cltb (cltb,LOC107750349,LOC107677378)


Basic Information

Item Value
gene id cltb
gene name cltb,LOC107750349,LOC107677378
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047607.1
NCBI id CM018553.1
chromosome length 26458119
location 22769637 ~ 22779068 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU255279
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>TU255280
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>XM_026947036.2
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>XM_026947037.2
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>XM_026947038.2
CTTGCTCCTTCAGGATATtccttaaataaatgcaaaaaaagaaaaaataaaataagaaaatccagtgtgtgtttgctccCGCGTCTTTATTTAGTACCGAACGGTTGAATTAGCCAGTTGGCTAgttttcatttcacacacacacacacacacacacacacagacacagacagagagagagagagagagagagagagagagaacaccaCAGCTGGAGTGAGTGAAGCGAGTGGCAGTGAGTCAGTTACTGGCTGGAAAATGGCCGACGCGTTCGGACTGCAGGCGGAAGAGGACCCCGCGGCCGAGTTCCTCGCGCAGCAGCAGCACGAGATCGCCGGCATCGAGAATGACGAGGACGGCTTCGGCTTCGAGTTCGAGGCGCGCGACCAACAAGCAGAAGCTGCACAATCCCAACCGTCACATTTCAGTTCGAACTCTTTCGAAGcAGATGAGTTCAGAGGAGCAACTATGAATGGAGAATTGTTTCAGTCCAACGATATAGCAGACGGTTACGCGGCTATCGCCCAGGCTGATGTGCAGCGGCAGGAGCCTGAAAGTTTACGCAAGTGGAGAGAGGAACAGAAGGCACGGCTGGAACAGTTAGATTCAGCATCCAAAGCAGCAGAAGTTGAGTGGAGGGAGAAGGCAAAGAAGGAGCTGGAGGACTGGCATGCTCACCAACAGGAGCAAATGGAGAAGAATAAAGTCAACAACAGagcgtcAGAGGACGCCTTTCTGAAGGAGTGCGACGACGACAGCCCCGGCACCGAGTGGGAGAAAGTGGCACGGCTATGCGACTTCAACCCCAAGACGAGCCGCCAGACGAAGGACGTGTCCCGAATGCGCTCCGTCCTCATTTCCCTGAAACAGACGCCGCTGGCTCGCTAAGACCTCGTCTCACTCTGCCTCACGTCTCaccttctctccatctccctctccctGTCCTTCTCGCACTTTATTTTAGCACACGCTAAATGTTTGGgttttctttctgtcatttaAGGGGTATGGtgaattgaaatttaaaaaaaaaaaacatttctgttacacATAATCTGTATCAACTGACAGAAAAGCATTttctggattgtttttttttttttgtctgtttttatgcCAGAAAAGGAGAATTATGCCTCTTGAGTAGGCTAGTTGAGGATCAAGTGCAGGAGTGTGACCCTCAGACCACCTcagagcaaaattaaaaacacagatcAAACAGACACGAGACTCTGGGTGGACAAAATGGCAGAAATTATCCTGCCACTGTACTTGAAGACATGTTACGCATCAAAATTTTGAAGAAAGCTAACATTAAACAGCAAAAGCAGTATCAGATGTTCAACATTTACCAAAAGAAACTATTTTATAAGGAACAGAAAGCAAAATTGGTGCAGGTTTAATTTGAGTTGCTGTATAttgttactatttattattatccgGCTCTCTGTACTTCAGTTCTTCCCAAATTGGTCCTCTGAGATACCCAGATGTTCcacttttaaacacattaaatgccACAACATGGCGGCTAATGACAACAGTTGGACATCTACCGAAAATGCTGGTCcaaaatgtgctgttttagtATTTTTGGTGTCTGAAATGCACCACCATATCCCCAAGCAGTCctgaatacccataatgcactgtgctCTTTGGTTTGATTCGCATGCGCATGAGAGAACCAGCAAGCTAAAATGGTAGCATCGAACTTCAGATTTGCAGATTAGTAATGGgaattattattctatttttttagcgagtcagatcatttgactcttATTACAGTAGACTCTTTCAGCTCCCAaatggctgattggcatttttTTCCTAAACTGAACAAAAGTTCGCTATATTTTGATTGTTGATTGTTCTTCTTTGCCTGAAAACTAccttaattttataattaacagAATAACATTTACTTAGCATTGGATGTCagaaaaaatagatttaaatagttgttaaaataaatcagcaaaGCACTACAAATGTGCATACGATAaagattcattttaattcatattcagtCATCTTCCCTTATACTATAACCACATGGTCAAATGTTGAAAAGAGGTTTCCATGGAAACGTTCTGATTACATATGCATATTTTTTGATTACAACGATCACCGATGAGTCGACTCGCTGACAAACGAAGCTTCACTGTTACAAATGTAAGAAGCAGATTTCTGTAACCACGTGTTCGGTCTACAGGCAGCGCCTTCACACTGCTGTGTTTCAGGTCAAATAATCGTACATGTCATAAAACGTTTAATCGCAAATTCTGTTCCCTACAGCAGTGTCCGATACGAGTGATATCCTACAGTGTGGGATTTGAGATTCGTATTAATGCCTCAGAGATGTCTTAGATGATGAGAGTTATCAAAAATGTGGACTGTCTGGGGATCCAGTCACTAAAGACCAATTTGGGAAACACGCTTTAATTGGTCTAAATAGCAGAATGACATAATTGAAGGagtatttgaataattttataattatgctAACTTTGCTAATAATTTTATCATTGTGCTAACCCTACACTGATTAACCTGAGATTTGAAAACTCGCGGATTATTGTTACTCTTCAGAGAACGGCAAAAACGAGGGTATTTTAATTTTCCATTCAAAGTAAAATACAGCGTATTCATACTGTAGCTCATAATATTGATTATTGCATGTTTTGCTTATTTCTGCTCAAGTTCATGAAGGTTGGCAATAATTCTAGACTTCTATCCATTCTTGTTTTCCTATTTCCATCAAACCTGTTGTATTGTAAGTTAAATCCCATTTCCCCCAAATATTTCTGGAAAACTAACAAATATTGAACAGTTATATTCAAGTAGGTTATTTGTTCAGTGGATTATTTATTGGTGGTCTTGTTTATACCATTCAGGCTCGcgtgtattgattataaaatttCAGATTTGAGCTGTAGCAGGCTTTGCCTTAATTAGTATGTCATCACATCCCAGTTCAGATATAATCAGTTGAGCATGTGTTGAAGTGTtacagatatttatatttaccatcagttacatttactgtcttACAGCTTTGAGGCCTTTTTCTCCAAGACAGATTTCAAAACTGTTACTTGCCTTTCAGCGGACCAGCTCTGTTGTGCTGTGCGACAGATTGTGGTTTTTACTGGCTGCCAAAGACTGTATGTTCATGCCTGACTACgctataaatgaaaaaaataaaaaatatatatattgggATGGTTTTCCAGACACAACTCAATTCAGTTCTTTGGATGTAGGAAAGACTCATTAGGTTTGGTGTATTTTGTCTGGATGATCATCTCAGGTTTGTTTCACATTATTAGAGACACTTTTAGCAAACGGTAGGACGTGGTAGAGGTTGAAGTGAATTGTAATGGAATAGCTTCTGAAATGTTTCCAAACTCGATcgtaattgtgtgtgtatgaaaacgCGGACACAATTCTGACATGCAGaactcaataaaataaaaatgtaaaaaaca

Function

symbol description
cltb Predicted to enable structural molecule activity. Predicted to act upstream of or within intracellular protein transport and vesicle-mediated transport. Predicted to be located in clathrin-coated pit and cytoplasmic vesicle. Predicted to be part of clathrin coat of coated pit and clathrin coat of trans-Golgi network vesicle. Orthologous to human CLTB (clathrin light chain B).

NR:

description
PREDICTED: clathrin light chain B isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0006810 transport biological_process
GO:0030118 clathrin coat cellular_component
GO:0012505 endomembrane system cellular_component

KEGG:

id description
K04645 CLTB, LCB; clathrin light chain B

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_026947038.2 False 3494 mRNA 0.40 5 22769639 22779057

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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