G180166


Basic Information

Item Value
gene id G180166
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053128.1
NCBI id CM020925.1
chromosome length 37416781
location 34343293 ~ 34348784 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU244042
cctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtccccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccgt
>TU244043
cctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatatctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtgtgtgtgtatctctgtgtgtgtgtgtgtatctctgtgtgtgtgtgtg
>TU244044
cctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatatctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtgtgtgtgtgtgtatctctgtgtgtgtgtgtgtatctctgtgtgtgtgtgtg
>TU244045
gtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgggtgt
>TU244046
gtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctatctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatatctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtccggtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtccccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccgt
>TU244047
cctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtccccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccgt
>TU244048
gtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctatctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatatctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtccccgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtccgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU244042 False 251 lncRNA 0.52 2 34348186 34348784
TU244043 False 234 lncRNA 0.48 2 34348186 34348455
TU244044 False 238 lncRNA 0.48 2 34348186 34348455
TU244045 False 276 lncRNA 0.50 2 34343293 34346498
TU244046 True 487 lncRNA 0.51 4 34343293 34348784
TU244047 False 225 lncRNA 0.52 2 34346336 34348784
TU244048 False 404 lncRNA 0.50 4 34343293 34348784

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120545262 NA coding upstream 296669 33997411 ~ 34046624 (+)
LOC120545261 NA coding upstream 394042 33936243 ~ 33949251 (+)
LOC120545095 NA coding upstream 437131 33899181 ~ 33906162 (+)
LOC120545260 NA coding upstream 444236 33894650 ~ 33899057 (+)
LOC120545259 NA coding upstream 463634 33872512 ~ 33879659 (+)
LOC120545317 NA coding downstream 223035 34571819 ~ 34948439 (+)
fktn fktn coding downstream 429070 34777854 ~ 34797178 (+)
si:ch211-202f5.2 NA coding downstream 501817 34850601 ~ 34851604 (+)
LOC120545265 man2a1 coding downstream 637886 34986670 ~ 35023782 (+)
LOC120545273 NA coding downstream 785687 35134471 ~ 35143485 (+)
G180163 NA non-coding upstream 32014 34310611 ~ 34311279 (+)
G180160 NA non-coding upstream 46746 34294914 ~ 34296547 (+)
G180159 NA non-coding upstream 81115 34258173 ~ 34262178 (+)
LOC120545350 NA non-coding upstream 131808 34209549 ~ 34211485 (+)
LOC120545347 NA non-coding upstream 137439 34198447 ~ 34205854 (+)
G180174 NA non-coding downstream 122625 34471409 ~ 34473459 (+)
G180194 NA non-coding downstream 164962 34513746 ~ 34540775 (+)
G180197 NA non-coding downstream 193873 34542657 ~ 34544486 (+)
G180198 NA non-coding downstream 196542 34545326 ~ 34548922 (+)
G180203 NA non-coding downstream 224757 34573541 ~ 34611303 (+)
slc25a46 slc25a46,LOC102789456 other upstream 14030 34318593 ~ 34329263 (+)
slc31a1 slc31a1 other upstream 34499 34282844 ~ 34308794 (+)
G180043 NA other upstream 503906 33838192 ~ 33839387 (+)
G180040 NA other upstream 517955 33824342 ~ 33825338 (+)
dmtn LOC102797496,LOC102303313,LOC101469122,LOC102075582 other upstream 598100 33708725 ~ 33745193 (+)
G180199 NA other downstream 208798 34557582 ~ 34560385 (+)
G180201 NA other downstream 216096 34564880 ~ 34565952 (+)
G180213 fktn other downstream 367502 34716286 ~ 34803750 (+)
G180216 NA other downstream 458474 34807258 ~ 34814910 (+)
G180268 NA other downstream 604280 34953064 ~ 34955966 (+)

Expression


Co-expression Network