XLOC_017620 (si:dkey-7c18.24)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_017620
gene name si:dkey-7c18.24
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 46039591 ~ 46043405 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00034947
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>TCONS_00036688
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>TCONS_00034948
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>TCONS_00034949
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Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-041014-63 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000041433

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00034947 False 1557 processed_transcript 0.33 3 46039591 46041367
TCONS_00036688 False 2295 lncRNA 0.38 5 46039591 46043405
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TCONS_00034949 True 1269 lncRNA 0.45 4 46040712 46043405

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_017619 NA coding upstream 43159 45987917 ~ 45996432 (+)
XLOC_017618 AL929237.2 coding upstream 52808 45985461 ~ 45986783 (+)
XLOC_017617 NA coding upstream 137434 45900148 ~ 45902157 (+)
XLOC_017615 bmp2b coding upstream 140442 45893173 ~ 45899149 (+)
XLOC_017616 NA coding upstream 143051 45894168 ~ 45896540 (+)
XLOC_017621 taar11 coding downstream 88407 46131812 ~ 46132911 (+)
XLOC_017622 taar13e coding downstream 129244 46172649 ~ 46173674 (+)
XLOC_017623 taar13a coding downstream 133160 46176565 ~ 46177592 (+)
XLOC_017624 taar13b coding downstream 140100 46183505 ~ 46184530 (+)
XLOC_017625 taar13d coding downstream 148225 46191630 ~ 46192655 (+)
XLOC_017613 NA non-coding upstream 197766 45836898 ~ 45841825 (+)
XLOC_017637 BX957286.1 non-coding downstream 234501 46277906 ~ 46279478 (+)
XLOC_017642 NA non-coding downstream 308508 46351913 ~ 46357028 (+)
XLOC_017643 NA non-coding downstream 319046 46362451 ~ 46367708 (+)
XLOC_017644 NA non-coding downstream 325041 46368446 ~ 46423475 (+)
XLOC_017646 NA non-coding downstream 399141 46442546 ~ 46523077 (+)

Expression


Co-expression Network