)
XLOC_015546 CT955962.2 non-coding downstream 724692 31101088 ~ 31101573 (+)
XLOC_015547 CT955962.1 non-coding downstream 731533 31107929 ~ 31108414 (+)
XLOC_015549 NA non-coding downstream 915250 31291646 ~ 31292603 (+)

Expression


Co-expression Network