G1977284


Basic Information

Item Value
gene id G1977284
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048589.1
NCBI id CM023243.3
chromosome length 47542702
location 35036122 ~ 35037921 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2260331
AGGGTGTATGGTATGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAGGGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGAGTATTAGGGGGTATGGTAAGAGTATTAGTGTGTATGGTATGGTAATGGTATTAGTGTGTATGGTATGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAGGGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAGGGGTATTAGGGTGTATGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGAGTATTATGGTGTATGGTATGGTAGGGGTATTAGGGTGTCTGCTTTGGTAAGGGTATTAGTGTGTATGGTATGGTAAGAGCATTAGGGTGTCTGCTTTGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAGGGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAAGAGTATTACGGTGTATGGTATGGTAAGAGTATTAGGGTGTCTGCTTTGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGATATGGTAAGAGTATTAGGGTGTCTGCTTTAGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAGGGGTATTAGGGTGTATGGTAAGAGTATTACGGTGTATGGTATGGTAAGAGTATTAGGGTGTCTGCTTTGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAGGGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAGGGGTATTACGGTGTATGGTATGGTAAGGGTATTACGGTGTATGCTTTGGTAAGAGTATTAGGGTGTATGGTTTGGCAAGGGTTTTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAGGGGTATTAGGGTGCATGGTTTGGTAAGGGTTTTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATATGGTTTGGTAAGGCTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAAGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAAGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAAGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTACGGTGTATGGTAAAGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTAGGGTGTATGGTTTGGTAAGGGTATTACGGTGTATGGTAAAGGTATTAGGGTGTATGGTATGGTAGGGTGTGTGgtagtgtcgtgtctttactatcattaaatgaagacttttagtttttatcaaagattctctgtaattagtattacgcgattaaatcatgattaatcatgtaactgtaattaactaggaagtcggggcacc

Function

NR:

description
PREDICTED: stress protein DDR48-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2260331 True 1527 lncRNA 0.41 2 35036122 35037921

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110505824 snap23 coding upstream 265102 34750884 ~ 34771020 (+)
tmem121aa LOC106602575 coding upstream 350383 34681732 ~ 34685739 (+)
tedc1 LOC106611146 coding upstream 558975 34457515 ~ 34477147 (+)
dnal1 dnal1 coding upstream 583535 34446701 ~ 34452841 (+)
LOC110504337 NA coding upstream 1747514 33282986 ~ 33288608 (+)
LOC100305155 LOC106611282 coding downstream 50773 35088694 ~ 35100987 (+)
LOC110505832 mta1 coding downstream 129227 35167148 ~ 35240181 (+)
LOC110505833 LOC106611286 coding downstream 211398 35249319 ~ 35289164 (+)
LOC110504234 LOC106602716 coding downstream 501876 35539797 ~ 35611701 (+)
LOC110504235 LOC106611305 coding downstream 826649 35864570 ~ 35866787 (+)
G1977281 NA non-coding upstream 26392 35009509 ~ 35009730 (+)
G1977265 NA non-coding upstream 52557 34983207 ~ 34983565 (+)
G1977258 LOC106611279 non-coding upstream 61741 34973442 ~ 34974381 (+)
G1977257 NA non-coding upstream 63462 34972025 ~ 34972660 (+)
G1977256 NA non-coding upstream 68301 34966224 ~ 34967821 (+)
G1977298 NA non-coding downstream 9312 35047233 ~ 35051796 (+)
G1977318 NA non-coding downstream 57098 35095019 ~ 35095474 (+)
G1977321 NA non-coding downstream 70688 35108609 ~ 35108809 (+)
G1977324 NA non-coding downstream 75701 35113622 ~ 35113829 (+)
G1976689 NA other upstream 304811 34730027 ~ 34731311 (+)
G1976680 NA other upstream 332228 34701980 ~ 34703894 (+)
G1976575 NA other upstream 554201 34481519 ~ 34481921 (+)
G1976574 LOC100194703 other upstream 554843 34480904 ~ 34481279 (+)
G1976573 LOC100194703 other upstream 555225 34480030 ~ 34480897 (+)
G1978080 NA other downstream 988612 36026533 ~ 36027737 (+)
LOC110505847 LOC106611313 other downstream 1351350 36376220 ~ 36824709 (+)
LOC110504241 dnah14 other downstream 2180340 37161387 ~ 37222396 (+)
hivep2b LOC106611354 other downstream 2226859 37264780 ~ 37311200 (+)
G1980026 NA other downstream 2683213 37721134 ~ 37729904 (+)

Expression


Co-expression Network