XLOC_017617


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_017617
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 45900148 ~ 45902157 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00036683
ATTTAAtaccataatttaaaaaaaaaataggaaaatttATAAAGGTGACCTTATTATTTCCAAAAAAGGGTTACACTTCATTTTATGTTATAATTCTCATTAAGTCTCTTTGGTCAATAAACCactgattattaatagttatttatgTTGTAGTGGGTTTAGAAACTGGGTATAGAAATGAGGAATATCTTTCTTTTTAAGTGCTAAAAAAATCCAGTATCTTAATAAATACTGGTAATGCAGGTAACAGCCGGTATTTGGTACTTAAACTAATGTGTTTCCAAAAAAAGAAACCATGGCCAAGTTAATTCCAATTATCAGGCATCAGAGCTGCTGTAATTATCAATACTAATATCAAGAGAAAAAAGAATCCTCATCGATGCccttaattttcttatttaatgcatttacacCAAATTAATGCCTTCTAATTTTGCCCAAAAGTCTATTTTTGGGGTTTTTCTAAAGCTCAAAAGGTGCTGTATATAGAAAAAAAGACCACAATGTCTACAGTTTGATTCCCAATAAGCGTGGTGTTGTTTAgtggcattttttaaaataattgttttggttttgtcAACTTGAGGACATCCAGTTTGTAGCATATATTCATTACCTTAATTTACCTTTAAATCTTGCCTCGGTATCGCAAAGTAAGGTGAATAAAGGTAACATTATAATATACAAAAAAGGGTCACACTTAATTTTAAGTTACAATTCTTTTTGTTAACCAAGTCTTTAAGCTCAATAAACCACTTATTATTAATAGATATTTCGGTTGTAGTGGGTTTAGGGGTGTAGAAAAAGATcctactttataagtactaaaaaAAGCCAGTATCTTAATAATACGCAGGTAATAAACCAATATTACTAGtgggaattggtacttaaactaaagtgtcgccaaaaaaaaaaaaaaaagaaaccatgGCCAAGTTAATTCCAGTTTTCAGGAATTAGAGCTGCTGTAATTATGAATCCTTATATTGGAAGAAAAATAATCTCATCTTTGCCCGTAATTTTCTacattcagcttattttaatgcatttacacCAAATTACCACCTGATTTTGCCCAAAAGTCCATGATTAGGGTTTATCTAAAACTCAAAAGGTGCTGTATAAACAAAAAAGACTACAATTCTACATTTTGCTTTCCAAGTCAGAGTGGTCTTGTTTAGTGGGATtatttgtgttaatttttttggTTCTGTCAACTTGAGGACCTCCAGTGTGTAGCACATATTtgtaacttaaatattttaaaaatcttgcCTCTGAATCGCAAAGTAAGTTGGATAAAGGTGACATTATAATATTCAAAAAAGGGTCACGCttcattttaag

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00036683 True 1350 lncRNA 0.31 2 45900148 45902157

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_017615 bmp2b coding upstream 999 45893173 ~ 45899149 (+)
XLOC_017616 NA coding upstream 3608 45894168 ~ 45896540 (+)
XLOC_017614 AL929237.4 coding upstream 42478 45853154 ~ 45857670 (+)
XLOC_017613 NA coding upstream 58323 45836898 ~ 45841825 (+)
XLOC_017612 chgb coding upstream 148132 45741566 ~ 45752016 (+)
XLOC_017618 AL929237.2 coding downstream 83304 45985461 ~ 45986783 (+)
XLOC_017619 NA coding downstream 85760 45987917 ~ 45996432 (+)
XLOC_017620 si:dkey-7c18.24 coding downstream 137434 46039591 ~ 46043405 (+)
XLOC_017621 taar11 coding downstream 229655 46131812 ~ 46132911 (+)
XLOC_017622 taar13e coding downstream 270492 46172649 ~ 46173674 (+)
XLOC_017611 NA non-coding upstream 230798 45666158 ~ 45669350 (+)
XLOC_017609 NA non-coding upstream 474329 45424391 ~ 45425819 (+)
XLOC_017608 CABZ01035143.1 non-coding upstream 964993 44935039 ~ 44935155 (+)
XLOC_017637 BX957286.1 non-coding downstream 375749 46277906 ~ 46279478 (+)
XLOC_017642 NA non-coding downstream 449756 46351913 ~ 46357028 (+)
XLOC_017643 NA non-coding downstream 460294 46362451 ~ 46367708 (+)

Expression


Co-expression Network