G190311


Basic Information

Item Value
gene id G190311
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_025048446.1
NCBI id JAEQBD010000791.1
chromosome length 1202875
location 676623 ~ 681427 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU282400
ttttttttttttttttgcttggtctatcaaacaattaatcccatctaaaataaacgtttttgtttatgcttgtgtgctgtgtatatttatgcacatataaatacacacacatgcatgtatacaatTCAGAAAAAtaggttatatttatatttgacatatatttatttatatcgaTTGTATTACtctaaatacatatattttcaaaatatatactttatgtgtGCGtacttataaatatacataataaatgtacacagaacacacacacaagtatattacataaacaaaaactttgattttggatgcgattaatcatgattaattatttgacagcattttgtgcattttattttaattcagtaaatatttaggtttttttttaaagtaacagaaataatttatggttttagtttaagttttctacaccaaagaaacaaaaacacatggcaagtaatacattaaattacatttttttaaagcatgcttCAATAAAATCGTAAAATAGTTAACAATAACCCTATTTGTTATTTACAAttccaaaaaagcatttttacagtgtataatactgtaatatttgaaTTCATTACTACGTGTTTGCCAGGGTATTGCTTTGCTTGCAGTGTATTTAACAAATGTGCTAGAGAAAAGAACGGGATGCATACTGCAAAAATAGCATGAGGGGTATGTTAGTGTGCTTTTCCGAACACATCCATGATCTCGCCGGGTCCCGGTTTAGAAAGATCTCACCGCTTAGCAGttctgttttacagtatttaaaagcAGAATGAATGGAAGATGTGAACGGAATTGTGCCCTTGAATGTTGATTATATAGTGACCTTCCGCGGTGATCGTCTGATCTGAGTTTAATTGAAAAGCTGCTCCCTCCCTGATCACTAATTTGagttcagacagacagatggcaGACGTCCCGCTTGAGCGACAGGAACTGGAATGTTTATGCaattattagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttttgaggACCCTGCTGGACTCCAAATAGTTTTTATGATCAATTCGGTATTAGGGAtgaaatggtttttttttcaattgtatgcatttatacTTAATATAGTCCATTTTAACAattgcattttacaattttacatttttaagacaaTTAAGGACATTTTGTACCGAATTCTCATTAACAcaacgaaaaaaaaatctcatgctCATTATATAACAAAACTGAAGGTaagtactgtatttattattactaaaataaagcaaatagcagacaaaactgcaataatgataatgatgacaCGTAATAATGGATTTTGCATTACGGTAATGAGAATTTGAAAAATGCGCTTAATAtgtcgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgaccctgcTGGACTCCAAATAGTTTGTATGATCAATTCGGTAttagggatgaaaaataatgcatttttaaaattgtatgcatttatacttaaaatagTCCATTTAAGACCATTAcaattgagtttttttaaagacaattaaGGACATTTTGTACCAAATTCTCATtaacacaacaaaataaaatcttatgcTCATTATATAACAAAACTGAAGGTAAGACagaatttgttattaatttaaaaatattactgtatttattattactacaataaAGCAAATAGCAGACACAACTGCAATAGTGTAATGATGACACGTAATAATGGATTTTGCATTACGGTAATGAGAATTTGGAAAATGTGCTTAATatatcactgtgtgtgtgtgtgcgaaatAATcgtttacaataataaatgtatttatttatgctatacatatatatgacacataaaaaacgtatttaaattcattaatttcgcaaaaatgtatttattgtatcaTATACATGTACAgcataaaatcttaatttatttacagttactGGACCTGTTGAATAGGTGTGCGCCCGTTTCTAAAGCGAGACCCGTCATAACTTATTCGTGTTTTGTTTCGCCTCATCGTTCGCGTCCACCAGCGATCCGCCCATCAGAGCAAATTTCCGCCTTAATATTAAATCGCGCACTTCGTTTGACCCGTAAAGCACTCAAGGTCCACTTTGTCCCCCGAATATCAAGCGAGAGACTGACCGCTTTTCGGCGCCGTCCAGCCGTATCGGCTTGAAGAAAGCGCACTCCTGGACGAGACGCAGCGCTTCTCATGTCCTCGACCGAATGTTACCGGGACGCCGGCGCGGAGGAAGCGTCTCTTTGTCGGGATCGGAGGACGCAAGCGGTCGGGCGGGAAAAATCCCGCTCCCAGCGTAACGGCTTTGGTCCGAAAAGTCGGCGGAAATGACATCTTTTAACTTCCGCCACGCGGCGTACTTCTAAGCGAACGCGAATGCATTCGCGCTTTTGCATCCGTGTGCGCCGCCGAGCCGGTGAATGACACCGGAAAGGCATATCCGGAAAGCATTcggctttaaaataaatacgttATCGTGTTTCGCGGTAGTGATGCGGCCTCGCCGGTCTGTTTCTGTACGTTTTTCACACTATTTTTCATACATCACACCACTCCTGTCCTTCTTCTCGGTCGTTTAGGCCCGTAACCGTGGCCCGGCTCTACATAAGTACTACGTTTACATAGGCATGCACAATACAGTGTAACTATGAGCAATTACGAAGTTCGTTTAAGTGTAATCACACATGAAATACCTGAATAAAGCATGAATAGAGGAGAACTACCGTCTTCAAAAGCGTCTCTCAAGGCCATTGAAATGTTCAGAGACTGTGTGCTGCGTTTTACGGTTTGATTCGTCTAATGTGAATGTTCTAGAAGGCCCTTCCGGCAAACAGCATATTAGTGTAAGCCACTGAAACGAATTCAAAGCTTTTACTATGGCACGTTTTAGGCTGCTTCTAAACGAAAGGTTTTCCTGAATTCTAGCTCAAAACAGCCCCGCTCTCGCAATGGAAACCTGCAAAACGACTTTCCGTGGCTGGTTTTAACCTCGTTCGGGAGGATTCGGTAAAGATTCGTCAGACGCCGTACAGAAGCAGCTGAAGCTACAATGCAGTTAGATATCGTCTTAAACAGCATTAAATACTTAAACGTGCGCATTAGCAGTAGGCAAGCTAACTGACAAAATACGATGTGATAAAAAAACGCACGAACTGACAGTAGAAAAAATTATGATAATGTAAAACGtatttgttgttaaataaataaatacatgaaacgATAATAAGAGATGTAGCTTGGTACTTGGTAATCTgacaaagtcaaaatttaataaaactaaactaataaaatagaataaaaataaatagagttgatcgaaatgtatttaaaaataaataagcaataaaaagatttaaaaaaaaaacaatagattgagatattaatattatcttaatattaattaagataattaaaaaaaatcttgcaatTTTCTTAGTAATCTgactaatacaaaaaaaaataaagccaaagaaaaaactaaaataaaataatttgtcagtgtgttaatatttattgagGTTAATTCGAAtgacattaaatacaaaacagatCGTTTGCTATTTtatgaaaagataaaataaaataaatatattgagaGTAGCGTCGACATAATCGCAGTGCcctcggtaaaaaaaaaaaaaatctacaaaataataaaaaaaaagatagttcAATAAAGCACAGAAAATTTTGATGCAGACTTTATGAAATCCTCGATCCTCAACGTTAAAAACAGCCACTGGGAGTTTGGGTGGTGCACGTTTCCCTGTGAATCTGTGCAGCTCAAAAACGAGAGCTGTTTTGGCAAAAATATCCGCATGTGCGCTGGCTGTGGCCGTTTGTTTACAGCGTGATGCATGGATTAAACGATACCGCGATGAATCGAATGCCCTGTTCTCCACCCGGCAGCTTTCTGAAACGAGACGTGGCGATGAGCGGCGATTCAGAACGTGCCCAAATCAATATCAACACACTTCATAGTCTATAACAAGAGCCTAAAATACCCCACTAAAGATAAATCTATCGACATCCTTTTGCGCCCATAACCTGGAAACTAGTTTTTCgccaaaggtttttttttcaataaaacacaccCCGAGTCCCCGTAAACCTACACTATACACCCTGAATTAATTGTGTCTAACTCTTAATTGGCATATTATATGAAGTAGCATGTATGTAGCGTAAGATAATCGTTCGGTGGTAATATTGTACACGGTTACGTTACCGACAGAGATGAAAAAGATTTGGTCCTCTGGTCCCTACgggtgagagaaagagagttcGTTATACTGCGTCAGTggcatatacacatttttatcgTTAAACCCTCATTGTTCCACGCGATTGAAAGCTACGGCCGTCTTTTGATATGTGCATGGATCCGCcttttgccttgttttttttttttagccaacTCTAGCGGCCATGCACGGTTCTTCCAAAGTGTTCGGTGTGTAGCGTTttccaaaagagaaaaaagtcgTCGGTTCGTTTTGTCTTCGTCGCTGTCGTCCCCCCCGCCTTTCATCGCCGTCCAGACACGCGCTTTCGTTAAATGCGATATGCTTCACGGGAACTCCCTTATGCGCTTGTTTCTCCGCTTTGTTTGCTTCttcgtgtgttttttttgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgcgtgcgtgtgtgtgtgtttttttttttttttgtttagtcttttttttgtccCGTGTTAGTTTTTCAAGAAAAGTTTCCATCCGTCAAAACGTCAAGACTACAACTGTTCaaaac

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04080 Neuroactive ligand-receptor interaction
ko05033 Nicotine addiction

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU282400 True 4782 lncRNA 0.37 2 676623 681427

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
hsd11b1lb LOC107596225,LOC107729988,LOC107667865,LOC107750927 coding upstream 8432 662618 ~ 668191 (+)
zmp:0000000521 zmp:0000000521,LOC107696078,LOC107596226,LOC108442439,LOC108280721,LOC105888700 coding upstream 14719 652741 ~ 661904 (+)
LOC122335697 LOC107696097,LOC107750929,LOC107596267,LOC107569625,LOC107754601,LOC104948982 coding upstream 64514 554084 ~ 612109 (+)
rnf126 rnf126,LOC107569633,LOC107596227,LOC107754583,LOC107750906 coding upstream 125981 541389 ~ 550642 (+)
twsg1a twsg1,twsg1a,LOC107569636,LOC107750930,LOC107596295 coding upstream 137005 527493 ~ 539618 (+)
ralbp1 ralbp1,LOC107696059,LOC107667860 coding downstream 212701 894128 ~ 907048 (+)
LOC122335651 LOC568754,LOC107558277,LOC107667866,LOC107600185,LOC107729992,LOC107750900,LOC107696035,LOC108427118 coding downstream 239530 920957 ~ 928189 (+)
gna11b gna11b,LOC103033252,LOC107600186,LOC108427217,LOC107667855,LOC107696027,LOC108280682,LOC107558284,LOC105889474,LOC107750923 coding downstream 293146 974573 ~ 1007421 (+)
tle2c zgc:136336,LOC107713694,LOC107729985,LOC107558285,LOC107600240 coding downstream 345462 1026889 ~ 1046964 (+)
scn12aa scn12aa,LOC107655859,LOC108427209,LOC107713684 coding downstream 442657 1124084 ~ 1175611 (+)
G190302 NA non-coding upstream 28130 648219 ~ 648493 (+)
G190300 NA non-coding upstream 30360 645855 ~ 646263 (+)
G190298 NA non-coding upstream 31237 645159 ~ 645386 (+)
G190296 NA non-coding upstream 32277 642436 ~ 644346 (+)
G190288 NA non-coding upstream 57080 618959 ~ 619543 (+)
G190314 LOC107569623,LOC107696073,LOC107750904,LOC108280171,LOC108444550,LOC107667861 non-coding downstream 22109 703536 ~ 709464 (+)
LOC122335698 NA non-coding downstream 164513 845940 ~ 852752 (+)
G190350 NA non-coding downstream 177883 859310 ~ 859534 (+)
G190353 rxfp3.2a,LOC107729970,LOC107600262,LOC107696777,LOC107750939,LOC107667854,LOC107558276 non-coding downstream 180988 862415 ~ 864963 (+)
LOC122335692 NA non-coding downstream 255591 937018 ~ 945525 (+)
G190175 mtcl1,LOC107596231,LOC107569627,LOC107754603,LOC107696625 other upstream 329469 338941 ~ 347154 (+)
LOC122335676 rab8a,LOC107687930,LOC107696202 other upstream 656250 13786 ~ 20373 (+)
sirt6 sirt6,LOC107600234,LOC107696599,LOC107596265,LOC107667852 other downstream 135906 817333 ~ 836678 (+)
rab31 rab31,LOC107667863,LOC107696047,LOC107750901 other downstream 224835 906262 ~ 914067 (+)
chico chico,LOC107558286,LOC107696010,LOC107667856,LOC107600187,LOC107713638 other downstream 326723 1008150 ~ 1022881 (+)

Expression


Co-expression Network