XLOC_036762


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_036762
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 49864078 ~ 49871582 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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>TCONS_00072533
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TTACTTTGCCATTTCAGATAAGCTCGGCAGCAATAACATCCCGTCAGCTTCCAGAAGCTTTTAATTAGAGTTGCTCAACTGTAAAACTACATAATGTCCAGTTCTATATACACATATCATGTATACTTATAGATATAGCTGCAGTTTGTCACTGTTGATCACCATGCTAGCTTCACGTTCTGTGCTTTGTATCAGATGACAGGACCAAATCTGTCCAGAAAAGTACTTATTTTCCTCCTCATAGTCGTTTTTGTTCGTTTTTCGTGAAGCTGCTGATTCCTATTTGTTGTTAAGATCGGTGTACTTAAATATCCAGCTGTGAACTTGGTCCAGACGTTTAGGGTGGTCAACCATTCTGGGATTTTGTTCTTGGTAAACTAAACAGTAGTCACTTCTTTCAATTCAATGTTCAGAAAAACATCAGTCATAGTCAGCGTACACGGACACGAATCCCTGCCAGTGTGTCTAGATGTTTACATGGAGAAGAGGAGCAGGACAACAGAGTTAAAGCTGCAGAAGAAAAGGTTTTAGATGGGATAGAGGAGGAGGGGGGGGTCGGAGATTCAGGAATACACTTGAAGTCCCACACGTTCCTTATGTTTATCCCAGGATGTCCAGATAGACTGGTGATGCCTTGGCTAGGTTGAGAAGTAGGTTATGGATCTCTTTAATATTGAGTCGGGTGTGCGGCTCTCTCTGCCAACATCCCAGCATCAAGTCATACACCTCCTTGGGACAGGTCCGGGGTCGCTGCAGTACACGACCTTGGGTGATGCACTCGATCACCT

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00072532 False 6218 lncRNA 0.38 2 49864078 49870677
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TCONS_00072535 False 6349 lncRNA 0.38 5 49864078 49871582
TCONS_00072534 False 6285 lncRNA 0.38 5 49864078 49871582
TCONS_00072533 True 5788 lncRNA 0.39 6 49864078 49871582

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_036761 NA coding downstream 38161 49803988 ~ 49825917 (-)
XLOC_036760 hnrnpk coding downstream 97837 49744801 ~ 49766241 (-)
XLOC_036759 C8H9orf64 coding downstream 120561 49730163 ~ 49743517 (-)
XLOC_036758 gkap1 coding downstream 135324 49706387 ~ 49728754 (-)
XLOC_036757 frmd3 coding downstream 159020 49638595 ~ 49705058 (-)
XLOC_036763 agtpbp1 coding upstream 14056 49885638 ~ 49935513 (-)
XLOC_036764 antxr1a coding upstream 195220 50066802 ~ 50133064 (-)
XLOC_036765 si:ch73-132k15.2 coding upstream 262425 50134007 ~ 50135544 (-)
XLOC_036766 NA coding upstream 265893 50137475 ~ 50139983 (-)
XLOC_036767 hp coding upstream 271612 50143194 ~ 50147948 (-)
XLOC_036746 CT737131.1 non-coding downstream 711603 49149904 ~ 49152475 (-)
XLOC_036745 NA non-coding downstream 799039 49043744 ~ 49065039 (-)
XLOC_036743 NA non-coding downstream 1066046 48795458 ~ 48798032 (-)
XLOC_036742 BX323556.1 non-coding downstream 1073491 48778961 ~ 48790587 (-)
XLOC_036772 NA non-coding upstream 637179 50508761 ~ 50511887 (-)
XLOC_036773 CABZ01060030.1 non-coding upstream 646200 50517782 ~ 50517903 (-)
XLOC_036776 FO704819.1 non-coding upstream 1018007 50889589 ~ 50898357 (-)
XLOC_036777 NA non-coding upstream 1082076 50953658 ~ 50954244 (-)

Expression


Co-expression Network