XLOC_017708


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_017708
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 50329228 ~ 50332544 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00036736
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00036736 False 2265 lncRNA 0.44 2 50329228 50332544
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TCONS_00036742 False 1125 lncRNA 0.43 3 50330782 50332544
TCONS_00036743 True 1050 lncRNA 0.43 2 50330873 50332544

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_017706 NA coding upstream 30885 50210097 ~ 50298343 (+)
XLOC_017707 CU570682.1 coding upstream 79401 50248092 ~ 50249827 (+)
XLOC_017705 slc24a4b coding upstream 131021 50115335 ~ 50198207 (+)
XLOC_017704 cpsf2 coding upstream 239330 50052116 ~ 50089898 (+)
XLOC_017703 riox1 coding upstream 284473 50015470 ~ 50044755 (+)
XLOC_017709 NA coding downstream 118925 50451469 ~ 50504264 (+)
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XLOC_017712 mpp5b coding downstream 673818 51006362 ~ 51081372 (+)
XLOC_017713 im:7140055 coding downstream 729151 51061695 ~ 51077936 (+)
XLOC_017700 NA non-coding upstream 869471 49450993 ~ 49459757 (+)
XLOC_017698 NA non-coding upstream 977673 49189737 ~ 49351555 (+)
XLOC_017699 NA non-coding upstream 1021625 49306976 ~ 49307603 (+)
XLOC_017714 AL928824.2 non-coding downstream 730330 51062874 ~ 51156101 (+)
XLOC_017716 NA non-coding downstream 836368 51168912 ~ 51173504 (+)
XLOC_017719 CU660013.4 non-coding downstream 1057357 51389901 ~ 51391289 (+)
XLOC_017720 CU660013.1 non-coding downstream 1074536 51407080 ~ 51411179 (+)

Expression


Co-expression Network