XLOC_032660


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_032660
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 11815169 ~ 11848486 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00065091
GGTGCATAAAGACAGAGGAGATGTCCATCTAGAGCGGGAGCTGTGCTTGcagctattgatttttttttttcctcctctttcccttctcacccctctctttctctctctccaacACAGATTTTAATCATCTCAGAACACCACATTCCCTAATACCATTAACAACACTAACCTTGCAGCGCCACAAAAGCGTTTAATTTCCAATGACACAAATTTCTCTCCAAGAGACTCAAATAGTGTCTTTACGCAATTTGCTGGCCTTAAGGTTTTGCTTCCTGGAATAATTGAATTGCGATCCTCTCACTTAGTCTTGCATAAAATCACTAGGCAAAGAGCTAATCAGTGCAAAAGAGACGATAGTTTGCCTTATTAGCCTGTTTTTAGAAAAAGTAAGGAGCATTTTTCTCACGACTGACTTTGGAGCAACTGGCGTTCAGAAACCACGTCAGACTGACAATTAGAGGAGCCGTTTGGaaacagcagaaatgtttctgttagGTGCATCTTCATCATCTATatgtggagaaagtcttgttaATATGGCGGCGATGAGGTAAACAGATAGGAAGTGATGGAGTGGCAGACCCACGGGGGAGAACCACATGAGGTGTGACAGACCACTGACATCAGCCCTTGTTCTCTTGCTCATTCGCTCACTCTCTCCCGCACACACGCTCATTTCCAGGAAGGGGTCATTAatgtgtggggaaaaaaaaactgaatctaGTCGTGGCTTTAAAATGGAGTATCTTCTCATCGAGATGCAATCATTCCTAACTGGTCTGAGTCAGACTGCAGAGCTCAGAGGAAAAGCTTTTAATTCCTCCATCCCAGAAACCAAATATACATCATTTTATCATCAAAGCATGGTTTGAAGGggcaaaaaaaagtacatttcatgttttatttcaGAGCAGCTCCCTTAAGTGGTGGCAGAGTTCATCTTAACCTGACCAATAAAGCGAGGAAACCATCCGCTTTTCAACATACCAGGCCGCTTATAAAACTACAGCATCGGTTCTAACATCCGTACAGTAGTTAAATGTTCACATTTAACAGTCGTAATTGACATTTTCCCTCGCTCCCTTCAGCAATGATATATCAAAGAGTGCATCAGCCGCCGGAGGAGGAGAGAAAACATTAGGAGGATTAATAAAGGGGGGGAGGAAAATAGATTGAGCGTTCACCAAGATCAGTAAAATAGGATCTGTCAAGCAACCCTGCAACATCCATCCTGTGGAagacgaagaaaaaaaaagacagaggTACATTTtcatggatggaaggaaggaaaaacAGAGGACAGCCTGTGCGGCTGATCAATTTCCCAAGATTAGCTTTCAGCGGCTGCGCCTGCTTCCATTTGTAaagataatattatttaataacccTTTTGGGTGACTGTTTAAATGATCGCAGTGCCTACAGTGCAAGGCGCTAATGGAAATATTTAACATAAATTCCCTTTTAAAAATGAGGCCTTAAACAACAGTTGTAAGAATTATTCTGAAATTAAAGGAGTGTGCATAAATGATTCTCCCTGGCCTTGATGCACTGCTCTCAATTACATTCTGCTCAGCTGGAACAATGGAACGACGCTAGCTTTATCGCGCACTTATATACACACATGCGCTGTTACGAATGTCATATGGAAGCTATTTATGGCTACTAGCATCGGTGCCAAGGGCATTGAAAACAAGGATGTTATTGCATCAATTCCGAATGTGCTCGCTTGGCTTTTGTTGTGCGCCTTCAAAGACAGACATGTGAAAAGCAACCAAGAGAGAGACAAAGCTGTGAGCGCTCCTCAGTCTTATTCACCTTCAACTTCTTTTTAATGATCTCATTTCAAAACACCTTCCTGCGAACCTCCCCTTTCCTGTCTGGCTAACGCTAAATTGCATAATGCCAACTGAACGCTCGCATTTGTTCTCCCTTTCCCTTCTGAGGAAATCTATTTAAATGTTTCACGCCAACTGTCAGTCTGCATCAAACCttgatttatgcaaaaacaacGTCTGCTTTAATTAGTCATTTCGCCTCAGCGCTGCCTGTGCTCTAGGCGAAGAGCGGGGTCAGACATTCGGAGGATCCTCCTTTTTGTATGATCAAAACTAGGCCATCAGCAACACCGTGGTAATAGCCGTGTCTCAACACCCTGGCAACAtgctctagtgtgtgtgtgtgtgtgctcgagTGTGTTTTTATCCCCCATGAGCCATCCATCTCCACTCAGCAGGGTGGTTTTGGGTGGAGCAGGGATAATCACAGCAGTCACTATACACCTGGAGGACTGCAAAATCATAAACAACTAACAGGTAGTTCTTCCCAGTCAGCTCTCGATACTTTCCCAGGCATCCTGAGAGTGAAAAGAAGAACAGAATAGGATGTTTACACTGCAACATTACACTAATCAAGAGAAAATGAGCTTGCATTAAAACACACCGCATTATGCACTTGTAAGGGATTAGCGTCCATGATCTTCAAAACGAAAGTAAACTGCACCATGTGTTTTTGCCGATTGCCACACTTCTTGATTATCACAATCGCAATCATGTAGTGCAAACAAAAGTGGCTGAAAGCTCCAGCTAATTTCGCCGGCTGACATTTCAGATGGAAAACTCAGCAAACAGATGCTCTGAagacactgagagagagagagagagagaaactctTGTCAGATGTTGGGGAAGTGCGTGTGAGTAACGACGATCACATGAATGGGAGGGCAGACGAACTTATTCTCACCACCAATTCTATTTCGGGCTCTGTGCAGTGCTTCGCTGACTGAAGTGGCATTGTGTCCTTTGTGAACGCATGACCCTCTGAGGTGCGTTCGTGTGCTGTGAACCTCAGCCAGGAAAAAAGCAGGAGGCTGGAGACCAGTGGAAGGCGTGGGAAAGCGACTAGCAAACGGTGGAAAAGCCGAGCGGTCTGCAGGCATTCCTTTGTGATTACACATCTGTGAAGAAGGAGGCCAGACATTCTTTCAGCCATGTCTGAAGCTGCTGACTTCTACCCTCGATCCgtttgctgctgctgttgttgttgttttttttaaactaagttGTGACTGCAGACTGCATTTCCTATGACATGCTCTGAATCAGCCCCCTTTTAACTTTTCTACTCAGTTTTACGTCTGtatgaaatctaaatttacaatgttAATTTTTGTTGCGAacgttgttattctttaggtgaaccaTTGATTTcttcaacaaaaaaagttttgcgTTTGGAGTGTTCAGTTGACGTCAACTTGACAAGTTCAACCACACTATtcttaatgaacaaataaaatcaaactaaccatatgattttgttagctcacattgctagttttgtgggggatttgttgtttttttcccagaCGTTTTTTACCCAGACGTTTAAAGATAATATacttcagagcagtaatcacaataccctaAAACCGTGAAATttttatcaaaggttatcataccgtcagaatcttataccggcccatgcctaattcaTTGTATAAAAAATTGAAATACTGAggaaatacactatttaaagtaaactgaatttaaattaattgtgtgaaatctgactTTTTAAGTGTTACAAAAATCCCTCTGTCTAccccgcaggtggggtaaatagtacatttttttattcctggcacttttggcaatactgcacagaaaccatagatCTGGCGACCGtactttcagtgctcatttgtaggagaggcttgggCATACTTGTTGGTAACcccattacattcattcattcgttttcttttcagattagtcactttattaatctggggtcgctacagcggaatgaaccgccaacttatctagcatatgtttttcgcagcagctgcccttccagctgcaacccatccctgggaaacatacacactcattcacacacatacaatttagcttacccagttcacccatttgtttttggacttgtgggggaacccaGGCCTCCTGGAGgaacacagaattgccaactgacccagctcgaaccagcgaccttcttgctgtgaggcgattgggctacccactgcgccatcgtacTGCCCCATAACCCAATTACTTTGTtaattatttggccaaaaccaaaaagtgtttgtgccccgctctccctTAACTCATCCAAAACCTTTTTtacaatctttctgaatgaaatgcctacttcaatacatccaatcagctcgcagtagaaaaacaagccacgcccactgtcttctcatttaatattctgtttctcgcagcttccggttcatgtggactttaaccacgcccctcttaccgttCATTTACTACGAGAGAATGATGCACAAAAGAAAGCTccaccccctacttaatattccatttcagttgaaagtacatcagcatactgaaagtctcagcaacttccagttcatgcaAACTTTAAGATGAACACCTAAAGTTTTTCCAAATCAGATGAGATTTCAGTGCAAGGGCACTGTGTTCAGAGCTTCCTTCCTCTTTTCCAAACATAAACCTCCGAACCCTTCCTTAATCCAGTCATCCACTGGTGGGAGGCCGAACATGACAGCAGACGGACAAGGCAAACACTGGTGGGGGTGGTGCTTGTGTTCCCTCTTTGTTCTGATGGTGACCTCTTCATTATAGGGCCTTTGTCACCATGTAAGGATTAAGAGTGAAAGAGAGCTCTTCCCCTATTAGTCAGGGTAAAAGCCTGCCTCCAAATAAAACCCTCTTGGCATCAGGGCAGTgatcttttaaaacttttattttttaaaaagaacttCCCGTTCGTGTGTCCTGATTTAAGCACACAGAGATGGACTTCTGTAAAGTaaaccagttattaaataaaGTACTTCTTAAGTAGCTTATCTCCGGCCATGATCAATGACCCAATTATAAGGAATTAATTTAATATTCtccagaaataaagtcaaaaagCCTGCTGCTTAATTAATTTAACTGTTCGGTCAAACAATGGATGCAACTGAAAACGCATTTGGTATCAGCTATCAGTCTTCTTAGACTAAgaaattgattttctttttctttctcagcTTGTGTGCGTAATGACAAATTGTTTGCCTTGGGTAATCAAATATATGAATACAGTTGGTGTATTTTAAGATATTGTAACTCGTGAGGCAACGTTGTTTTGTTTGCACatagtgttgttattattactgtcTTATTATCATGCTTTGCAATAGTTTTAATTAACACAGTGACAGCATAAATGCCATGTGGCTATGAGCAAACACAAGTGAGAGAGTGCGGATATTACTGTATCGTGCATTATGCAGCCCTCTACTGGACAATGAGACGAACAGCACAACTTAAagcaatttaaaacaaatattttaataagtgGAAATTGTGTTTGCTCAGTTCAGTGTTTCATTTTCTGGATTGATATTTAACATCTATTTACATAAAGTGAAACAAGTTTTAAAAAAGGGATAAGGAAGAATTTATTTAGCATTACTGGCTTTGTTTTCAGTAGTTTTACATCTTACAAAGTACATTCAGCACTAAGAATTAAAAGAAAAGAGGGAAAAACACCAAATTATGTACAATTTGTAATTCAAATAATAAAGattgtaacattttaaagtaGTGTTTTTTAGTCTCTTAATTGTCTCATAATACTGAGGATGTTTGGTTTTACTCTCTTAAGCTGTGTTcttattagagctgcacaatatatcatttgtgCATCGATATTGCAATTTGTGTGTCGGCAATAGttacatcgcaagatatgcaatgttgagttgggtttATAGATGACCAGGAACATCAGgtgaaaacacatgagatttaTGGAGAATTTAAGCGTAATAGAGTGAAGTTAattatgtgcatgtgtttttaaggcctgtgactattaaagcattttaagagAGTTCAAAGCATTTTAATTGAGcataaataagtttaataaagatttatttctatgcattgttaatttacatttgatcaTTCAATTTCTGTAATCTGGTTACTGTTAGACTAAATTCACTTTAAcatttgctccattgtgtttatttatgactgtattttgttcattatatgtatat
>TCONS_00063602
gtttgtttttattcacaCCGAAAGGTTCCCACAACAAAACTAACCcaaaaacattgttttacagCAATGTCAGGCAAGATAACAAATTCGACGCTTTCCTGGCAAAACATCACATTTTGCTTAAACTTCACATGACGTCACCGCTACCACATAAGACATTTCTAAACTTTCTGCCTGTAACGACATGTGCAGGTCGAGTCCTGAGACTACACGGATCCGCCAGTTAAAATTAACCAAGATGGCGTGAGGCTTGTTGTTTAGAGGGCAGAAAAAATGGAGGATATTGTAATATACACAAAGGGATAAATTTCAACAACTCGGCCAGGCGGCAGCTGCTGCTCTTTAAGGAAGCAACAAAGATAAGAGCAACGCGAAGCTCCAACTCAACACCAGCGACCCGCTCTGACTAAGCAGGCGATTTCCCGTCcaaaaaacacaccaaactgCGTGCTTAAACGCATTTCCATCAAAAGAAATTAGAAAGTAAACGCTTTTTTATCATGTTGTCTCAATGAAGAGCTGTTAGCTTATGCCATCATCTGAGAGACGGACATTAAACAGACCAAAGGTAGCTTCAGCTCCTCCAAGTGACTCTCCCGCATCGACCGTTTCAAACAAATCCTCTAAAATCAAATATTACGTTTTTACCTACCCAAAACGAACCACCGGGAAGCGCTTACTCTTTACAAAACATGTTTGGGCTCATTCGCGAGTGTTTACAAACAGTTTACGTTTAAAAACCGTAACAGTTAAAGCGCACGCGAGAGGGCACAAAGGCAGATTCCTATTATGAAGTCACAACCCCCGCGCGCAACATTGTATCCACTCGTAAAGTTTTGCGATATTCGCGGTCGCATCGGAATACGTCTCTCGGACGGCTTTTCCCGACAACACCGTCGAAATGGTTTTGACAAGTTTTCCGCTTTTTACGCTCGAGGGACACGCGAAGCCAAACCTAAAGAAACTATCGAGTTAGCTGCCCTCGCTAAGAAATCAAGCCAGCCAGCGACACAACATTGATTCTCCAATGAAATAACTGATCCAGCTCTCAATAAATTCAAAACTTACCTTTAGTTTTGACACTTCGCGTAATTCCGGCTTCGAAGTATCACTTCAGGTGCATCTTCATCATCTATatgtggagaaagtcttgttaATATGGCGGCGATGAGGTAAACAGATAGGAAGTGATGGAGTGGCAGACCCACGGGGGAGAACCACATGAGGTGTGACAGACCACTGACATCAGCCCTTGTTCTCTTGCTCATTCGCTCACTCTCTCCCGCACACACGCTCATTTCCAGGAAGGGGTCATTAatgtgtggggaaaaaaaaactgaatctaGTCGTGGCTTTAAAATGGAGTATCTTCTCATCGAGATGCAATCATTCCTAACTGGTCTGAGTCAGACTGCAGAGCTCAGAGGAAAAGCTTTTAATTCCTCCATCCCAGAAACCAAATATACATCATTTTATCATCAAAGCATGGTTTGAAGGggcaaaaaaaagtacatttcatgttttatttcaGAGCAGCTCCCTTAAGTGGTGGCAGAGTTCATCTTAACCTGACCAATAAAGCGAGGAAACCATCCGCTTTTCAACATACCAGGCCGCTTATAAAACTACAGCATCGGTTCTAACATCCGTACAGTAGTTAAATGTTCACATTTAACAGTCGTAATTGACATTTTCCCTCGCTCCCTTCAGCAATGATATATCAAAGAGTGCATCAGCCGCCGGAGGAGGAGAGAAAACATTAGGAGGATTAATAAAGGGGGGGAGGAAAATAGATTGAGCGTTCACCAAGATCAGTAAAATAGGATCTGTCAAGCAACCCTGCAACATCCATCCTGTGGAagacgaagaaaaaaaaagacagaggTACATTTtcatggatggaaggaaggaaaaacAGAGGACAGCCTGTGCGGCTGATCAATTTCCCAAGATTAGCTTTCAGCGGCTGCGCCTGCTTCCATTTGTAaagataatattatttaataacccTTTTGGGTGACTGTTTAAATGATCGCAGTGCCTACAGTGCAAGGCGCTAATGGAAATATTTAACATAAATTCCCTTTTAAAAATGAGGCCTTAAACAACAGTTGTAAGAATTATTCTGAAATTAAAGGAGTGTGCATAAATGATTCTCCCTGGCCTTGATGCACTGCTCTCAATTACATTCTGCTCAGCTGGAACAATGGAACGACGCTAGCTTTATCGCGCACTTATATACACACATGCGCTGTTACGAATGTCATATGGAAGCTATTTATGGCTACTAGCATCGGTGCCAAGGGCATTGAAAACAAGGATGTTATTGCATCAATTCCGAATGTGCTCGCTTGGCTTTTGTTGTGCGCCTTCAAAGACAGACATGTGAAAAGCAACCAAGAGAGAGACAAAGCTGTGAGCGCTCCTCAGTCTTATTCACCTTCAACTTCTTTTTAATGATCTCATTTCAAAACACCTTCCTGCGAACCTCCCCTTTCCTGTCTGGCTAACGCTAAATTGCATAATGCCAACTGAACGCTCGCATTTGTTCTCCCTTTCCCTTCTGAGGAAATCTATTTAAATGTTTCACGCCAACTGTCAGTCTGCATCAAACCttgatttatgcaaaaacaacGTCTGCTTTAATTAGTCATTTCGCCTCAGCGCTGCCTGTGCTCTAGGCGAAGAGCGGGGTCAGACATTCGGAGGATCCTCCTTTTTGTATGATCAAAACTAGGCCATCAGCAACACCGTGGTAATAGCCGTGTCTCAACACCCTGGCAACAtgctctagtgtgtgtgtgtgtgtgctcgagTGTGTTTTTATCCCCCATGAGCCATCCATCTCCACTCAGCAGGGTGGTTTTGGGTGGAGCAGGGATAATCACAGCAGTCACTATACACCTGGAGGACTGCAAAATCATAAACAACTAACAGGTAGTTCTTCCCAGTCAGCTCTCGATACTTTCCCAGGCATCCTGAGAGTGAAAAGAAGAACAGAATAGGATGTTTACACTGCAACATTACACTAATCAAGAGAAAATGAGCTTGCATTAAAACACACCGCATTATGCACTTGTAAGGGATTAGCGTCCATGATCTTCAAAACGAAAGTAAACTGCACCATGTGTTTTTGCCGATTGCCACACTTCTTGATTATCACAATCGCAATCATGTAGTGCAAACAAAAGTGGCTGAAAGCTCCAGCTAATTTCGCCGGCTGACATTTCAGATGGAAAACTCAGCAAACAGATGCTCTGAagacactgagagagagagagagagagaaactctTGTCAGATGTTGGGGAAGTGCGTGTGAGTAACGACGATCACATGAATGGGAGGGCAGACGAACTTATTCTCACCACCAATTCTATTTCGGGCTCTGTGCAGTGCTTCGCTGACTGAAGTGGCATTGTGTCCTTTGTGAACGCATGACCCTCTGAGGTGCGTTCGTGTGCTGTGAACCTCAGCCAGGAAAAAAGCAGGAGGCTGGAGACCAGTGGAAGGCGTGGGAAAGCGACTAGCAAACGGTGGAAAAGCCGAGCGGTCTGCAGGCATTCCTTTGTGATTACACATCTGTGAAGAAGGAGGCCAGACATTCTTTCAGCCATGTCTGAAGCTGCTGACTTCTACCCTCGATCCgtttgctgctgctgttgttgttgttttttttaaactaagttGTGACTGCAGACTGCATTTCCTATGACATGCTCTGAATCAGCCCCCTTTTAACTTTTCTACTCAGTTTTACGTCTGtatgaaatctaaatttacaatgttAATTTTTGTTGCGAacgttgttattctttaggtgaaccaTTGATTTcttcaacaaaaaaagttttgcgTTTGGAGTGTTCAGTTGACGTCAACTTGACAAGTTCAACCACACTATtcttaatgaacaaataaaatcaaactaaccatatgattttgttagctcacattgctagttttgtgggggatttgttgtttttttcccagaCGTTTTTTACCCAGACGTTTAAAGATAATATacttcagagcagtaatcacaataccctaAAACCGTGAAATttttatcaaaggttatcataccgtcagaatcttataccggcccatgcctaattcaTTGTATAAAAAATTGAAATACTGAggaaatacactatttaaagtaaactgaatttaaattaattgtgtgaaatctgactTTTTAAGTGTTACAAAAATCCCTCTGTCTAccccgcaggtggggtaaatagtacatttttttattcctggcacttttggcaatactgcacagaaaccatagatCTGGCGACCGtactttcagtgctcatttgtaggagaggcttgggCATACTTGTTGGTAACcccattacattcattcattcgttttcttttcagattagtcactttattaatctggggtcgctacagcggaatgaaccgccaacttatctagcatatgtttttcgcagcagctgcccttccagctgcaacccatccctgggaaacatacacactcattcacacacatacaatttagcttacccagttcacccatttgtttttggacttgtgggggaacccaGGCCTCCTGGAGgaacacagaattgccaactgacccagctcgaaccagcgaccttcttgctgtgaggcgattgggctacccactgcgccatcgtacTGCCCCATAACCCAATTACTTTGTtaattatttggccaaaaccaaaaagtgtttgtgccccgctctccctTAACTCATCCAAAACCTTTTTtacaatctttctgaatgaaatgcctacttcaatacatccaatcagctcgcagtagaaaaacaagccacgcccactgtcttctcatttaatattctgtttctcgcagcttccggttcatgtggactttaaccacgcccctcttaccgttCATTTACTACGAGAGAATGATGCACAAAAGAAAGCTccaccccctacttaatattccatttcagttgaaagtacatcagcatactgaaagtctcagcaacttccagttcatgcaAACTTTAAGATGAACACCTAAAGTTTTTCCAAATCAGATGAGATTTCAGTGCAAGGGCACTGTGTTCAGAGCTTCCTTCCTCTTTTCCAAACATAAACCTCCGAACCCTTCCTTAATCCAGTCATCCACTGGTGGGAGGCCGAACATGACAGCAGACGGACAAGGCAAACACTGGTGGGGGTGGTGCTTGTGTTCCCTCTTTGTTCTGATGGTGACCTCTTCATTATAGGGCCTTTGTCACCATGTAAGGATTAAGAGTGAAAGAGAGCTCTTCCCCTATTAGTCAGGGTAAAAGCCTGCCTCCAAATAAAACCCTCTTGGCATCAGGGCAGTgatcttttaaaacttttattttttaaaaagaacttCCCGTTCGTGTGTCCTGATTTAAGCACACAGAGATGGACTTCTGTAAAGTaaaccagttattaaataaaGTACTTCTTAAGTAGCTTATCTCCGGCCATGATCAATGACCCAATTATAAGGAATTAATTTAATATTCtccagaaataaagtcaaaaagCCTGCTGCTTAATTAATTTAACTGTTCGGTCAAACAATGGATGCAACTGAAAACGCATTTGGTATCAGCTATCAGTCTTCTTAGACTAAgaaattgattttctttttctttctcagcTTGTGTGCGTAATGACAAATTGTTTGCCTTGGGTAATCAAATATATGAATACAGTTGGTGTATTTTAAGATATTGTAACTCGTGAGGCAACGTTGTTTTGTTTGCACatagtgttgttattattactgtcTTATTATCATGCTTTGCAATAGTTTTAATTAACACAGTGACAGCATAAATGCCATGTGGCTATGAGCAAACACAAGTGAGAGAGTGCGGATATTACTGTATCGTGCATTATGCAGCCCTCTACTGGACAATGAGACGAACAGCACAACTTAAagcaatttaaaacaaatattttaataagtgGAAATTGTGTTTGCTCAGTTCAGTGTTTCATTTTCTGGATTGATATTTAACATCTATTTACATAAAGTGAAACAAGTTTTAAAAAAGGGATAAGGAAGAATTTATTTAGCATTACTGGCTTTGTTTTCAGTAGTTTTACATCTTACAAAGTACATTCAGCACTAAGAATTAAAAGAAAAGAGGGAAAAACACCAAATTATGTACAATTTGTAATTCAAATAATAAAGattgtaacattttaaagtaGTGTTTTTTAGTCTCTTAATTGTCTCATAATACTGAGGATGTTTGGTTTTACTCTCTTAAGCTGTGTTcttattagagctgcacaatatatcatttgtgCATCGATATTGCAATTTGTGTGTCGGCAATAGttacatcgcaagatatgcaatgttgagttgggtttATAGATGACCAGGAACATCAGgtgaaaacacatgagatttaTGGAGAATTTAAGCGTAATAGAGTGAAGTTAattatgtgcatgtgtttttaaggcctgtgactattaaagcattttaagagAGTTCAAAGCATTTTAATTGAGcataaataagtttaataaagatttatttctatgcattgttaatttacatttgatcaTTCAATTTCTGTAATCTGGTTACTGTTAGACTAAATTCACTTTAAcatttgctccattgtgtttatttatgactgtattttgttcattatatgtatat
>TCONS_00065092
AGAGGAGacccaggacttgaaccagtgaccttcttgctgtgagGTGCATCTTCATCATCTATatgtggagaaagtcttgttaATATGGCGGCGATGAGGTAAACAGATAGGAAGTGATGGAGTGGCAGACCCACGGGGGAGAACCACATGAGGTGTGACAGACCACTGACATCAGCCCTTGTTCTCTTGCTCATTCGCTCACTCTCTCCCGCACACACGCTCATTTCCAGGAAGGGGTCATTAatgtgtggggaaaaaaaaactgaatctaGTCGTGGCTTTAAAATGGAGTATCTTCTCATCGAGATGCAATCATTCCTAACTGGTCTGAGTCAGACTGCAGAGCTCAGAGGAAAAGCTTTTAATTCCTCCATCCCAGAAACCAAATATACATCATTTTATCATCAAAGCATGGTTTGAAGGggcaaaaaaaagtacatttcatgttttatttcaGAGCAGCTCCCTTAAGTGGTGGCAGAGTTCATCTTAACCTGACCAATAAAGCGAGGAAACCATCCGCTTTTCAACATACCAGGCCGCTTATAAAACTACAGCATCGGTTCTAACATCCGTACAGTAGTTAAATGTTCACATTTAACAGTCGTAATTGACATTTTCCCTCGCTCCCTTCAGCAATGATATATCAAAGAGTGCATCAGCCGCCGGAGGAGGAGAGAAAACATTAGGAGGATTAATAAAGGGGGGGAGGAAAATAGATTGAGCGTTCACCAAGATCAGTAAAATAGGATCTGTCAAGCAACCCTGCAACATCCATCCTGTGGAagacgaagaaaaaaaaagacagaggTACATTTtcatggatggaaggaaggaaaaacAGAGGACAGCCTGTGCGGCTGATCAATTTCCCAAGATTAGCTTTCAGCGGCTGCGCCTGCTTCCATTTGTAaagataatattatttaataacccTTTTGGGTGACTGTTTAAATGATCGCAGTGCCTACAGTGCAAGGCGCTAATGGAAATATTTAACATAAATTCCCTTTTAAAAATGAGGCCTTAAACAACAGTTGTAAGAATTATTCTGAAATTAAAGGAGTGTGCATAAATGATTCTCCCTGGCCTTGATGCACTGCTCTCAATTACATTCTGCTCAGCTGGAACAATGGAACGACGCTAGCTTTATCGCGCACTTATATACACACATGCGCTGTTACGAATGTCATATGGAAGCTATTTATGGCTACTAGCATCGGTGCCAAGGGCATTGAAAACAAGGATGTTATTGCATCAATTCCGAATGTGCTCGCTTGGCTTTTGTTGTGCGCCTTCAAAGACAGACATGTGAAAAGCAACCAAGAGAGAGACAAAGCTGTGAGCGCTCCTCAGTCTTATTCACCTTCAACTTCTTTTTAATGATCTCATTTCAAAACACCTTCCTGCGAACCTCCCCTTTCCTGTCTGGCTAACGCTAAATTGCATAATGCCAACTGAACGCTCGCATTTGTTCTCCCTTTCCCTTCTGAGGAAATCTATTTAAATGTTTCACGCCAACTGTCAGTCTGCATCAAACCttgatttatgcaaaaacaacGTCTGCTTTAATTAGTCATTTCGCCTCAGCGCTGCCTGTGCTCTAGGCGAAGAGCGGGGTCAGACATTCGGAGGATCCTCCTTTTTGTATGATCAAAACTAGGCCATCAGCAACACCGTGGTAATAGCCGTGTCTCAACACCCTGGCAACAtgctctagtgtgtgtgtgtgtgtgctcgagTGTGTTTTTATCCCCCATGAGCCATCCATCTCCACTCAGCAGGGTGGTTTTGGGTGGAGCAGGGATAATCACAGCAGTCACTATACACCTGGAGGACTGCAAAATCATAAACAACTAACAGGTAGTTCTTCCCAGTCAGCTCTCGATACTTTCCCAGGCATCCTGAGAGTGAAAAGAAGAACAGAATAGGATGTTTACACTGCAACATTACACTAATCAAGAGAAAATGAGCTTGCATTAAAACACACCGCATTATGCACTTGTAAGGGATTAGCGTCCATGATCTTCAAAACGAAAGTAAACTGCACCATGTGTTTTTGCCGATTGCCACACTTCTTGATTATCACAATCGCAATCATGTAGTGCAAACAAAAGTGGCTGAAAGCTCCAGCTAATTTCGCCGGCTGACATTTCAGATGGAAAACTCAGCAAACAGATGCTCTGAagacactgagagagagagagagagagaaactctTGTCAGATGTTGGGGAAGTGCGTGTGAGTAACGACGATCACATGAATGGGAGGGCAGACGAACTTATTCTCACCACCAATTCTATTTCGGGCTCTGTGCAGTGCTTCGCTGACTGAAGTGGCATTGTGTCCTTTGTGAACGCATGACCCTCTGAGGTGCGTTCGTGTGCTGTGAACCTCAGCCAGGAAAAAAGCAGGAGGCTGGAGACCAGTGGAAGGCGTGGGAAAGCGACTAGCAAACGGTGGAAAAGCCGAGCGGTCTGCAGGCATTCCTTTGTGATTACACATCTGTGAAGAAGGAGGCCAGACATTCTTTCAGCCATGTCTGAAGCTGCTGACTTCTACCCTCGATCCgtttgctgctgctgttgttgttgttttttttaaactaagttGTGACTGCAGACTGCATTTCCTATGACATGCTCTGAATCAGCCCCCTTTTAACTTTTCTACTCAGTTTTACGTCTGtatgaaatctaaatttacaatgttAATTTTTGTTGCGAacgttgttattctttaggtgaaccaTTGATTTcttcaacaaaaaaagttttgcgTTTGGAGTGTTCAGTTGACGTCAACTTGACAAGTTCAACCACACTATtcttaatgaacaaataaaatcaaactaaccatatgattttgttagctcacattgctagttttgtgggggatttgttgtttttttcccagaCGTTTTTTACCCAGACGTTTAAAGATAATATacttcagagcagtaatcacaataccctaAAACCGTGAAATttttatcaaaggttatcataccgtcagaatcttataccggcccatgcctaattcaTTGTATAAAAAATTGAAATACTGAggaaatacactatttaaagtaaactgaatttaaattaattgtgtgaaatctgactTTTTAAGTGTTACAAAAATCCCTCTGTCTAccccgcaggtggggtaaatagtacatttttttattcctggcacttttggcaatactgcacagaaaccatagatCTGGCGACCGtactttcagtgctcatttgtaggagaggcttgggCATACTTGTTGGTAACcccattacattcattcattcgttttcttttcagattagtcactttattaatctggggtcgctacagcggaatgaaccgccaacttatctagcatatgtttttcgcagcagctgcccttccagctgcaacccatccctgggaaacatacacactcattcacacacatacaatttagcttacccagttcacccatttgtttttggacttgtgggggaacccaGGCCTCCTGGAGgaacacagaattgccaactgacccagctcgaaccagcgaccttcttgctgtgaggcgattgggctacccactgcgccatcgtacTGCCCCATAACCCAATTACTTTGTtaattatttggccaaaaccaaaaagtgtttgtgccccgctctccctTAACTCATCCAAAACCTTTTTtacaatctttctgaatgaaatgcctacttcaatacatccaatcagctcgcagtagaaaaacaagccacgcccactgtcttctcatttaatattctgtttctcgcagcttccggttcatgtggactttaaccacgcccctcttaccgttCATTTACTACGAGAGAATGATGCACAAAAGAAAGCTccaccccctacttaatattccatttcagttgaaagtacatcagcatactgaaagtctcagcaacttccagttcatgcaAACTTTAAGATGAACACCTAAAGTTTTTCCAAATCAGATGAGATTTCAGTGCAAGGGCACTGTGTTCAGAGCTTCCTTCCTCTTTTCCAAACATAAACCTCCGAACCCTTCCTTAATCCAGTCATCCACTGGTGGGAGGCCGAACATGACAGCAGACGGACAAGGCAAACACTGGTGGGGGTGGTGCTTGTGTTCCCTCTTTGTTCTGATGGTGACCTCTTCATTATAGGGCCTTTGTCACCATGTAAGGATTAAGAGTGAAAGAGAGCTCTTCCCCTATTAGTCAGGGTAAAAGCCTGCCTCCAAATAAAACCCTCTTGGCATCAGGGCAGTgatcttttaaaacttttattttttaaaaagaacttCCCGTTCGTGTGTCCTGATTTAAGCACACAGAGATGGACTTCTGTAAAGTaaaccagttattaaataaaGTACTTCTTAAGTAGCTTATCTCCGGCCATGATCAATGACCCAATTATAAGGAATTAATTTAATATTCtccagaaataaagtcaaaaagCCTGCTGCTTAATTAATTTAACTGTTCGGTCAAACAATGGATGCAACTGAAAACGCATTTGGTATCAGCTATCAGTCTTCTTAGACTAAgaaattgattttctttttctttctcagcTTGTGTGCGTAATGACAAATTGTTTGCCTTGGGTAATCAAATATATGAATACAGTTGGTGTATTTTAAGATATTGTAACTCGTGAGGCAACGTTGTTTTGTTTGCACatagtgttgttattattactgtcTTATTATCATGCTTTGCAATAGTTTTAATTAACACAGTGACAGCATAAATGCCATGTGGCTATGAGCAAACACAAGTGAGAGAGTGCGGATATTACTGTATCGTGCATTATGCAGCCCTCTACTGGACAATGAGACGAACAGCACAACTTAAagcaatttaaaacaaatattttaataagtgGAAATTGTGTTTGCTCAGTTCAGTGTTTCATTTTCTGGATTGATATTTAACATCTATTTACATAAAGTGAAACAAGTTTTAAAAAAGGGATAAGGAAGAATTTATTTAGCATTACTGGCTTTGTTTTCAGTAGTTTTACATCTTACAAAGTACATTCAGCACTAAGAATTAAAAGAAAAGAGGGAAAAACACCAAATTATGTACAATTTGTAATTCAAATAATAAAGattgtaacattttaaagtaGTGTTTTTTAGTCTCTTAATTGTCTCATAATACTGAGGATGTTTGGTTTTACTCTCTTAAGCTGTGTTcttattagagctgcacaatatatcatttgtgCATCGATATTGCAATTTGTGTGTCGGCAATAGttacatcgcaagatatgcaatgttgagttgggtttATAGATGACCAGGAACATCAGgtgaaaacacatgagatttaTGGAGAATTTAAGCGTAATAGAGTGAAGTTAattatgtgcatgtgtttttaaggcctgtgactattaaagcattttaagagAGTTCAAAGCATTTTAATTGAGcataaataagtttaataaagatttatttctatgcattgttaatttacatttgatcaTTCAATTTCTGTAATCTGGTTACTGTTAGACTAAATTCACTTTAAcatttgctccattgtgtttatttatgactgtattttgttcattatatgtatat

Function

GO:

id name namespace
GO:0034440 lipid oxidation biological_process
GO:0006635 fatty acid beta-oxidation biological_process
GO:0006082 organic acid metabolic process biological_process
GO:0009056 catabolic process biological_process
GO:0009062 fatty acid catabolic process biological_process
GO:0044248 cellular catabolic process biological_process
GO:0046395 carboxylic acid catabolic process biological_process
GO:0043436 oxoacid metabolic process biological_process
GO:0055114 oxidation-reduction process biological_process
GO:0019395 fatty acid oxidation biological_process
GO:0019752 carboxylic acid metabolic process biological_process
GO:0016054 organic acid catabolic process biological_process
GO:0044444 obsolete cytoplasmic part cellular_component
GO:0005739 mitochondrion cellular_component
GO:0070279 vitamin B6 binding molecular_function
GO:0030170 pyridoxal phosphate binding molecular_function
GO:0003994 aconitate hydratase activity molecular_function
GO:0003824 catalytic activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00065091 False 6073 lncRNA 0.40 2 11815169 11823475
TCONS_00063602 False 6695 lncRNA 0.41 2 11815169 11831074
TCONS_00065092 True 5621 lncRNA 0.40 2 11815169 11848486

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_032659 march7 coding downstream 2945 11765341 ~ 11812224 (-)
XLOC_032658 NA coding downstream 55301 11722431 ~ 11759868 (-)
XLOC_032657 gulp1b coding downstream 200830 11497646 ~ 11614339 (-)
XLOC_032656 pjvk coding downstream 383539 11422044 ~ 11431630 (-)
XLOC_032655 NA coding downstream 396705 11417253 ~ 11418464 (-)
XLOC_032661 tanc1a coding upstream 188465 12036951 ~ 12172424 (-)
XLOC_032662 pkp4 coding upstream 348700 12197186 ~ 12296170 (-)
XLOC_032663 si:dkey-276j7.1 coding upstream 450702 12299188 ~ 12314488 (-)
XLOC_032664 gpd2 coding upstream 531180 12379666 ~ 12459449 (-)
XLOC_032665 CR376780.1 coding upstream 565729 12414215 ~ 12414329 (-)
XLOC_032653 NA non-coding downstream 565315 11248505 ~ 11249854 (-)
XLOC_032652 BX539326.1 non-coding downstream 613043 11202009 ~ 11202126 (-)
XLOC_032649 BX548046.2 non-coding downstream 737560 11077114 ~ 11077609 (-)
XLOC_032671 NA non-coding upstream 1222413 13070899 ~ 13071419 (-)
XLOC_032680 NA non-coding upstream 1891894 13740380 ~ 13746402 (-)
XLOC_032681 NA non-coding upstream 1912880 13761366 ~ 13778704 (-)
XLOC_032682 CU929360.1 non-coding upstream 1916824 13765310 ~ 13765427 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000024_02527094_02528611 NA coding CI01000024 null 2526504 ~ 2529011 (+)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G108778 NA non-coding NC_035909.1 CM008312.1 4604694 ~ 4607409 (+)