LOC110529272 (tmeda)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110529272
gene name tmeda
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 4591470 ~ 4618613 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU759742
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Function

GO:

id name namespace
GO:0006810 transport biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU759742 True 2937 lncRNA 0.37 2 4591541 4594628

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G667240 NA non-coding upstream 101621 4720234 ~ 4757404 (-)
G667242 LOC106571030 non-coding upstream 103665 4722278 ~ 4751603 (-)
G667122 NA other downstream 101250 4488806 ~ 4490220 (-)
G665927 NA other downstream 921323 3668232 ~ 3670147 (-)
G665797 NA other downstream 1069847 3520790 ~ 3521623 (-)
G665718 NA other downstream 1173182 3417113 ~ 3418288 (-)
G665655 NA other downstream 1250510 3340056 ~ 3340960 (-)
znf395b LOC106571047 other upstream 930190 5535756 ~ 5551550 (-)
G668192 NA other upstream 1587945 6206558 ~ 6284021 (-)
G668238 NA other upstream 1661583 6280196 ~ 6281640 (-)
wdr21 dcaf4 other upstream 2167919 6786377 ~ 6801903 (-)
G669087 NA other upstream 2371237 6989850 ~ 6991612 (-)

Expression


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