LOC120574120 (LOC103367371)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120574120
gene name LOC103367371
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 29531400 ~ 29544306 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039824228.1
ACTCAGGACTTCCTCAGCAGAGCGGACTCTAGGCTACAGCGCAATCATGGACGAAAGTGCTCCACGTCCTGGCCGCTCTATGTTTGCGTGGCTGGTGGGAGCGTCACAGTTGCTGGGTGTGGCGTCCGTGGTGCTGACCGGCGTGTGGATGGGTCACTACCGCGGGGGCTTCGCCTGGGACGGCTCAGGGCGGGAGTTTAACGTGCACCCTCTGTGCATGGTGCTGGGACTGGTCTTCCTGCAGGGCGACGccaTCCTGGTCTACAGAGTTTTCCGCAATGAGGCGAAGAGGAACGTAAAGGTGCTTCATGGCATCATCCACCTGCTGGCCCTCATCATCAGCATCGTAGgtactGTAGCTGTGTTTGACTTCCACAGAGCATCAAAGACCCCAGACATGTACACTCTACACAGCTGGTGCGGCATGGCTACCTTAGTCTTATTCTCcatacagTGGGTGATGGGTTTGCTGTTCTTCCTCTTTCCTGTTGCGTCGTCATGGTTACGAGCCTCATACCTGCCCATCCACGTGTTCAGCGGTCTGGTTCTGCTGGTTATGGCCATAGGGAGCAGCCTGCTCGGCATCACGGAGAAACTCCTCTTCAGCATCATgccGACCTACTCTCAGTTTGCCTCAGAGGGGGTGCTGGCCAACATCTTGGGGATCCTGCTGGTGGGTTTCGGGGTGCTGCTGGGCTACCTGATCACCAAGGAGGAGTTCAGGCGTCCGCCGAACCCAGAGGAAGAGGCTCTGTCTGTCCACTTCAAGACCCTGACGGAGGGGGGGTCCCCCACCTCGCCGTGACCCCCAGCGGGACGTCTGACACCTCCCTGTCGCCTGGATACCAACAGTGTCCCGCCAACCTATCTGACCCATTTGATCTCAGATTACTGAACAGACCGGTCAAGGAAGAAAAAACAAGTTcggactttaatctcagaaatctgagaataaagtcagaattctgacttgaCTTTGTTCTAAGTCAGAATTTTGAGAataaactcaaatacattttttcacgtggccctaatcctcttcagCTGTCAATAATTAATGTTAAATCTAGCCGCATTTAAACTTGGTTGTTGCCCGGTTTGTTTGGACCACTTTTTTAAGTTTATGGTCTGTACTCAGTTACAGGTCATCTGTGAGGGATGAAGCTCCGTTCTGTAACACCACTGTCCAATCAGAGTAGGCTGAACGTTTTTGTAGTCCAAACTAAATCAACCAAACTCTAAATCAAGTGATATGTCCGGGGCCACATTCTCGAAGTTAAACTTTAATTTGTATCATATCAATAATTTAAGATCAACTTTATAGTTTTAATATAGAGCCGTCAGTATTTGGATGAAGTAGCTCGTGAAAAATATAGTTTGCCAAGTTTAGTAGTCCACACCTGTTCAATATGCTGGATACGTATCTAATcaacatttcatattttctgtTATATAGTTATGTATACTGAGCATCCTTggcaaaaacatttcttttttggttgaaataagTTGGTGCTCTAGTGTGCACTGATTGGCTGTGTCATTTAGGTAAATATCATGTATTTGTATATTGGCACATACTCAATATTAAATAACTCAGACCGGTAGGGCCAAAATAACTTGATGTAGACATCCCTAGTTGGCACTATTGTCTGTTACACACCAAAAGTCAAACTGATGCTCACATTTGAGAATCTCCACCCATATGCAGATGACATCTTAATTTTCACTAAGTCGTAATGTCTAAATAAAATCCAGCCCTTTGCACAGAATCTGAGTGAACTTATTCTGCAACTGGCCAAGCGATCATCCAAGATAGGCGTAATCTAAAGGGGGGAttgtcaaaactggccagtgtaATACCCTCAAATAtctaataataatttccttttacataaataaagatgtttgcaccataacttgatgcagaaaaggcacacatTCTTGCATAAACATTCACTACAACGCAGCAAATTAAGTATTTAatatgctcaaaatttcaagTCTGCTAAAAGTCTCAAATTGGTCCATTAGTTAGCGGTTTGTATTTAAATGGTCTGTCATGTTTAATATATCTGTTCAGTGTGTattcacatgtactgtatgtggttaGTTTGTTAACTTGATGCACTTTTACCTAAAGATGTTAAAttcatgtctttgtgtgtgtgtaaccaatTTATGTATAACATGTtgctacagtttttttttgttttggcttGACTTCAGGACGCCGCACCAGTGCCTAATACAAAAGCCTTTACTGAAAATGAACTGGACGTTGTTTGCCTTATGTATTTCTTActgaagaggattagggccacatgtgaaaaatttATTTGAGGTTTGAGTTTAAAGTGAGAATTCTGACTTCAtcctcagattttttttcttcagaattCTGTGTTCAAAGTCGGAATTCTAAGAAAAATCTCAGAATTCCGACTTTAAATTCAGAACTTGAATTCATTTTTCACGTGTGGCCCTAATCGTCTTTCGCAATTTCTTGACAGTGTCATCTTTGAAAGAGAAGTTTAAATCTTATTGGGACAACCTGAAGTAAATAATAACGTGTGAAACTTGATGCTTTTGGTCCAGTTGTGTTTTTAACACCTGACTTAAACTTCTGATATAATCTTAGATGTTAAAGCTGCATCATGTGTGTGggtttaactatttatttaaaaGCAATGATAACGCATTTAAAATCCTTACATTTGAATGCCCCAGAGGAACCTTCAGAAATGGGCTGCAATCGCACCCAGTATCTAAGAAATACTGTAGCTAAccacaattaaaaataaataaattacaagagta
>XM_039824229.1
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>XM_039824230.1
CCGAAAGAGTTTATATGGTCTTTAGAGAAAAGAAATATTTGCTCCAGCTGCGTAGCCTTTAGGTACAATTCAGATCATGGACGAAAGTGCTCCACGTCCTGGCCGCTCTATGTTTGCGTGGCTGGTGGGAGCGTCACAGTTGCTGGGTGTGGCGTCCGTGGTGCTGACCGGCGTGTGGATGGGTCACTACCGCGGGGGCTTCGCCTGGGACGGCTCAGGGCGGGAGTTTAACGTGCACCCTCTGTGCATGGTGCTGGGACTGGTCTTCCTGCAGGGCGACGccaTCCTGGTCTACAGAGTTTTCCGCAATGAGGCGAAGAGGAACGTAAAGGTGCTTCATGGCATCATCCACCTGCTGGCCCTCATCATCAGCATCGTAGgtactGTAGCTGTGTTTGACTTCCACAGAGCATCAAAGACCCCAGACATGTACACTCTACACAGCTGGTGCGGCATGGCTACCTTAGTCTTATTCTCcatacagTGGGTGATGGGTTTGCTGTTCTTCCTCTTTCCTGTTGCGTCGTCATGGTTACGAGCCTCATACCTGCCCATCCACGTGTTCAGCGGTCTGGTTCTGCTGGTTATGGCCATAGGGAGCAGCCTGCTCGGCATCACGGAGAAACTCCTCTTCAGCATCATgccGACCTACTCTCAGTTTGCCTCAGAGGGGGTGCTGGCCAACATCTTGGGGATCCTGCTGGTGGGTTTCGGGGTGCTGCTGGGCTACCTGATCACCAAGGAGGAGTTCAGGCGTCCGCCGAACCCAGAGGAAGAGGCTCTGTCTGTCCACTTCAAGACCCTGACGGAGGGGGGGTCCCCCACCTCGCCGTGACCCCCAGCGGGACGTCTGACACCTCCCTGTCGCCTGGATACCAACAGTGTCCCGCCAACCTATCTGACCCATTTGATCTCAGATTACTGAACAGACCGGTCAAGGAAGAAAAAACAAGTTcggactttaatctcagaaatctgagaataaagtcagaattctgacttgaCTTTGTTCTAAGTCAGAATTTTGAGAataaactcaaatacattttttcacgtggccctaatcctcttcagCTGTCAATAATTAATGTTAAATCTAGCCGCATTTAAACTTGGTTGTTGCCCGGTTTGTTTGGACCACTTTTTTAAGTTTATGGTCTGTACTCAGTTACAGGTCATCTGTGAGGGATGAAGCTCCGTTCTGTAACACCACTGTCCAATCAGAGTAGGCTGAACGTTTTTGTAGTCCAAACTAAATCAACCAAACTCTAAATCAAGTGATATGTCCGGGGCCACATTCTCGAAGTTAAACTTTAATTTGTATCATATCAATAATTTAAGATCAACTTTATAGTTTTAATATAGAGCCGTCAGTATTTGGATGAAGTAGCTCGTGAAAAATATAGTTTGCCAAGTTTAGTAGTCCACACCTGTTCAATATGCTGGATACGTATCTAATcaacatttcatattttctgtTATATAGTTATGTATACTGAGCATCCTTggcaaaaacatttcttttttggttgaaataagTTGGTGCTCTAGTGTGCACTGATTGGCTGTGTCATTTAGGTAAATATCATGTATTTGTATATTGGCACATACTCAATATTAAATAACTCAGACCGGTAGGGCCAAAATAACTTGATGTAGACATCCCTAGTTGGCACTATTGTCTGTTACACACCAAAAGTCAAACTGATGCTCACATTTGAGAATCTCCACCCATATGCAGATGACATCTTAATTTTCACTAAGTCGTAATGTCTAAATAAAATCCAGCCCTTTGCACAGAATCTGAGTGAACTTATTCTGCAACTGGCCAAGCGATCATCCAAGATAGGCGTAATCTAAAGGGGGGAttgtcaaaactggccagtgtaATACCCTCAAATAtctaataataatttccttttacataaataaagatgtttgcaccataacttgatgcagaaaaggcacacatTCTTGCATAAACATTCACTACAACGCAGCAAATTAAGTATTTAatatgctcaaaatttcaagTCTGCTAAAAGTCTCAAATTGGTCCATTAGTTAGCGGTTTGTATTTAAATGGTCTGTCATGTTTAATATATCTGTTCAGTGTGTattcacatgtactgtatgtggttaGTTTGTTAACTTGATGCACTTTTACCTAAAGATGTTAAAttcatgtctttgtgtgtgtgtaaccaatTTATGTATAACATGTtgctacagtttttttttgttttggcttGACTTCAGGACGCCGCACCAGTGCCTAATACAAAAGCCTTTACTGAAAATGAACTGGACGTTGTTTGCCTTATGTATTTCTTActgaagaggattagggccacatgtgaaaaatttATTTGAGGTTTGAGTTTAAAGTGAGAATTCTGACTTCAtcctcagattttttttcttcagaattCTGTGTTCAAAGTCGGAATTCTAAGAAAAATCTCAGAATTCCGACTTTAAATTCAGAACTTGAATTCATTTTTCACGTGTGGCCCTAATCGTCTTTCGCAATTTCTTGACAGTGTCATCTTTGAAAGAGAAGTTTAAATCTTATTGGGACAACCTGAAGTAAATAATAACGTGTGAAACTTGATGCTTTTGGTCCAGTTGTGTTTTTAACACCTGACTTAAACTTCTGATATAATCTTAGATGTTAAAGCTGCATCATGTGTGTGggtttaactatttatttaaaaGCAATGATAACGCATTTAAAATCCTTACATTTGAATGCCCCAGAGGAACCTTCAGAAATGGGCTGCAATCGCACCCAGTATCTAAGAAATACTGTAGCTAAccacaattaaaaataaataaattacaagagta

Function

NR:

description
PREDICTED: cytochrome b561

GO: NA

KEGG:

id description
K08360 CYB561; transmembrane ascorbate-dependent reductase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039824228.1 False 2820 mRNA 0.42 6 29531400 29544306
XM_039824229.1 True 2904 mRNA 0.43 6 29531854 29544306
XM_039824230.1 False 2850 mRNA 0.42 6 29532087 29544306

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pex12 pex12,LOC102797618 coding upstream 106064 29418968 ~ 29425336 (+)
col1a1a col1a1,LOC104944135 coding upstream 204940 29299412 ~ 29326460 (+)
LOC120574190 NA coding upstream 315607 29212465 ~ 29215793 (+)
LOC120574186 NA coding upstream 332778 29171995 ~ 29198622 (+)
LOC120574188 NA coding upstream 375022 29123210 ~ 29156378 (+)
LOC120575283 NA coding downstream 138982 29683288 ~ 29757671 (+)
LOC120574202 NA coding downstream 245491 29789797 ~ 29956543 (+)
LOC120574205 NA coding downstream 363990 29908296 ~ 29914682 (+)
LOC120574207 NA coding downstream 392617 29936923 ~ 29941595 (+)
LOC120575284 LOC105940647 coding downstream 515577 30059883 ~ 30069034 (+)
G159079 NA non-coding upstream 6009 29525139 ~ 29525391 (+)
G159077 NA non-coding upstream 16430 29514517 ~ 29514970 (+)
G159075 NA non-coding upstream 33938 29497157 ~ 29497462 (+)
G159071 NA non-coding upstream 76913 29449144 ~ 29454487 (+)
G159063 NA non-coding upstream 97558 29431242 ~ 29433842 (+)
G159082 NA non-coding downstream 3819 29548125 ~ 29549217 (+)
G159083 NA non-coding downstream 14821 29559127 ~ 29560165 (+)
G159084 NA non-coding downstream 23216 29567522 ~ 29567891 (+)
G159085 NA non-coding downstream 38255 29582561 ~ 29582762 (+)
G159087 tanc2 non-coding downstream 48371 29592677 ~ 29592980 (+)
G159073 hdac5 other upstream 59801 29468925 ~ 29471599 (+)
LOC120575282 NA other upstream 148783 29365843 ~ 29382617 (+)
LOC120574189 LOC103364161 other upstream 323713 29200580 ~ 29207687 (+)
LOC120574944 LOC104926834,LOC101476208,LOC100703712,LOC103358663,LOC108247076,LOC106525245 other upstream 545753 28960147 ~ 28985647 (+)
mettl22 mettl22 other upstream 615471 28886918 ~ 28915929 (+)
LOC120574203 NA other downstream 688398 30232704 ~ 30246893 (+)
LOC120575288 NA other downstream 696004 30240310 ~ 30303552 (+)
mpp2a mpp2,LOC101475212,LOC100701914 other downstream 921482 30465788 ~ 30483713 (+)
G159484 csnk1d,LOC106596082,LOC106595407,LOC103154369 other downstream 1608253 31152559 ~ 31158441 (+)
G159833 NA other downstream 2887443 32431749 ~ 32445464 (+)

Expression


Co-expression Network