tmem150b (tmem150b,LOC107662375)


Basic Information

Item Value
gene id tmem150b
gene name tmem150b,LOC107662375
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056701.1
NCBI id CM032070.1
chromosome length 30200998
location 23193030 ~ 23197094 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043235614.1
GTGTATTTAActtttatactttaaatgtttctgtattgttaaataatacatatatttgaatGGCTGGGAGGGAGGGAAGGGGTAAATAATATAGCtattaaataagtttttaatgtgtattaattaaatgaatagttcacccaaaatgaagaCAGAATTGATCATATACTCGCCCTCGAGTAGTTCcgcttctgtatttttattctcccgaagatattttggaaaaagtttgtaaccaggttgttttgCGTCGactaacagtttttttttttttttttggttgtgttTTTCCCCCACTAGTCAGTAGTTACCCAAAATAACCTGGTTACACACTCATACAGAGTAAATGATggaagaattttcatttttgggcgaactattcattaaagattaatataactgtaattttttttttttttaagggtttaaGTTATTTTACTCGCATACGCTTaccattatgtattattatcattactaagtaataaaatactttaataatgaCAGTACTTAGATGACAAAGGTCTCTGCATTGGCAAAACCTCCTGTAATAAAACTGAGTGAGGCTCCAGCAGATTATTCACTGGtgtgatatgatatgatatgatgttGCTCATGGCGCAAATCTTGAAACGTGTGTGAACGGATGTGAAACGTGAAACATTAAAGTACACACCACTCGAGGTCGTCTTAAAGATCGGGTCGAAGTCTATTCACACATGCTTTGAAACGTGCCGTAGCTTCACTTACTGTCTGGCGATGCGTCTAAATTTTCGCCGTTCAGTCAAGGATTTCTTTACCTGCTCGTtgattgttttttaatgcaCCAGCAATACTCctcataaacattaaaactgttgtGCATGAAAACCAGGGCGCATTTTATGGTGAGAGAGTCAAAATCACTTTTTGCCTCTGTTTTgacgccttttttttttttgcatgacgTGCTTTTATGCATCGAGTTTAGAATAGTTTGACGAGCAGGTAATTTATTAGTTAACTTAGTGTTTCTGAGTGATTCATCAGAGGAGGaaaagcaggtgtgtgtgtgagagagatataGTTTGCTTTGGGAACACACTACAAGCGTTGCAGGTGAGAGGTAAGTCAGAGTTCTTGTTTGCCATATAACGCGATATGCTGGCGTTCAAAAGTTATATTGTCATTGTTGTAATTCTAatcaaaatacacttttttaatttagaaacgtctaaacatttattttaaattgtgaatttgATGTACtgcttaaatgtaaatatataggctatataaaaacaaataaatacatctaaccctaaacttttgaacggtttccatttcttttgatttttttttatcgtctCTTTCCTCAAAGTTAAGATTTCTTACTACTTTTAGCATAATGACCATAAACTGCACTTAGTTGAAATGGTTTGCTGTAATCGCTGTATCTCCAGCTAGCATGCTAAAAATCATTTCAGTGGTGGTTGTAGTCTTTTCTCACTgtcatattttgcatattgttcACTTTGTCGATTTCTGTGAGTTTAACAGACTATGAACGATCTTATTGATGGTTAAATTACAGTCCTTTGCATTTGAGCCCTgaattaatattgcattataataaatgttaacaagCTAGCGCGCAATTTCCAATGAAAAGGGTAATGAAAAGGAATCAAAGTAAAAAAGGGAGTTTCATTCTATTTGTCAGAAATGTAAGGTGGCTTTTTCATATATTAATCTTTAATAAAGACTTTCAACACCACTATAACCCGGACAGGTGCGTGTCGAAAAACGTGACACCCCCTTAAACACTGATATATTTATGGGGCTGTAAAAATCTAAGCAGGTTGTTCCTGTGTTTATCTATTGTTGACGTCTAAATTTGTTCCCTGTGTGCAATCcattatacataatattatatgtatataacacaTCATTTGTAATagtataaaatgcaatattaatgtaataataatgaatcaaatatttttttttttatgtctggaCACTTTTGTATGCACTGGTTGAATGTCCTGTGAAGACTTTCTAGGCAAATGTtcattgattaaaatgtttgctaGGTGAAAGTGTAATCTGTATATGctaatgaatgtgtttttatgtaaagaCACCTGATCTTTCTACAGGTGATCTGATTGGGCCATCATGTGGGTATGGGCATTACTTCCTGTCTCTCTGGCAGTATTTGGGACTATAGGGATGTGGGCTGTGTATGCCATAGCTGTGTCCAATAACACTGTTAATATAACAGAAGAATTCCCTTTCATCAGCACATGTGGCTCCTACAACCCCCAGAGCTGCCTGTTTTCTCAGATCTGCAATGTATGCTGTGTGCTGGCTTTGTGGATTGTCACGATCAGATTTCAGCAGGTCTGTGATTTGGGCTCTGGGTCTCATTTAAACACGGCCGGTTTGGTGCTTGGCTTCATCTCTAGCATTGGGATTTCCATCCTTGGGAACTTCCAGCAATCCGTACTGAAGGGAGTTCATCTTTTCGGGGCGCTCTTGGCCTTCTTACTGGGTTTGGTTTATTTCTGGATCCAGGCGTGGCTTTCGTACCACAGCCCGCCGTCACATGACCGCAAGTGGGTGGTGCCGGTGCGCATCATCCTCTGCAGCCTGTGCACTGGTTTTGTCATCTGCATGTTCGTACTCTATAAAACAGGGTTTCGCTCGGAAGCTGCCATGTGTGAATGGGCTCTGGTCATGTGTTTTTTTGCGCTCTTTGCTGTTTTTGCAGCCGAGTTCAGACACGTTGACTGCCACAAGCTCACCGTACAGAACGAGGGAAGGAAAAGCATCGGTGAATCTAATGGCGTGTGGACTATACAGGAGATCCACTAGAAACACCTGGCAAGTTGGGTTCGTGACAGATACGTACAAGTTAATGCAGACGCTATGAACTATAACCTGCGCAGCTCTGCTGGAGTACACAGAAaatccacattttaaaatataaatgatatgttGAAAAAATGCTATGCAAGAATATTGTTTACTTGACATTTACGTGATGTTAAATTATAGTTTATAATGGAAAACGTGTTTTATCAGTAGTTTTTTCAGGGAACAGTTAGACCTCAGGCAGGTAGTGTTtacataatgttaaatatattgtgttataaatatttaattctatcTGACTGTTATAAAAAGCTATTATTGAATATGAAGAAATGAGTAACATTGCACgatgtgaaataaatgaaaaggtttAGCTCAGTTTAGCTAGATGTTCACTTTCCTATCTAGAGCTTATGAACCAGAGACACCTGTAGAAGTTTgtctttgaacttttttttttttttgtgatagcATCACGGttgaaaaataattatctgGTGATGTGGATTTTCTTATTGTagagttaataaaaatgataatga
>XM_043235615.1
GTGTATTTAActtttatactttaaatgtttctgtattgttaaataatacatatatttgaatGGCTGGGAGGGAGGGAAGGGGTAAATAATATAGCtattaaataagtttttaatgtgtattaattaaatgaatagttcacccaaaatgaagaCAGAATTGATCATATACTCGCCCTCGAGTAGTTCcgcttctgtatttttattctcccgaagatattttggaaaaagtttgtaaccaggttgttttgCGTCGactaacagtttttttttttttttttggttgtgttTTTCCCCCACTAGTCAGTAGTTACCCAAAATAACCTGGTTACACACTCATACAGAGTAAATGATggaagaattttcatttttgggcgaactattcattaaagattaatataactgtaattttttttttttttaagggtttaaGTTATTTTACTCGCATACGCTTaccattatgtattattatcattactaagtaataaaatactttaataatgaCAGTACTTAGATGACAAAGGTCTCTGCATTGGCAAAACCTCCTGTAATAAAACTGAGTGAGGCTCCAGCAGATTATTCACTGGtgtgatatgatatgatatgatgttGCTCATGGCGCAAATCTTGAAACGTGTGTGAACGGATGTGAAACGTGAAACATTAAAGTACACACCACTCGAGGTCGTCTTAAAGATCGGGTCGAAGTCTATTCACACATGCTTTGAAACGTGCCGTAGCTTCACTTACTGTCTGGCGATGCGTCTAAATTTTCGCCGTTCAGTCAAGGATTTCTTTACCTGCTCGTtgattgttttttaatgcaCCAGCAATACTCctcataaacattaaaactgttgtGCATGAAAACCAGGGCGCATTTTATGGTGAGAGAGTCAAAATCACTTTTTGCCTCTGTTTTgacgccttttttttttttgcatgacgTGCTTTTATGCATCGAGTTTAGAATAGTTTGACGAGCAGGTAATTTATTAGTTAACTTAGTGTTTCTGAGTGATTCATCAGAGGAGGaaaagcaggtgtgtgtgtgagagagatataGTTTGCTTTGGGAACACACTACAAGCGTTGCAGGTGAGAGGTGATCTGATTGGGCCATCATGTGGGTATGGGCATTACTTCCTGTCTCTCTGGCAGTATTTGGGACTATAGGGATGTGGGCTGTGTATGCCATAGCTGTGTCCAATAACACTGTTAATATAACAGAAGAATTCCCTTTCATCAGCACATGTGGCTCCTACAACCCCCAGAGCTGCCTGTTTTCTCAGATCTGCAATGTATGCTGTGTGCTGGCTTTGTGGATTGTCACGATCAGATTTCAGCAGGTCTGTGATTTGGGCTCTGGGTCTCATTTAAACACGGCCGGTTTGGTGCTTGGCTTCATCTCTAGCATTGGGATTTCCATCCTTGGGAACTTCCAGCAATCCGTACTGAAGGGAGTTCATCTTTTCGGGGCGCTCTTGGCCTTCTTACTGGGTTTGGTTTATTTCTGGATCCAGGCGTGGCTTTCGTACCACAGCCCGCCGTCACATGACCGCAAGTGGGTGGTGCCGGTGCGCATCATCCTCTGCAGCCTGTGCACTGGTTTTGTCATCTGCATGTTCGTACTCTATAAAACAGGGTTTCGCTCGGAAGCTGCCATGTGTGAATGGGCTCTGGTCATGTGTTTTTTTGCGCTCTTTGCTGTTTTTGCAGCCGAGTTCAGACACGTTGACTGCCACAAGCTCACCGTACAGAACGAGGGAAGGAAAAGCATCGGTGAATCTAATGGCGTGTGGACTATACAGGAGATCCACTAGAAACACCTGGCAAGTTGGGTTCGTGACAGATACGTACAAGTTAATGCAGACGCTATGAACTATAACCTGCGCAGCTCTGCTGGAGTACACAGAAaatccacattttaaaatataaatgatatgttGAAAAAATGCTATGCAAGAATATTGTTTACTTGACATTTACGTGATGTTAAATTATAGTTTATAATGGAAAACGTGTTTTATCAGTAGTTTTTTCAGGGAACAGTTAGACCTCAGGCAGGTAGTGTTtacataatgttaaatatattgtgttataaatatttaattctatcTGACTGTTATAAAAAGCTATTATTGAATATGAAGAAATGAGTAACATTGCACgatgtgaaataaatgaaaaggtttAGCTCAGTTTAGCTAGATGTTCACTTTCCTATCTAGAGCTTATGAACCAGAGACACCTGTAGAAGTTTgtctttgaacttttttttttttttgtgatagcATCACGGttgaaaaataattatctgGTGATGTGGATTTTCTTATTGTagagttaataaaaatgataatga

Function

symbol description
tmem150b Predicted to be involved in autophagy. Is integral component of plasma membrane.

NR:

description
transmembrane protein 150B-like

GO:

id name namespace
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG:

id description
K21846 TMEM150; transmembrane protein 150

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043235614.1 True 3398 mRNA 0.36 6 23193030 23197094
XM_043235615.1 False 2362 mRNA 0.39 7 23193030 23197094

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122341904 adsl coding upstream 141 23184848 ~ 23192889 (+)
LOC122341905 adsl coding upstream 11964 23171604 ~ 23181066 (+)
atf4b atf4b,LOC107585034,LOC107740611,LOC107710053,LOC107662376,LOC107656792,LOC107582897 coding upstream 25786 23164362 ~ 23167244 (+)
LOC122333434 LOC107710041,LOC107740651,LOC107585073,LOC107662378,LOC107687794 coding upstream 57992 23128784 ~ 23135038 (+)
copz2 LOC107740614,LOC107662379,LOC107585036,LOC105013247,LOC106607483,LOC106600844 coding upstream 78932 23103757 ~ 23114098 (+)
pdgfbb LOC107710051,LOC107582898,LOC107740670,LOC107656789,LOC107585031,LOC107662372 coding downstream 24609 23221703 ~ 23232300 (+)
pvalb6 LOC107585030,LOC107662370,LOC107690741,LOC107602319,LOC107710050,LOC108258409,LOC108412390 coding downstream 65897 23262991 ~ 23300757 (+)
LOC122341903 LOC107740604,LOC107662367,LOC107585029,LOC107710048,LOC107602318,LOC107690738 coding downstream 113742 23310836 ~ 23319832 (+)
LOC122341901 LOC107740603,LOC107662366,LOC107690737,LOC107602322,LOC107585068 coding downstream 129503 23326597 ~ 23336485 (+)
LOC122341358 LOC107585025,LOC107716530,LOC107662363 coding downstream 175566 23372660 ~ 23392187 (+)
G22582 LOC107687786,LOC107710056,LOC107662412,LOC107740652,LOC107585075,LOC107582935,LOC105912825,LOC103364773 non-coding upstream 44412 23100944 ~ 23148618 (+)
G22584 NA non-coding upstream 76190 23114278 ~ 23116840 (+)
G22581 LOC107740652,LOC107662412,LOC107582935,LOC107687786,LOC107710056,LOC107578312,LOC107577241 non-coding upstream 97608 23089473 ~ 23095422 (+)
G22554 ddx5,LOC107695114 non-coding upstream 164525 22940247 ~ 23028505 (+)
G22340 atp5g1,LOC107740625,LOC107662391,LOC107582887,LOC107585044 non-coding upstream 520119 22511428 ~ 22672911 (+)
LOC122341922 LOC107695122,LOC107583308 non-coding downstream 199407 23396501 ~ 23400922 (+)
LOC122341920 LOC107672134,LOC107602299 non-coding downstream 215719 23412813 ~ 23414909 (+)
G22754 NA non-coding downstream 365946 23563040 ~ 23563246 (+)
G22757 NA non-coding downstream 377804 23574898 ~ 23578241 (+)
G22758 NA non-coding downstream 381382 23578476 ~ 23646166 (+)
prr15la prr15la,LOC107710040,LOC107585086,LOC107662431,LOC107582938,LOC108412372 other upstream 29314 23158219 ~ 23163716 (+)
LOC122341356 il2rb,LOC107695139,LOC107583317 other upstream 284895 22899333 ~ 22908135 (+)
hoxb2a hoxb2,hoxb2a,LOC107585087,LOC107662381,LOC107582889,LOC107687781 other upstream 422428 22765647 ~ 22770602 (+)
hoxb5a hoxb5a,LOC107717200,LOC107662384,LOC107687777,LOC108413114,LOC107740619 other upstream 466872 22722022 ~ 22726158 (+)
G22329 LOC107585049,LOC107740630,LOC107662396,LOC107582928,LOC107717208 other upstream 645822 22546158 ~ 22547208 (+)
dnal4a dnal4a,dnal4,LOC107662365,LOC107585028,LOC107690743,LOC107740666,LOC107710037 other downstream 141285 23338379 ~ 23343640 (+)
LOC122341898 LOC107662363 other downstream 146870 23343964 ~ 23361942 (+)
LOC122341907 NA other downstream 206347 23403441 ~ 23408814 (+)
zmp:0000000912 LOC107748810,LOC107695116,LOC107583322,LOC107695109,LOC107583307,LOC107709636,LOC107672113,LOC107602301 other downstream 227527 23424621 ~ 23431766 (+)
c1qtnf6a c1qtnf6,c1qtnf6a,mgat3a,LOC107695119,LOC107723613,LOC107672153,LOC107583300,LOC107748818,LOC107580620,LOC107695120 other downstream 512409 23709503 ~ 23721719 (+)

Expression


Co-expression Network