G180422


Basic Information

Item Value
gene id G180422
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053128.1
NCBI id CM020925.1
chromosome length 37416781
location 36231811 ~ 36311558 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU244488
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtatatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtctctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtg
>TU244491
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtctctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtctctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtg
>TU244492
atctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctctgtgtgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtctctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtg
>TU244493
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtatatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtatatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtg
>TU244494
gtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtctctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtg
>TU244496
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtatatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtctgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtctctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtg
>TU244497
atctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtg
>TU244498
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU244488 True 408 lncRNA 0.49 3 36231811 36311558
TU244491 False 356 lncRNA 0.50 4 36301222 36311558
TU244492 False 330 lncRNA 0.48 3 36274942 36311558
TU244493 False 292 lncRNA 0.49 4 36231811 36311558
TU244494 False 316 lncRNA 0.50 2 36310359 36311558
TU244496 False 350 lncRNA 0.49 4 36231811 36311558
TU244497 False 228 lncRNA 0.49 3 36274942 36311558
TU244498 False 214 lncRNA 0.50 3 36301222 36311558

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120545314 NA coding upstream 571984 35645554 ~ 35659827 (+)
LOC120545274 NA coding upstream 623692 35260196 ~ 35608119 (+)
LOC120545268 NA coding downstream 51444 36363002 ~ 36381752 (+)
capslb capsl coding downstream 72455 36384013 ~ 36457532 (+)
LOC120545293 NA coding downstream 773787 37085345 ~ 37090520 (+)
LOC120545292 NA coding downstream 813741 37125299 ~ 37134890 (+)
LOC120545871 NA coding downstream 825818 37137376 ~ 37162177 (+)
G180412 hsdl2,LOC106913027 non-coding upstream 102812 36126999 ~ 36128999 (+)
G180411 NA non-coding upstream 105655 36125441 ~ 36126156 (+)
G180409 hsdl2,LOC102790414 non-coding upstream 108803 36120659 ~ 36123008 (+)
G180406 NA non-coding upstream 111374 36088438 ~ 36120437 (+)
LOC120545344 NA non-coding upstream 115257 36115759 ~ 36116554 (+)
G180437 NA non-coding downstream 2775 36314333 ~ 36316003 (+)
G180440 NA non-coding downstream 10724 36322282 ~ 36342369 (+)
G180445 NA non-coding downstream 139454 36451012 ~ 36451935 (+)
G180452 NA non-coding downstream 169165 36480723 ~ 36481049 (+)
G180471 NA non-coding downstream 258093 36569651 ~ 36573126 (+)
G180414 NA other upstream 53889 36176963 ~ 36177922 (+)
G180410 hsdl2 other upstream 55440 36123080 ~ 36176371 (+)
LOC120545305 NA other upstream 171288 36048606 ~ 36060523 (+)
G180366 NA other upstream 189384 35850922 ~ 36042427 (+)
G180382 NA other upstream 258750 35969766 ~ 35973061 (+)
LOC120545105 ptbp3,LOC106536240 other downstream 8777 36320335 ~ 36327396 (+)
LOC120545327 NA other downstream 792649 37104207 ~ 37113771 (+)

Expression


Co-expression Network