G743447


Basic Information

Item Value
gene id G743447
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 71678685 ~ 71682299 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU843976
TTTGAATGAAGAATGTACAATTATTTTTATAAAAAGAATGCtattctgtgttggaatggtgtgggcatacccaatacaacagaatggtgtgggcataccccaacaacagaatggtgtgggcataccccaaaaacagaatggtgtgggtgtataccggtcattaaaaatattaatgtgagtagaccgctgattggccagctcacaTCATCCTCTATAACCCTCAATCTCAACTCTGGATTTCGAAGttagttccactgcattttttcattgtaccctctaatcagggactaatTTAGACCGTGGACACCAAGTGAGTGCAATTAactatcaggtagaacagaaaaccaaccGGTTTAAGCCTCAAGATCTGATTGCTGTAATTgcaaaataataataaagttCACTTGTGTGTACATAGGGGAAAGTGTTTTGTAAACAAAATGTTGAGCAGTACATGCAAAATCAATGTATTCAACAACACTTCTTAATTTACTGTACATAATATGCAACCCTCCATAGCTTATTCTCATACCTACCCACAACAATGTAGTTACTGTCTCTGCAAATATGTAATCTTGATGTATGTACCTTTGTCAAGTATAACACCCCTGTTGCCAGTGGAGACTGTACATGGAAGATACTTTGATACAAAATAATCAAGTTATTATATGTTGAATCCTGTCTTAGAGTCACCCAGGATTTTAAAGAAAGAGAATAATATTAGGCCCATTTAAATCAGACAGCAGCTTTTAATGAGATTTTATCCTGTTTACAATTGTGGTTAATTAATCTAGCGCATCTGTAGGCTTTTGTCATATTTTCTAGTGGGGTCCtatctgtagtagcagtagtatagtTGCAGCCTGCTTCATGTCACTGTTTTCAGTACTTTTCCATCTTCCCCAATGATTAAAACTGCCCCAAGGACTAAAAACAACAAATCTTAAATATTCATATAGATGTAAGACGCTAAAGTGTATTTACAAATGTCAAGCAATAAGTAAGGGCCAAATATGCCAATGTAGAATTTTGCACTTAACTTTCATCATATAGTGAAAATGGTCAGGCAGCTAGTATGATACACCTTCACTCCAGTCTCTTCAGCACCAGGAAAGACACCATTTCCACCATGAGAAAGTGAACCCAGACCCATATTGTAAACCTCCCAAATGCACAAATCAAACTTAtattatattaaaaaaaacatgaatatgCAACAAAAGTGTGACAGGTTTTGCTGCGTACCATGCTCAAGCCTGCCTTGCAAGTGTCCTAGCTGTGCATGCCACTCTTTCCCAGAGTCCCAAAGCGTgcgcgtgcgcgcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacctctatgaGCGATGTAAATACATTCTATAACAAAACAATGACATGGAGAGGGACGGAAGACATACAGTTGGTTTCCCTGACGACAAAACCTCCTGatgtgataggaggagaggcaTGGAGACAGTGGTTATCCAATGAGTTCCCCAGCTGCCTGTGCTGTGTGACGTCATAAAGGTCCTATCTATCCTATACTCCAAAAAGATCATCTAAGGCCACAATGT
>TU843977
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>TU843981
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>TU843979
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>TU843978
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU843976 False 1593 TUCP 0.39 1 71678685 71680277
TU843977 False 3207 lncRNA 0.36 1 71679093 71682299
TU843981 False 1869 lncRNA 0.36 1 71680431 71682299
TU843979 False 755 lncRNA 0.33 1 71681545 71682299
TU843978 True 278 lncRNA 0.28 1 71682022 71682299

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
abcb8 LOC106569347 coding downstream 19101 71653751 ~ 71659992 (-)
LOC110530478 LOC106599847 coding downstream 29122 71641430 ~ 71649971 (-)
zgc:92591 LOC105019623 coding downstream 216506 71461083 ~ 71462587 (-)
LOC110530476 LOC106569351 coding downstream 242356 71434344 ~ 71436737 (-)
LOC118965547 LOC106610709 coding downstream 282477 71394099 ~ 71396616 (-)
LOC118936275 LOC100136187 coding upstream 13403 71695702 ~ 71697473 (-)
LOC100136187 LOC100136187 coding upstream 22697 71704996 ~ 71706543 (-)
LOC110530481 LOC100136187 coding upstream 31461 71713760 ~ 71716272 (-)
LOC118936258 guk1 coding upstream 136121 71818420 ~ 71829182 (-)
arf1 arf1 coding upstream 153438 71835737 ~ 71837683 (-)
G743419 LOC106569346 non-coding downstream 1843 71677021 ~ 71677250 (-)
G743420 LOC106569346 non-coding downstream 2342 71676519 ~ 71676751 (-)
G743444 NA non-coding downstream 10535 71666988 ~ 71668558 (-)
G743443 LOC106569346 non-coding downstream 12201 71666163 ~ 71666892 (-)
G743442 NA non-coding downstream 13253 71665047 ~ 71665840 (-)
G743463 NA non-coding upstream 34217 71716516 ~ 71716728 (-)
G743464 NA non-coding upstream 36600 71718899 ~ 71720142 (-)
G743469 NA non-coding upstream 41786 71724085 ~ 71724293 (-)
G743488 NA non-coding upstream 59182 71741481 ~ 71748201 (-)
G743421 NA other downstream 3308 71675445 ~ 71675785 (-)
G743076 NA other downstream 608011 71070634 ~ 71071082 (-)
G742383 LOC106569128 other downstream 836636 70835358 ~ 70842457 (-)
G742038 NA other downstream 1153142 70519387 ~ 70525951 (-)
LOC110530449 NA other downstream 1478815 70198887 ~ 70200278 (-)
G743450 NA other upstream 2891 71685190 ~ 71715625 (-)
G743961 NA other upstream 495285 72177584 ~ 72177867 (-)
G744129 NA other upstream 641893 72324192 ~ 72324992 (-)
G744608 NA other upstream 1012749 72695048 ~ 72720467 (-)
G745300 NA other upstream 1699002 73381301 ~ 73381701 (-)

Expression


Co-expression Network