XLOC_022764


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_022764
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 6389435 ~ 6399785 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00046932
AATAGATTTTTTTGTAGAAATATTTATTGCAGAGGAGGTATTTTTTATGTACATGCTATCACAATATTACACAATATAAATCTACCAAATATCTCCATATGTGTATGCTATAAGCTTGTCATAGAGCATTTGATATAACAAGCACATAATACAGTGGGTAGGGTACAGTTTCACTCACTATACAACTCGTAACAGTCCAATAAAGATCAaagattattatcatttttttttaaagttctatCAAGGGCAGTGAAACATCAGTCTTACTAATTTCTCATTATCATGCAGAAGCAACGAGAGTTAGAGCTAAGACAATACCGCGTTAAGTAGTAGGAGTGTCCCCCCCAACACGCGACAGTGGTGGGACACGCGTGGGGCTCAAGTAAACGAGCTAAATAACCAAAAATCAatcataaatagataaataatcaCTTCTGTAAACTTCAAAAAACTAAACATTGCACTAAGACAATGTAATAGGCAAGGTTACCATTAACATTAACAGGTCATGAGTTGAGTGCTTACATCGTACTACATAGAGATCAACCGAGGACCCGCAGATGAGTAAAACTTGTAAACTAGAGGGATGCACTACGATACAACAACCATTCCCAGAAACATTCTCTATGTATAACAAAGTTGGTCAATTTTACACATCCATCTAGGCATACATTAAGAACAGACTCTGGAGAGCGTACTGTTCTCAGCAGAGTGTATGAGATGACCAGACAGTTTCGAAATATAGGTTGCTGAAAGTTCCCTTTAGTGTACAGAGAAATCTATAGCCTGATGAGGATGGCAGAAATCCGGGATTCTAAATCATAAACAGATCTCTGTTCCCAGAAATCTGGGAAGGTGGCGAATAGCTTTTGATTGGTCAATAAAATACTACTTGGGTCATTCCTgctttgctgtattttttttttttttgtaagatgtGTTAAACTCACAATGTTAAACAAGGAGATCATGTAAGTTTGATTTCTTTTATTACAGGATGAGAATGAAACGAACGTGAAGTGAAtttcaatttactttttaaaccgttttatatttaaatatatattttaatgtcatttatttcCTGTGATTTCAAAGATAAATGTTTAGCATTGCTGTTATAGTCACAAAATTCTTTGCTTTGCAATGCAAAGTTTATAACAGTCAATTATTAAACCTCTGATAGGCTGATGGCCATGTGGCATTCTGCAgtatcagcactcgtacagcctcttcacccttgtgttttactccgcccacatacagtgacagcagatcaataaactcacaacagtttgacaattattgcagctgttggacaacataatggaCTGTTGCTTCTATTTTTGGCaagaatgttgttgtttagattgcaactatacagttttttttataaggatagtgcctattttttaaatatttataatgtcaAGAGATTCAGGCCCTTAGCCTgccattgagcagagcaaagagagTTGATATGtttccacaagatggtgacagagactgcataatacaTTAAAGGAGGAAAAACGTACAGCTGATCAAATCCCTAGAGTCGAtgtctctcttttgtatgttgtaatgctgtatttataccatagtaattttcTAATATTTGCTTCGGCTTTTTCTAAGTTAATTATtatgatctcccgattgcaacagagaaataatgGGAAatatctgtagactgatggcatttcatgctgttcttaaaatcttaaaatgccAACAAAattctgttttgtcatcactttagatataatGCTAAAGAATCATTacaatactagctctaaagtgatgttggtgaagtagcaaaagtttggtttctgctgttctgatgtcagctgcagttGTGAacaaatggcggaagaaagtagttcctcatgcaATAGGATTTTGAGACTTTccgtttgattttctttttaatatacataatatagcTGTCGAACTGCTGTAAatacgcaatatcacactcgtagcagagcgatatggctgtatatcgtcactggtgggacactaagcacacctcccaccagtgacgatatattgTACTGCTActcttgtatgtatatatatacacacacacacacacacacacacacatttttttgggTTTTTGTTAGGTTTTCTGAGCATCAAATTAGCAtatcagaatgatttctgaaggatgatAGGACTGGGGTAATGATGTAAAAAAATCAGCTTTGAATCacacaaataaattacattttaaaatatattaaaatagcaaacggttattttaaatatatggagATCAAATTTAGAGAATGAGCCTcaattctttaatatttttaaccataacatgtaattatatattttcatgttgtaaatattactattatactaatagtattactacactgtaaattTTGAAGCTGAATCATATTAACcatatgagtccattgaacttatatacTGTTAACCTAacttgcgtaacttataaaattaagttagaacacgGTTAACATACTTTGAATTACAATGGCTAAAAAGATATGTTGTCACACAAAGTGATCATGTAATTGTAATActgaaatattatattgtattattaaaatattacttcttttCTGCCGTATAATTGTTcggaaaaatataataatgataataatacaaaataatataatttttatctctactacacatacacacttattcatattttgtgttttcttttatatatttctcGTTTCTAAATATTGTATGCAGTTTGAAACtggtatagtaaaaaaaaaacacttaacaatGTTGGACGGATTTCTGTCCTATCCATTTTCTTTAATTTGAGCAAATATCATGTAATCATTAATAATGTTGATAGATCAGATGACCAGGAAAAAATTCCGCTGAAAGAAATTatgaaaaatcaaaacaaaactgcaGAGCAGGAATGATCCACCTGTAGTCATGGGAAGATATTTTTCAGAAGTCATATATTTCCCCCACTGTGGAGAGATGGGAGCGTGACATCATCTGATTCTCTCACAGAATGACATATTtaggtacatttttttttctttttacctcTTTGGTACATATAACATATATACATGGTATAACCATTTCTTCTGTATTCTTGCTAATTCATAGTGTGCACATACAAAACACAAGAATCtgtcaatacatttaaaaaccatttagTTACTGTAGGATTGGGTCAACACAGTTTGAAATCGCAATGTCAACATATATATGAATATTTCATAACGAGGCATTGCACTGTACAACAGCTCATGCCTCGTGTTTGGACACCATTACCTTGACATCATTACAGATTACCATTGACCATGTACTGAAAAGGCATTCAAGATATGTTAACATTCCAACAGTAATTTAGATACTTGGTTAAACTCATGTCAGTGGTCTCTGAGGAGGATTCAAAATATTCTTTTTAAGAAATCGATACAATTTCCAAAAATTCAATACAGTAagaaaaagatgttttttttatttgaaactgaTGTAATCATCATAGAATGTTTAAAGAAACTGAGGCTTGGGTCAGAATTTGATATGAGATATTGGAATTTAAGTGTTcttattagctatgtttccatccatcaatttttatgtaaattttggAATATCTCATACACTgtgaaaatgctgggttccacacaatctatttgtgttgggacaacatgatggaaTCAAATTATacgtatttgtttttacaaatttaagttgattgaacataaaattataaaaaatgtataagtttTCAGTGTAAAAAATGCTCAATGGAAACCGCAAAATGCtcgtacatttacatttatgccCACAACtaagataaaatattttataaactacGATTTAGCAAATGAACTCCAGCGTGCACATCCAAAAAAGTCTTCAGTAGACTAATCAGCTGACTgaccacattttaaaacatctgaaatgttgttttagtcattctaaaatccctcagccaaagtctgtcatcaaagtggttcgGTATTATTACTTCAAAAAACTGTATCAAAGATCAGTCTCGCAGCTCCAAAAGCCACAGCGCATTCATTGCGTTTCATCTTCTAAGATGCAAGCAgtgcatagaggcgacctagatAGAGAGTTGTTTACGACACCAGACCCCGTCTTCACTTTTGTCCGACAACCTCATCCCCGTGCTCTTCACTACTGTTTGCAACACCACCTCGCTCTCCACTTTCATCTGTGGCAGCACAACCCCCcagctcttcacttttgtccgacAACCCCATCCCAATGGTCTTCACTACCGTTCGCAACACCACCTGGCTCTTCACTTACATCTGCAACAGTGCaccaccaattaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacacagtggcTTTtactactgcagcaaattccatttttctttttgaaatttgGCGCCAGTTTTTCAGGAAGtaacgattttgttctctttgattcattgCACTGTAAATATGCTGTCCCAACAAAAATGGATtatattaacttaataaatttaagtggattaaacataaaacaattaagttgtccctaaaaaaatgttaagaattgttttgttttcagcagcaaaatctgtgtgtgtgtgtgtggatagaaatggtgctttatttacaaaagttTTATGCGAAATTCCAGTTTTGAGCATAAATCTGATTAGCatatttggatgaaaacatagctattgtaAAGACAATAAAAGAAAGACATTCGAGGCAGAAACCTTAATGATTGTGCCCTACGCTGAGAGAAATGAAATCTATGGTCCCGTTAACTGAGCGGTGGGCTTTGTATTTAGTTTTTCCCTAGCGTACCCCATTCAGAAAGCATTTACAATTTCGCAACATTGGTAATATATAAACTAaacctcttttctttttttctttttattttcatcaATAAATATCTGTGACATGGGCTATGACAAAGGTTTCACATCTCTCATTACAAAGTAAGACTGGTACAGGACTTTTTAAATAGGCACATTCAGGATAATATATCA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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00046932 True 7734 lncRNA 0.37 3 6389435 6399785

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_022763 CR352329.1 coding upstream 30165 6353394 ~ 6359270 (+)
XLOC_022762 si:ch211-37e10.2 coding upstream 271086 6107901 ~ 6118349 (+)
XLOC_022761 NA coding upstream 300182 6082660 ~ 6089253 (+)
XLOC_022760 CR385039.1 coding upstream 325650 6063671 ~ 6063785 (+)
XLOC_022759 abi1a coding upstream 376649 5935377 ~ 6012786 (+)
XLOC_022765 BX120013.1 coding downstream 5409 6405194 ~ 6405316 (+)
XLOC_022766 CR790361.1 coding downstream 182267 6582052 ~ 6582168 (+)
XLOC_022767 si:dkeyp-101e12.1 coding downstream 753843 7153628 ~ 7158301 (+)
XLOC_022768 XRCC2 coding downstream 922331 7322116 ~ 7330156 (+)
XLOC_022769 kmt2ca coding downstream 936626 7336411 ~ 7549610 (+)
XLOC_022748 NA non-coding upstream 1422186 4960973 ~ 4967249 (+)
XLOC_022747 NA non-coding upstream 1880845 4504746 ~ 4508590 (+)
XLOC_022744 CU462914.1 non-coding upstream 2233036 4154959 ~ 4156399 (+)
XLOC_022770 NA non-coding downstream 1153514 7553299 ~ 7557890 (+)
XLOC_022777 NA non-coding downstream 1843239 8243024 ~ 8245079 (+)
XLOC_022778 NA non-coding downstream 1867798 8267583 ~ 8295447 (+)

Expression


Co-expression Network