AMCG00010580


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00010580
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030129.1
NCBI id CM030129.1
chromosome length 41163702
location 35998525 ~ 36011345 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00010580
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
K05080 GHR; growth hormone receptor

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00010580 True 7628 mRNA 0.39 8 35998525 36011345

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00010581 znf131 coding downstream 18319 35976470 ~ 35980206 (-)
AMCG00010576 NA coding downstream 40052 35954600 ~ 35958473 (-)
AMCG00010575 NA coding downstream 45865 35945408 ~ 35952660 (-)
AMCG00010577 gadd45g coding downstream 59147 35933729 ~ 35939378 (-)
AMCG00010573 NA coding downstream 195042 35776236 ~ 35803483 (-)
AMCG00010586 NA coding upstream 100895 36112240 ~ 36118601 (-)
AMCG00010587 LOC108425197,LOC107653495,LOC107602251,LOC107588929,LOC108277216,LOC107709193,LOC107706772 coding upstream 236720 36248065 ~ 36253336 (-)
AMCG00010588 NA coding upstream 245545 36256890 ~ 36264978 (-)
AMCG00010592 pde4d coding upstream 297584 36308929 ~ 36319057 (-)
AMCG00010593 NA coding upstream 340851 36352196 ~ 36353920 (-)
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G81698 NA non-coding downstream 331847 35662076 ~ 35666678 (-)
G81652 NA non-coding downstream 471756 35523680 ~ 35526769 (-)
G81636 NA non-coding downstream 586787 35411526 ~ 35411738 (-)
G81608 NA non-coding downstream 858602 35139363 ~ 35139923 (-)
G81827 NA non-coding upstream 263571 36274916 ~ 36305127 (-)
G81957 NA non-coding upstream 1117548 37128893 ~ 37129266 (-)
G81973 NA non-coding upstream 1219102 37230447 ~ 37231375 (-)
G81979 NA non-coding upstream 1231094 37242439 ~ 37245114 (-)
G82002 NA non-coding upstream 1271572 37282917 ~ 37283315 (-)
G81716 NA other downstream 281853 35714951 ~ 35716672 (-)
AMCG00010532 ppic,LOC107713556 other downstream 1893853 34098346 ~ 34104672 (-)
AMCG00010509 fem1c,LOC106580179 other downstream 2998526 32993287 ~ 32999999 (-)
AMCG00010487 ppip5k2 other downstream 4000831 31954370 ~ 31997694 (-)
AMCG00010478 znf367,LOC107568105,LOC107704585 other downstream 4918203 31072452 ~ 31080322 (-)
AMCG00010597 ercc8 other upstream 616556 36627901 ~ 36641693 (-)
AMCG00010602 NA other upstream 666352 36677697 ~ 36683818 (-)
AMCG00010623 NA other upstream 1394535 37405880 ~ 37408149 (-)
AMCG00010666 NA other upstream 2412134 38423479 ~ 38425067 (-)
AMCG00010664 NA other upstream 2446429 38457774 ~ 38465061 (-)

Expression


Co-expression Network