G1772


Basic Information

Item Value
gene id G1772
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053112.1
NCBI id CM020909.1
chromosome length 48724115
location 5340592 ~ 5345899 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU2428
tgacatagtttgggttgtcttgattatgacaagttgacattatgtcatcctggttaatgtcaagttgtcttaataaggacacacCAAAGAAagttaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaattaatgtcactttgattaatgtgaagttgtcataatcaagacaactcaaacaatgtcaacttttcatgatcAAGACAactcaaacaatgtcaacttttcatgaccaaaacaacttctggtaatgtcactttgattaatgtcaacttgtcatgatcAAGACAactcaaacaatgtcaacttgtcatgaccaagacaactcaaacaatgtcaacttgtcatggccaagacaacttctggtaatgtcactttgattaatgtcaacttgtcataatcaagacaactcAAActatgtcaacttgtcatggcCAAGCAACTTCTGGTTaattaatgtcactttgattaatatcaacttgtcataatcaagacaactcaaacaatgtcaacttgtcatggccaagcaacttctggtaatgtcactttgattaatgtcaacttgtcataaacAAGACAACTCAAActatgtcaacttgtcatgaccaaaacaacttctggtaatgtcacttagattaatgtcaacttgtcataatcaagacaactcAAActatgtcaacttgtcatgacaaaaaccgaatgacacttaatgacagaagtcataaacgttcatgacttgtttataaggtttatgacgCGTTCATGGCCGTGTGATGTCACAGTTATGACAGTGtgatgtcacgattatgtcgataccttcaagtgaagtGTGACCTTTCTTTCCTTAACGTAAAACGCTCCAGTTTTCGACCGTCTGTCAGTGTTATTGCTCGTGATAACGTGCCTTTCGTTCCTTCACAGCGTCTCTTATGTTATCAGCCGTTCAGACTTGTCCTCTTTTAACTCGTGTGTTGACCCGTGTTAATATCAGAGATATGGGTTttctgtggccgggttggctccgtgggtagagcgggcgcacgtATGCTGAGAGGCTCATGCCTCGACGCAGacgtccagggttcgagtccgacctgtgatgatttcctgcatgtctcacCTAAGCTGTCCTAGCAATTAAAGgcgaaaaagccccaaaaatatgggtttcttacaaccaaattgcccccaaaataacttggatgtATGTTGTTCGCAGGTCAAATTAATGATTGTTTACATTgatttttgggtgttttattcaattttattagcctggtcctaccagactctggtacactagcctggtcctaccagactctagtactgtagcctggtcctaccagactctgttccattagcctggtcctaccagactctagtactgtagcctggtcctaccagactctgttccattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctagtactgtagcctggtcctaccagactctgttccattagcctggtcctaccagactctagtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtacattagcctggtcctaccagactctggtacactagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtacactagcctggtcctaccagactctggtacacttgcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctgctacgctagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtacattagcctggtcctaccagactctggcactgtagcctggtcctaccagactctggtacattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactgtggtccattagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactgtggtccattagcctggtcctatcagactctggtacatacttttaaagggaatgggagatgatctctgattggttgattgcatgttacgcgaaaaaaaaacacctctgattaatgaagacactaagtacaaccctttagaaccaggtgCCCGtgcacacagacccttttttccattCTTTTCCATATTTTGGACACTAAATTTGGCCCTAAATGCgcttacatcgttaaaatagggcccagcgAGTGTCAGTAATtcacgagttgggagtgagaacgtgtCGATCGATCGCTTCGTTTTTGAAACCACCTGCCGCTCTTTATCGTGCGTTTTAAAGATGGGAAAACGGTGACGAGCTACAGCTCTTCTCATTCACCTGTTTTTACTTTGATCACATCAAACATTTACGCCAAATGACAAAAAGGCCAAAAGACTCGGAAACCGAGTCGAGACGCTTCCTACTAAAAACCTTGTTGTTGCTAACGCTAATTAGCtcattttgtttgtgtgaaatAACAACactgtttaaaggtgccctgccacacgtatttcatgactttgtggtgatgtctgaaggtctaccatggactctgtaaccttggttaccttgtttcaagccattctagcgcggtatagaaagcctgcacgAAGATtcggctcgatttctgccagttatcattaatattcaacgagctaagctgtttgaatctgattggctagcagctagccaatgagagcctggttatcagaatcctttaccccagcccaactgggcgagctcatgaatagtaatgagctcaggcagtatgatgtcagactgaccagcttctgtgattggtctgatttctctgcttatttctgttcagtgtctagagctgacagaggaggcagcagttcattttcacattcaccacataacacaaacacatatggaccttaCATATCtcaaaaaatgcaagtcaaaacggttttgtatggcagggcaccttttaataACACTTTACAGCCCTTCAGTTCCCAAAAACTCTAGATTTGTAAACTGCTTTATACGCCGACTGCCTGAAGATATTGTATTTTGTTGTAATTATTCTTATTTTGGAGAGATAACGAGTTTTTTAAGCaactctttgtgtgtttttttggtgACAGACTTGTATGATGCAGGTATATAGATTCTCTGTTTTACTTGAAAGgtgaagtttttattttttggggggggtttcCGCTGGTGTTGTAAAGGCTCTGAcgcaccaaccagacggccggcCCTCGGCAGGAAAGCCAGTCGGAccgatcagtctccccgagttggtccaaaactcacgtcacgtgggtctggcttctcccgaatttcaaagccGGACCATTAATGGCgtctcgttcggaatacgatctcgtatttcacgaaaatagttcaccgaaacgtgtttgtGTAAAAACTTTTTaggagagaaataggccgtgcagttgctgaatctcatttcagatcaacaaaggtcagtttttttaagattttcctcagattttgagaggagTTGGtcaggctcatcccgctcgtcgtTTCCGGTAATTGgtcattttaaaggtcccatgacatgatgctccttggatgcttttatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatataggccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttataaagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatataggccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctctttaatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaaatctcaaGAACTCATACTAATGTTAAAAagcctcataaagtgaaattgtcatgccatgggacctttgacATAAgcgcactgattcgctagtcaagggctagcactccaccaatcagattggtcattgagtccggcCGCCCAccggccgattcaacaagtcaaatcggcccaaattaaagccgacggctcctcagactgacgacggcacggaaacgcaccgaacagactctcgccagactgtccgaagGCCGATAAATCGGGTTGGTGCGTCAGCGCCCTTAAGACGTACGTAGATGTACGTGACTTTACCTCTCGGCACTACGTAACACTTTGGGggttttctgccttttttgCCAAAATGATCATCTCAAACTTGTCGTGTTCGTGGGAAACGGAGGGAAAACTTTTGGGggattttgtgttgtgtttctgtaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaggggtgaaCAGATGCACACGTGTATAGTTTTTAAGTATTAAAGCAGATCTATTTATAAGCGTATGTGGTGTAATTTAAGGGAAATTTTGTGGGAAGCAAATTAAGTGAAAAGCAAATTATTTAGGGACTTCTAGTTGAGCCCGAAAGATCAAAACATTACTTATGTGACGTTATTAAGCTTTCCTTGTAAAATCTATGTAGAAAATGACT
>TU2429
tgacatagtttgggttgtcttgattatgacaagttgacattatgtcatcctggttaatgtcaagttgtcttaataaggacacacCAAAGAAagttaatgtcaacttgtcatgaccaagacaacttctggttaattaatgtcactttgattaatgtgaagttgtcataatcaagacaactcaaacaatgtcaacttttcatgaccaagacaacttctggttaattaatgtcactttgattaatgtcaacttgtcatgatcAAGACAactcaaacaatgtcaacttgtcataatcaagacaactcaaacaatgtcaacttgtcatggccaagcaacttctggtaatgtcactttgattaatgtcaacttgtcataaacAAGACAACTCAAActatgtcaacttgtcatgaccaaaacaacttctggtaatgtcacttagattaatgtcaacttgtcataatcaagacaactcAAActatgtcaacttgtcatgacaaaaaccgaatgacacttaatgacagaagtcataaacgttcatgacttgtttataaggtttatgacgCGTTCATGGCCGTGTGATGTCACAGTTATGACAGTGtgatgtcacgattatgtcgataccttcaagtgaagtGTGACCTTTCTTTCCTTAACGTAAAACGCTCCAGTTTTCGACCGTCTGTCAGTGTTATTGCTCGTGATAACGTGCCTTTCGTTCCTTCACAGCGTCTCTTATGTTATCAGCCGTTCAGACTTGTCCTCTTTTAACTCGTGTGTTGACCCGTGTTAATATCAGAGATATGGGTTttctgtggccgggttggctccgtgggtagagcgggcgcacgtATGCTGAGAGGCTCATGCCTCGACGCAGacgtccagggttcgagtccgacctgtgatgatttcctgcatgtctcacCTAAGCTGTCCTAGCAATTAAAGgcgaaaaagccccaaaaatatgggtttcttacaaccaaattgcccccaaaataacttggatgtATGTTGTTCGCAGGTCAAATTAATGATTGTTTACATTgatttttgggtgttttattcaattttattagcctggtcctaccagactctggtacactagcctggtcctaccagactctagtactgtagcctggtcctaccagactctgttccattagcctggtcctaccagactctagtactgtagcctggtcctaccagactctgttccattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctagtactgtagcctggtcctaccagactctgttccattagcctggtcctaccagactctagtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtacattagcctggtcctaccagactctggtacactagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtacactagcctggtcctaccagactctggtacacttgcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctgctacgctagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtacattagcctggtcctaccagactctggcactgtagcctggtcctaccagactctggtacattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactgtggtccattagcctggtcctatcagactctggtacactaacctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactctggtactgtagcctggtcctaccagactgtggtccattagcctggtcctaccagactctggtccattagcctggtcctaccagactgtggtccattagcctggtcctatcagactctggtacatacttttaaagggaatgggagatgatctctgattggttgattgcatgttacgcgaaaaaaaaacacctctgattaatgaagacactaagtacaaccctttagaaccaggtgCCCGtgcacacagacccttttttccattCTTTTCCATATTTTGGACACTAAATTTGGCCCTAAATGCgcttacatcgttaaaatagggcccagcgAGTGTCAGTAATtcacgagttgggagtgagaacgtgtCGATCGATCGCTTCGTTTTTGAAACCACCTGCCGCTCTTTATCGTGCGTTTTAAAGATGGGAAAACGGTGACGAGCTACAGCTCTTCTCATTCACCTGTTTTTACTTTGATCACATCAAACATTTACGCCAAATGACAAAAAGGCCAAAAGACTCGGAAACCGAGTCGAGACGCTTCCTACTAAAAACCTTGTTGTTGCTAACGCTAATTAGCtcattttgtttgtgtgaaatAACAACactgtttaaaggtgccctgccacacgtatttcatgactttgtggtgatgtctgaaggtctaccatggactctgtaaccttggttaccttgtttcaagccattctagcgcggtatagaaagcctgcacgAAGATtcggctcgatttctgccagttatcattaatattcaacgagctaagctgtttgaatctgattggctagcagctagccaatgagagcctggttatcagaatcctttaccccagcccaactgggcgagctcatgaatagtaatgagctcaggcagtatgatgtcagactgaccagcttctgtgattggtctgatttctctgcttatttctgttcagtgtctagagctgacagaggaggcagcagttcattttcacattcaccacataacacaaacacatatggaccttaCATATCtcaaaaaatgcaagtcaaaacggttttgtatggcagggcaccttttaataACACTTTACAGCCCTTCAGTTCCCAAAAACTCTAGATTTGTAAACTGCTTTATACGCCGACTGCCTGAAGATATTGTATTTTGTTGTAATTATTCTTATTTTGGAGAGATAACGAGTTTTTTAAGCaactctttgtgtgtttttttggtgACAGACTTGTATGATGCAGGTATATAGATTCTCTGTTTTACTTGAAAGgtgaagtttttattttttggggggggtttcCGCTGGTGTTGTAAAGGCTCTGAcgcaccaaccagacggccggcCCTCGGCAGGAAAGCCAGTCGGAccgatcagtctccccgagttggtccaaaactcacgtcacgtgggtctggcttctcccgaatttcaaagccGGACCATTAATGGCgtctcgttcggaatacgatctcgtatttcacgaaaatagttcaccgaaacgtgtttgtGTAAAAACTTTTTaggagagaaataggccgtgcagttgctgaatctcatttcagatcaacaaaggtcagtttttttaagattttcctcagattttgagaggagTTGGtcaggctcatcccgctcgtcgtTTCCGGTAATTGgtcattttaaaggtcccatgacatgatgctccttggatgcttttatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatataggccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttataaagaccttagtggtcccctaatactatatctgaagtctcttttatataggccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatataggccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctcttttatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaagtctctttaatatagaccttagtggtcccctaatactgtatctgaaatctcaaGAACTCATACTAATGTTAAAAagcctcataaagtgaaattgtcatgccatgggacctttgacATAAgcgcactgattcgctagtcaagggctagcactccaccaatcagattggtcattgagtccggcCGCCCAccggccgattcaacaagtcaaatcggcccaaattaaagccgacggctcctcagactgacgacggcacggaaacgcaccgaacagactctcgccagactgtccgaagGCCGATAAATCGGGTTGGTGCGTCAGCGCCCTTAAGACGTACGTAGATGTACGTGACTTTACCTCTCGGCACTACGTAACACTTTGGGggttttctgccttttttgCCAAAATGATCATCTCAAACTTGTCGTGTTCGTGGGAAACGGAGGGAAAACTTTTGGGggattttgtgttgtgtttctgtaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaggggtgaaCAGATGCACACGTGTATAGTTTTTAAGTATTAAAGCAGATCTATTTATAAGCGTATGTGGTGTAATTTAAGGGAAATTTTGTGGGAAGCAAATTAAGTGAAAAGCAAATTATTTAGGGACTTCTAGTTGAGCCCGAAAGATCAAAACATTACTTATGTGACGTTATTAAGCTTTCCTTGTAAAATCTATGTAGAAAATGACT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2428 False 4729 lncRNA 0.49 4 5340592 5345899
TU2429 True 4881 lncRNA 0.42 2 5340592 5345899

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120563443 NA coding upstream 143475 5180196 ~ 5197117 (+)
LOC120563472 NA coding upstream 160850 5158881 ~ 5179742 (+)
LOC120563603 stxbp6 coding upstream 391480 4947658 ~ 4949112 (+)
LOC120563657 NA coding upstream 401122 4856686 ~ 4939470 (+)
zgc:172076 NA coding upstream 533885 4783353 ~ 4806707 (+)
btbd3a LOC103354797,LOC102313104,LOC101466369,LOC100710091,LOC102793615,LOC104954790 coding downstream 15452 5361351 ~ 5371770 (+)
ndufaf5 ndufaf5 coding downstream 155133 5501032 ~ 5518108 (+)
LOC120564466 NA coding downstream 243770 5589669 ~ 5591008 (+)
LOC120564476 NA coding downstream 260555 5606454 ~ 5607801 (+)
LOC120563910 NA coding downstream 444398 5790297 ~ 5803234 (+)
G1773 LOC108251774,LOC106535048,LOC107394211 non-coding upstream 121 5335347 ~ 5340471 (+)
G1782 NA non-coding upstream 16103 5324236 ~ 5324489 (+)
G1780 NA non-coding upstream 21288 5318782 ~ 5319304 (+)
G1759 NA non-coding upstream 43927 5284816 ~ 5296665 (+)
G1771 NA non-coding upstream 55248 5282947 ~ 5285344 (+)
G1784 NA non-coding downstream 3213 5349112 ~ 5414538 (+)
G1786 NA non-coding downstream 29679 5375578 ~ 5377774 (+)
G1774 NA non-coding downstream 32241 5378140 ~ 5379265 (+)
G1787 NA non-coding downstream 55632 5401531 ~ 5779880 (+)
G1791 NA non-coding downstream 128534 5474433 ~ 5475665 (+)
LOC120563544 LOC100708833,LOC102313704,LOC101466655,LOC102192550 other upstream 12675 5235346 ~ 5327917 (+)
G1756 NA other upstream 117848 5218068 ~ 5222744 (+)
G1600 NA other upstream 301878 4977783 ~ 5038714 (+)
G1487 LOC103369331 other upstream 880188 4455207 ~ 4460404 (+)
pex6 pex6,LOC104944420,LOC104961583 other upstream 904506 4408438 ~ 4436086 (+)
G1775 NA other downstream 26718 5372617 ~ 5374907 (+)
acaa1 acaa1,LOC102793903 other downstream 41494 5387393 ~ 5471409 (+)
snrpb2 snrpb2 other downstream 530648 5876547 ~ 5916374 (+)
LOC120573424 lgalsl,LOC104947409 other downstream 1039702 6385601 ~ 6402640 (+)
aftpha LOC102296338,LOC102796226,LOC101483123,LOC102200161 other downstream 1061501 6407400 ~ 6437217 (+)

Expression


Co-expression Network