XLOC_033504 (plekho2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_033504
gene name plekho2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 13527396 ~ 13572981 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00065567
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>TCONS_00065568
GGCGAAAGTTTATCGACGGAATTCCTGGCGTTTCGAGGCTGTCTAGATAGTCATCACACTGCGCTTTGAGACGCGGCCCTGGTGTCTCTTTTTGGCAGAGGCAGAGGCTTTTGGGGACTTACCGgaaaccaaactttttttttttcaagcctcAAACTTGTAGCTGCTGCAGAAGTCGAAAGAGGAAAAAGAGCAGCAGAGTCCCGTTACATTTCAGCTCGTCGTACGCAGTTCcttgtttttttctccttcttcttcttcatcgTCATGTTGAATGTGGGAAAGTTGAGACGAAGAGCGATCAACAGTTTTAACCCGAGATAAAGTCCTGCGTCGAGCCTTTTTTCTCCTGCGCATAACGGGATCTTTGTTTTTATAACATGGAAGATGGTGTGAAAGAGGAACCAGCCAAGCCCAAAGAGGTGAAGAGCGCAGAGAAGGCCGGCTGGTTGAAGAAGTCTTCAGGGAAGTTCTTGAGCAGCTACAAGGACAGATACATTCAGCTGGACCGAACCGCCATCGCCGTCTACGAGAATGAGGAATTAACAACATGCCTGGAGAAACTGGAACTGGACAACTACGAGACGTGCCATGAGCTGAAGAGTGCATTCAAGAAGAAACACAGGCTGGTACTAATACGAAGCCCCAAGAGCGGTAACAAGgttcaagATGTCAAACTTCAGGCACCGACTCCTGAGGAGAAGGAGGCCTGGATCAAGGCGCTGTGTGAAGGAATTAATAAGGCAAAGAACAAAGTTTTTGATGAGGTGAAAGTTGATGAAAGTAGTACTTTAGAGCATGTCACACGGGACCGGCCTAAAGGGAACCGTGGAAGAAGACCACCTACGAGGATACACATGAAGGAGGTTGCAAATGTTTCCAATGATGGAATGTTGAGACTAGACCTTGATGGGGAGGTTACTATGCTCAATGGAACCCATACCTTGAATAAAGAAGGGGATAAACAGACTGAAACTTCTAAACCAGCCGTAACATTGAACAACATCCAGGAGGAGGACGCTGAAGAGGAACCCACACCCCAGAAGAAAGTTAAGCCGCCCATGCCTCCATCAAAAGATAATAAACCCAGTGAAAGCATAAAAGAGGATGAGCCCAAAAACGAGGAGCCTGCACCACAGAAGAACATTGTTACGCCACCGATGCCTCCATCCAAGAAGTCCAAACCTAGCATCTCTCTGGAGTCTGAAGCAGACAGCACCGACTCTTCTGAATCAACCCCATCCAACAAGGGCATCCAGCCTCCAGCTCCGCCTTCGAAACATATGAAACCCAACCAACAGGTAACACCAGCCACAGTCACAACAGACCAAAAAGAAACCCAAGAGAAAAACGAGGAGGTTGACGATGATGCAGGTACTAAAGTCAATGGAGCTTCAAAGGAGAAAGAGGACCAGGACAAACCAGAAGAAGTCGAAATCTTGATTCTTTCCAAACAAGTCATGAAACCTCAAGTAGTGATGTGGGACTCACCCGTAGTTGTATCAAAAGATGCCGAAAAAGAGGCGAAAAGCGCAAAGAAGGTCTCTGATATTACAAAAGAAGTTACAACCACAACAGAACCACAGCAGTTGAATCCAGCTCCAAGTTCAACACCTGAATCTGTTAAAAAGAGTCCCGGGCCTCCTGCTCCACCCAAGAAGAAGCCAATTAAGGCACCAGACAAAAAGGAGGACACTCCCCACCAAGGTGACCAACCGGTCCTTTCGGATTCTTCTAATGTGTCTTTGAAAAAGGTCTCGGAGCAGTCTTTCAAAAAGGACGATCCCAAATTGACAATTCCAGATCACAAAACTGAGCCAGTTGGTGATGTTTCAAGTGAAGAAATGGAGGAGAAGTCTTTAGACAGTGGACAGCACTCAGGAGAGGAGTCTGAGACCGGTGACCAAGTTACGCCATCCTCCACAAAGCTCAAAGGAAGCTCCCAGGGATTAGATTTGGAGACCAGCGAGGATGATCTAGAACCATCTGACAGCAAAGCCGAGAGTTTGGAGGACCCATCGTTAGAAACTCCGTCCGTCACCCCAGAGACCTCAGTTCTCAGTGCACATCCAACCCCAAACCAATGCTCCAACAAGTCCATGTCCCGCACTTTGCCTCTCAGTCCCTCCTCCAAGGGTCGTTCTGCATCCCTTGGAGACCTTCTTTCTGAGAGCACCGAGAGAATGGAAAGCAAGGGAAAACCACAAGGAAGTGAGCTCAAGGTCTTGCAAAGCAAAGTGTCTATTGAGATTGAAAAGACGGGAGAGCTGCTGAATGCAATCGCGACCGGACAGAGTGAAGACAAGGAGGAAGCAAGCCCAGAGATGCTGCTAGCTGCAGCCATGGAGAAGCTTAGGAAAGCCGATCAGTTCCTAAAGGAAGCCAGAAGCTTTAAAGATCCAAAGGGCAGCAACAGATTAAGTTTGTAATGGTAAGTGTTGGTGGACAGAACCTGTAGGGATGATCCATGCTGAAAATGCAATACACAGTATGAAAATGATCAAATCAAGAACTTACCCCTCTCCATTTTCTAATCCCAGAGCTACTTTTTAAACCTCGCTAGGCCAGGTTAGCTAGCTAAAGTAGATGTGTAGCTTCAACAGTGTGTGCTAATGTAGCAGATGCATCAAGGGCATCTGATCCTGCTCCTGGATTTCCACTTTCCTTCACTTGCCTGCAAGTCCAACAACGTTTTTCAGGTCTAAAAAGCTGGATTAGCTGATCCACGATTGTTGTTGAAAGTTGTTCTACTTTctactttaaaataacatttggaaAAGGGATACCCaacttggtcctgaagggccagtgtcctgcagagattagttccaaccccaattagacacacttCAACCAGCTTATTAAGCTAGTTCTAGATATACAAGAAACTTTCATGTAGGAAGTTGAAGGAAGTTGTAGCTAAGctatgcaggacactgaccctccgccgagtttggacatccctgaccTACAATGTCGCTTGAAGTCTGACATCCAACCTGTGAACTTGGGGCAGATCCAAGAACTCTGACCTCAGGAAATCTCTTAATTTGACGTCACTTTATAGATGGCGACTAGTTCTATTTCAGTGAGATTGGCACAGAACATGTAAAAATAAACCCTTAAGTATTTTTATAGCACAAAAGATGTGCGGAACCCCACCAGTAAAGGCTATTTTTTAGATGATATCGCTTTTTAGTATTAAGGTCTGCGCAGGACTGTTATTTCATTCCCACTCCAGCTGGGTTTTATTTCCGCTCCCTCTATTTATTCACTTTAAGCTTCCCGCTGAGTCTATCGTCTGACCACTCAAACCTGTtcaaattaaacagaaaaattaaCCCGCGCTCAATATGGTCTGGAATGCAGACCTAAATTTTAgtgcatttacttttttttaaaggacaacAAGCATTTTTGTTCTATTTGGTTTAGCCATATCAACATGACGTGTTATGAAATATTCACGTTTTATGTTCTGAAAATACAACTGTGTGCACAATCGACTGGAAAGTCAGAAGTTAGACATTTCACTAATGAAATTTCTACTTCCGACAATGTGTCTGAAGCACAGCATGTCTTAATGTTGGGAGATGGGAAGGTCCACTCCTCTGACCTGTAAAGTTGCTCAAGCGATAGAAGTTAGGGGCCATGGTCTAtggcctccttgttagagcaacccactcccatgcggaaggtcgccagattgataccagcttggagcgggttgggtggtgtaggaccggtggggttacattggtgccgtgacccggatgagagtgaggtttaggggagtgagtgtaacagaggccagctaatgaattgctgtgcaggtaaacctcacttctctgacctctaaggttgctctagcgacagacactagggGCAATAGACTTTAGcgtccttgttagagcaaccgactcccatgcggaaagtcgccggttcaataccagctcggagcaggttgggtggcgtaggactggcggggttacattatACTATTGTAAAAATTGTGATGACTAAATTGGATCATGTGAGGCACCTCGCAGCCAATCACATGGGGTCTGGTGTCCTTCCCTACATAACGCAAAAAAGTCAGTGTTAGCTTTAAGCCgctgtcacactgcactttttctCCCATAGAATTCCAATCATACGCATACAAATACCACAGatcggaaacgcaagcttgtgcagCAAGTTTCGCAAATTTGCTGCTTTGCAAAGTTCCAGCTTGCTGAACTCTGACttgtgaaatcgcatcacgtgaTTGCATGAGActaatagaagatcaaaacatgacctctctggacagaaatgtaaaaaaaaaattgacgaatcgctcgctttttaagtatttaatcgtcttgtttaatcctgcctctTTTAACAGCaccatacgacagaattttgcacgctcaaactctagtgtgaccatgcCTTTAGTGATTATGTTCTTGGCTAATGGCTGCAGGCTTGccttggttcaggtgtgtttaattagagttaaactatgcaggacagtggccctccaggaacaagatgaTACTGCAAGTTGCTGGTAGGATGATAAACTAGTTTCTCTCCTAACTAAGTAAAAGAATAGCAAAAATTGTACGGGCTACATGTTCTGTTGTAGTGAAACATGAAAATTGCTAGCCAATTAGCATTCCTTCTGCTGTGTCGAGTACTGTGGTTTTAGCTTGTTTCAGTTGAACAGTTACAATTTCTCTTTTATATCCCATATATTTTGATCTTTTGATATTAGGCACTTTTGTTCGATTTGTTGTACACATAAAATGTGATTTCCTTTTAGGATCACAAACCCTCATTGATCACGTGCACATAATCACTATTGGGAATTGTTAGCTTTTTATGCTAACTGCACTGTAACTCCTATGTAAAAGGAGGAGTGGACAAATGTGTGAAATGTCAGTCATTAAGCTCTTTTGTTGCTAGCAAGCAGTTAGTAAAAGGGAGAAATCAATTGGGAGAGATAT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Function

symbol description
plekho2 Orthologous to human PLEKHO2 (pleckstrin homology domain containing O2).

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-120406-4 Orthologous to human PLEKHO2 (pleckstrin homology domain containing O2).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000016774

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00065567 False 3652 mRNA 0.42 3 13527396 13552874
TCONS_00065568 True 9183 mRNA 0.40 6 13527971 13572981

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_033503 arih1l coding upstream 12659 13491452 ~ 13514737 (+)
XLOC_033502 dagla coding upstream 40018 13382852 ~ 13487378 (+)
XLOC_033501 CU571326.1 coding upstream 187128 13340143 ~ 13340268 (+)
XLOC_033500 syt7b coding upstream 189113 13039426 ~ 13338283 (+)
XLOC_033499 slc25a22b coding upstream 527483 12976173 ~ 12999913 (+)
XLOC_033505 ankdd1a coding downstream 9275 13582256 ~ 13618498 (+)
XLOC_033506 clpxa coding downstream 66492 13639473 ~ 13679937 (+)
XLOC_033507 pdcd7 coding downstream 111031 13684012 ~ 13737618 (+)
XLOC_033508 rasl12 coding downstream 183234 13756215 ~ 13782279 (+)
XLOC_033509 NA coding downstream 224663 13797644 ~ 13800139 (+)
XLOC_033496 CABZ01068862.1 non-coding upstream 674179 12853103 ~ 12853217 (+)
XLOC_033493 CU914775.1 non-coding upstream 1355150 12172129 ~ 12172246 (+)
XLOC_033492 NA non-coding upstream 1657812 11868634 ~ 11869584 (+)
XLOC_033491 NA non-coding upstream 1707818 11689658 ~ 11819578 (+)
XLOC_033511 NA non-coding downstream 289328 13862309 ~ 13865084 (+)
XLOC_033515 CU467822.1 non-coding downstream 708112 14281093 ~ 14281225 (+)
XLOC_033517 NA non-coding downstream 741370 14314351 ~ 14370213 (+)
XLOC_033520 FP101884.1 non-coding downstream 1559996 15132977 ~ 15133091 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000105_01455252_01472737 NA coding CI01000105 null 1455252 ~ 1472992 (+)