G138105


Basic Information

Item Value
gene id G138105
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053124.1
NCBI id CM020921.1
chromosome length 39224300
location 32641641 ~ 32699309 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU185981
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>TU185986
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>TU185988
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>TU185989
CCCCACTCCTTCTCAACATGTACTTTGGATGCCGGATgattcacttcacaggtgtagGTAGACAAGTCACTCCGTAAAATCTCCACGCTGTCTCGTCTCTGGTAGGTCTCGTCACCATTGGGTCGAACGCCGGAGGACACAACTCCGTCAGCTGGAGTTAGAACACGGCCGTTCCTTTTCATGTGCAGGGTGATTTCTTTTGGTAAGAAACCTGTGGCCAGGCACGTCAAAAGGATGTTTGCTTCAACTTTGGTGTTCCTTGTAAACAGGTGAACCtgccggtgttagttagctaacgttagcttgttaactccgccttaacgttacctcctcgccacatcgttg
>TU185990
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>TU185992
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU185981 False 410 lncRNA 0.42 2 32653315 32689954
TU185983 False 410 lncRNA 0.42 2 32653315 32689954
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TU185990 False 2862 lncRNA 0.40 12 32641641 32696269
TU185992 True 3093 TUCP 0.41 12 32641641 32696269

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120571112 NA coding upstream 54199 32573800 ~ 32587442 (+)
LOC120571114 NA coding upstream 105964 32454197 ~ 32535677 (+)
LOC120571110 NA coding upstream 111759 32516456 ~ 32529882 (+)
LOC120571111 NA coding upstream 129015 32483050 ~ 32512626 (+)
LOC120571113 NA coding upstream 190122 32430414 ~ 32451519 (+)
LOC120571107 LOC100707240,LOC102312923,LOC102203509,LOC101472130 coding downstream 11532 32710841 ~ 32731554 (+)
LOC120570938 NA coding downstream 45280 32744589 ~ 32761985 (+)
LOC120572046 NA coding downstream 457512 33156821 ~ 33160537 (+)
LOC120572051 NA coding downstream 492072 33191381 ~ 33195543 (+)
LOC120570944 NA coding downstream 982298 33681607 ~ 33688186 (+)
G138083 NA non-coding upstream 87076 32552011 ~ 32554565 (+)
G138068 NA non-coding upstream 234618 32406664 ~ 32407023 (+)
G137981 NA non-coding upstream 357748 32282111 ~ 32283893 (+)
G137983 NA non-coding upstream 359663 32281455 ~ 32281978 (+)
G137970 NA non-coding upstream 496150 32144610 ~ 32145491 (+)
G138111 NA non-coding downstream 7533 32706842 ~ 32707949 (+)
G138116 NA non-coding downstream 16681 32715990 ~ 32718124 (+)
G138117 NA non-coding downstream 33501 32732810 ~ 32740022 (+)
G138118 NA non-coding downstream 38936 32738245 ~ 32857673 (+)
LOC120571116 NA non-coding downstream 92518 32791827 ~ 32853611 (+)
LOC120571115 NA other upstream 75479 32538277 ~ 32566162 (+)
G138076 NA other upstream 136665 32430410 ~ 32504976 (+)
LOC120571558 NA other upstream 637961 31995001 ~ 32003680 (+)
LOC120570800 NA other upstream 958189 31617595 ~ 31683452 (+)
G137773 NA other upstream 1704784 30921166 ~ 30936857 (+)
G138130 NA other downstream 284453 32983762 ~ 33020409 (+)
LOC120572048 NA other downstream 463067 33162376 ~ 33200180 (+)
G138177 NA other downstream 463107 33162416 ~ 33195323 (+)
LOC120570940 NA other downstream 819456 33518765 ~ 33519270 (+)
LOC120572068 NA other downstream 831496 33530805 ~ 33531621 (+)

Expression


Co-expression Network