LOC120575027


Basic Information

Item Value
gene id LOC120575027
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 26089652 ~ 26091008 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU214405
AGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTGCCCACACAAGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTAC
>XM_039825610.1
gaTGTCTGCtatgaaaaaggtccatactaCCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTGCCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAAGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAAGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATTCTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTGCCCACACAAGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCCCAAAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTAGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAGAACCAATACTACCCACAAAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGtgggtttaaaggtcccatggcatgaaaatgtcactttatgaggttttttaacattaatatgcgttccc
>XM_039825611.1
ggaactgagccatcgttaaggttatcaatttcagctgtgcttttcttactatgacaagtcaagaTGTCTGCtatgaaaaaggtccatactaCCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTGCCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTGCCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAAGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAAGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATTCTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTGCCCACACAAGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACAGAGGTGGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAAAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTAGAGTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGTGGGTTTAATTATAGAACCAATACTACCCACAAAGGTGGGTTTAATTATACAACCAATACTACCCACACAGGtgggtttaaaggtcccatggcatgaaaatgtcactttatgaggttttttaacattaatatgcgttccc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU214405 False 317 lncRNA 0.38 2 26089931 26090355
XM_039825610.1 True 1259 mRNA 0.38 2 26089714 26091008
XM_039825611.1 False 1069 mRNA 0.38 2 26089652 26091008

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120575277 LOC102297800,LOC102193357,LOC103367484 coding upstream 79538 26003768 ~ 26010114 (+)
LOC120575039 pacrg,LOC107697704,LOC107583491,LOC107695182 coding upstream 91894 25996025 ~ 25997758 (+)
dnase1 dnase1l2 coding upstream 102866 25977292 ~ 25986786 (+)
LOC120575190 prpsap2,LOC103393631 coding upstream 211233 25864573 ~ 25878419 (+)
traf7 traf7 coding upstream 385884 25684331 ~ 25703768 (+)
LOC120575028 LOC101073513,LOC103367474,LOC104931113 coding downstream 14995 26106003 ~ 26108214 (+)
LOC120575029 LOC101073513,LOC103367474,LOC104931113 coding downstream 22151 26113159 ~ 26115434 (+)
syt5a LOC105920779,LOC103358649,LOC101481810,LOC102228091,LOC102207842 coding downstream 51527 26142535 ~ 26161155 (+)
LOC120574687 NA coding downstream 111959 26202967 ~ 26226046 (+)
LOC120575278 NA coding downstream 159835 26250843 ~ 26268502 (+)
G158187 LOC103376870 non-coding upstream 41191 26040679 ~ 26048461 (+)
LOC120574899 NA non-coding upstream 72137 26014235 ~ 26017515 (+)
G158179 NA non-coding upstream 90899 25998529 ~ 25998753 (+)
G158075 NA non-coding upstream 101326 25869170 ~ 25988326 (+)
G158045 NA non-coding upstream 363171 25646198 ~ 25726481 (+)
G158204 NA non-coding downstream 26140 26117148 ~ 26118657 (+)
G158205 NA non-coding downstream 28096 26119104 ~ 26119546 (+)
G158259 NA non-coding downstream 237183 26328191 ~ 26492312 (+)
G158245 NA non-coding downstream 249631 26340639 ~ 26344484 (+)
G158292 NA non-coding downstream 513079 26604087 ~ 26609349 (+)
G158184 NA other upstream 53488 26032304 ~ 26036164 (+)
zgc:158403 LOC103370216,LOC106932766 other upstream 686600 25383364 ~ 25403052 (+)
G158004 NA other upstream 721940 25330435 ~ 25367712 (+)
srsf2b LOC104946423,LOC101476251,LOC100695205 other upstream 886817 25197648 ~ 25202835 (+)
LOC120575219 NA other upstream 987141 25083281 ~ 25102511 (+)
G158276 NA other downstream 364630 26455638 ~ 26469767 (+)
G158291 nsf,LOC101477540,LOC102297066,LOC100697603 other downstream 484631 26575639 ~ 26628036 (+)
LOC120575279 NA other downstream 1308868 27399876 ~ 27400968 (+)
smg1 smg1 other downstream 1510785 27601793 ~ 27661623 (+)
G158612 NA other downstream 1957504 28048512 ~ 28052449 (+)

Expression


Co-expression Network