G32961


Basic Information

Item Value
gene id G32961
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000004
NCBI id null
chromosome length 17451736
location 13640557 ~ 13666445 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU37369
CATAAGTGTTTTAAAACGTTTTGAAATTTTAATGGTTCACGTGACTTTGGCAGTTTGATACATGCTCCGAACCACTGATTCGAAAACAAAAGATTCGTAAAGCTTCGAAGCTCACATGAACTGTTTTAAATATGTCTTTAGTAGCTTTCTGGGCATTTGAAAGTGTTAATTATCTTCCTGTCAATGCAGGCCTCACTGAGCCATCGGATTTGATCAAAAATATCTTAATTTGTGTTCCCGAAGATGAACGAAGGTCTTACAGGTGTGGAACGACATGAGGGTGAGTAATTAATGACCGAATTTTCATTTTTGGGTGAACTAACCCTTTAGGTTTTGAAACATCCTTCCCGCCTATGAGAATAACTGAAACTGACGAAGAAAACATGCAAATAGGGTACGCTAAAAGAAAAAGATGTTTTTCCTAATTTGCAATGATTATACATAAAAAAAAATGTGTTCATCAGTTCTGTGAATAACCTAATTTGCTTATCAATTTGAGAGTAGCTAATGGATATCAGCTTTGCATTCTGCTGGAGTCAAAGGACAATCACCATTTTGCATTATGTAATTTCATAGGATAACATGCTGTGTCTCACAATGTGACCTTATCTCTCTGTTATTGAATCCAATGAGGATTTTGTTTCTTCTTTATGCCTTGTCGCATTCAATCATCCTATTGATATTGTGAATGTGTTACCACACTCAAAATACAACACACTGCAGCCTCATCTGAGCTGTGGAATCTTCCGTTTCGGCCCTGACCCGTAGGTGATTTCTTTTTCTCCCAGAGGGTTTGTGTGTGCATCACTCTTCATAGCATAAATAATTAATGCGTTCTTTTCCCCCATATACACGAGTAGGTGTCGGTTCGGCTGGGGTCTGGTATCCGCTGAGGTAAGGACACTCATGGATATACTTTGGCATTATTATAGCAGAGGGACTATTGGAAAGGGACTGTTAAATAATGTATATTTGCCCGCTCACTCTTTTCATCCACCCCTTGTGTTCAATAGTGCAGAGCCTGTGGGTGGGATGGAAAACACATGCAGTCAAGTCTCCGGCAGGCATGATATGATATTTATAACGTCTTCGGTATTATTACACTCCGCAGAGTACTTTGGGATGATGATTAAGTAAAGTAGGCAGTCATTTTGCTATACGCTTACTTACTGCAAGCTATAGCTATGTTTTCCTTGTGTAAGCAGAGAGAACAGCAGGTGTTGCTGTAAGCATCGGACCGCCTGTAATGTCTCAAACAGCCAAAGGATTTGGCTCTGAATTCGGTTAGCACGTCTCAGATGTGTCAAAATGTGAAAATCATGCTGTTTTCTCTCTAGGGCAAACTGAGAGTATCACTGATTTAGCAACCCAGCACTATGATTTCACCCCCAAATACGTTTTCCTTTTACAGATCAGCTGATCATCTGGTGTGAACATGAGAAAATTGGAGAAAATATATATATATATATATATATATTAGTACAGTGGACAAAGTATGGCATCTATTCTGAATAAGATTTATGGAGTTGTGGCCAATTTTATTGAATATTTTTTATGGAAATTACCACGCCAGGATTTATGTTGTGGTTCATAATTTACATATTGTGATAAATCTTCCCTGGAAAAAGAAGAGTTGGTCCTCATAAACATCAGAATGTCCTTTTGTCTTAATGTCCCATAGTATTTAGTTAGTCAATCACAGCTAACTAGTTACCATTCATGTCTAATGTTCAAGATCATCATTTCAGAATTATGAAATTATAATGATGGGAACTGCACAGAATGTATTGCTCATACATCAAAATAGGCAAAATAATAAACAAATTCCTTTTAGAACCCAATCCAAATAACATATTTCTAGCAATGTTCTTGTTGAGGGGGTTTGTTTTTGTCATTCAGGACGTGACACGTTTGCCATTTACAATGACGTGCACATCTCATGCCATAGTTGGTAGAAATAGGACAATAAAAAGATGTTGGCGAGAGAACTGCTGTCATCAAATGCTCAGAGAACTACATGTGACAACAACTTATATCTTCTCCTCCAATATACCCTACACTGCACAGTATGCAGCATGAAAATAAAGGACATACTAGTTTATCTGATGCGCCACATGAGCTCAGCACTGCAGGGTGAATTTCCAGCTTTCTGACACCTCTTCATACTTCAAGTATGCTGCTTGTAGAATAAGGTTTGCGCTGACATCTAGCACTTCATACACCAATGTAGACATGCCAGAAAATGACTGTATTGCCATTACATGGAATTGTCTATAGTGTGAAACCTAAGATCTTGGTTCAGTTCCCAGAATAGCAACTCTATTGTTATAGATACAGAAATCGCATAGTGTTGGTTGGAAGTAATTAAACATCTTGAAGTTTACACAGAGAATAAACCAAAGTCATCATAGAAACATATCTTTTTAGGCGGGTTTATCTGAAACTGATTATATCACAATAACAGACTGTCTTAAAAAAAATAAAAAACATTGAAAAAAAAAATAATGGAAAAATAGCAGAAAATTTGCATAGACTTTGAATTTCTTCCTGTTCAAATGTAGCATAATAAATGCTACTCAGAAAACTAGAAAAATATAACTATATGTATGAGATCCTCAATTAAAAATCTGAGTATCAGCCAAAGATTTGATGTCTCTAATCTGGCAAATTTTGGCAAATTCTGTGAATAGCCTTGCTGTCAACCTAGTACCTTGTAAACGCAACTTAAAAAAAAAAAACATTGTTTGCTCTTACTCTTGAAGGTTGTGTAAAGTCAGCCAGTCAGATTAGAGCTTGCCAGAAAGTTCTTTCCAGAATTGTGAGCAATTTGCATCAGTCGGCGGGCAATCTGTTTGAGGCTGAAACTATGTAGATTGACTTGGTTTGAAAGTTGATAGTTAAGATAGATAGATCTTAGATCTTCCCATTCTGTGGTTCTCTAGAATATGAATGTTTTCTAGAGAACGTCAATTTTAGCTACAGTACTGAAACACTTACAACAAATAAATCTTTAAGAAAAGATCACTGGGGAAAAACAACCTAAAAAAACTTGTAGTTTGGTTCGTTTGGTCCGGACCAAAGAAGAAAAAAAAAAACATTTAGTCCTGGTCCGATTAGCGTTCAGATTGGCAGTTTTATTACCGAACCAAAAGATACCGAACCTAAAGGCACAGGGATACGTTCACAACCTGATTGGTTGAATTTTTTGACGTATTGCCAATTCTGAGACGGAACTAACCGAACATCCAAAACAATGCTGTGTGCGGAGGTAAATGCACTTGTTGTGTGTGCGTAGCCTGCATATGATAGTATTTTGGCCAGCTGGGAACCCGTGAAGAGCTTATAAAATGTATAAAGGAGTCAAAACTGTGGCGTGAGGATTCTGTAATTTTTAGGGTCTAATCTTCCTGTTTTTGGTTCGATTACATGTCTTTAGTCCGTGTTGCGTTCATATATCATTCGAACCGCACCAGAGTTCGTTTGGAAGCGGACCGAGACCCATCTTTTCAGCGGTCTCGGTCCGCTTGTTTGGTGCGCACCAGGGTTCGGATGGCAGCTTTGACACATGTTCAAATGAACCGCACTAACAGAGCAATCGCACCAGGGTTCGTTTTAATCGAACCAAACATGACAAGTGTGAATGCACCCTTAGAGTCTTAGAATCAATAGAATAATAAACTGCAGAACTTGCAATCAGTGTCAAAACTTTGCCCATTGATTCAATTTAATTTTCATTGAATGTAATGAATTTTAACACCAAAAAAAAAGAAAAAAACATAGGCTTAGTGTTGGATTGAGTGTCCAGATGAGTGTTTGGCAGAGAAGATAACAGCACTGTCTTTTCATCTTTGAAAAGAAGAAAAGAAAAGATCAGAGCTGGTGAAAAAGCTTGTTTGAAATCCATTGTTACAAAAGACGTGCACCTTCTGGCAAATTGTTTTCTATGCTAATACCTCAGAGAGTTACTGCGTCTTTGTTTTGTTATTTGTATGCTATAGGTGAATCTTGTTCTCTGTAATTGCTGATTTTACTCTGGGGTTTGTAAGAACTAAGACAGTGTCCCACATTCTGCCTTATAAAGGTGCATGTCAACCAAAAATTGTTCATTGGTTTGACACTGTGTCAGTCACGAGATAGCTTAAATTGATTAATTATCTCCATTGAGCAATACAAGCGCTGAATATTATTTTCACTGCTTTTTATACCAGATAAAGATCACACCAGGGCGAGAACCATTGAAGAAACATCCCATTGTCAAGGCCACAGCAGTGGAACAGAGTCTCTGATTCATGGGGTTTGAATCATCAACTAGAACAGGTCTTTAAGCAAACACTACAACCTTGTTTTAAAGGGGTGGTTGATTATGATTTCACTTTTTTAACTAGTTAGTGTGTAATGTTGCTGTTAGAGCATAAACAACATCTGCAAAGTTACGACGCTCAAAGTTCAATGCAAAGGGAGATATTTTCTTTTAAAGAATTCTCTGTTTAAGGACTACAACAAATGGCTGGTAGGGACTACAACAAGCTTCTTCTTTGAACGATGTAAGGTTGAACACCATTACTGACAATCCTCATTTTGTCTGCTGGAGATTCTCCAGCTTTGTTGTTGTTGAGCATCTGAAGTGCGAGCTGTTAAAGCTCCGCCTTCTTCTGGAAAGCGGGCCGGGAGCAGCAAGAAATAAATGCTCATTTGCATTTAAAGGGACACACACAAAAACGGCGTGTTTTTGCTCACACCCGAATAGAGGCAAATTTGACAAGCAATAATAAATGATCTGTGGGGTATTTTGAGCTGAAACTTCACGGACATATTCTGGGGACACCAGAGATTTAAATTACATCTTGTAAAAGGGGCATTATTGGTCCCCTTTAAATCTGAATTGTTGTGGGTGTTATGAACAAAATTTTATATCTCAGTGATGGTGTATATCACTAAATAATTATTTGTGCTAGAAATTAAACTCAAGTTGAAGTTAATTTCAGTGTAAATGTGTTTTT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU37369 True 12773 lncRNA 0.38 2 13640557 13666445

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000004_13467845_13475703 NA coding upstream 164353 13467845 ~ 13476204 (+)
CI01000004_13211489_13233786 DARS2 coding upstream 406363 13211489 ~ 13234194 (+)
CI01000004_13197104_13205895 KLHL20 coding upstream 433972 13197104 ~ 13206585 (+)
CI01000004_13062721_13076100 KIF2C coding upstream 564329 13062721 ~ 13076228 (+)
CI01000004_13043279_13051835 NA coding upstream 588593 13043237 ~ 13051964 (+)
CI01000004_13708254_13713625 NA coding downstream 41442 13707887 ~ 13714179 (+)
CI01000004_13785437_13800307 RFWD2.L, RFWD2 coding downstream 118371 13784816 ~ 13800307 (+)
CI01000004_13959453_14004808 TNR coding downstream 293008 13959453 ~ 14004808 (+)
CI01000004_14036114_14036449 KIAA0040 coding downstream 368948 14035393 ~ 14039142 (+)
CI01000004_14099120_14100390 MRPS14 coding downstream 432449 14098894 ~ 14100622 (+)
G33029 NA non-coding upstream 97478 13540593 ~ 13543079 (+)
G32927 NA non-coding upstream 309173 13331184 ~ 13331384 (+)
G32926 NA non-coding upstream 311007 13329314 ~ 13329550 (+)
G32894 NA non-coding upstream 383335 13256930 ~ 13257222 (+)
G32599 NA non-coding upstream 407606 13231587 ~ 13232951 (+)
G33077 NA non-coding downstream 112321 13778766 ~ 13779068 (+)
G33086 NA non-coding downstream 159535 13825980 ~ 13826207 (+)
G33122 NA non-coding downstream 380139 14046584 ~ 14047484 (+)
G33137 NA non-coding downstream 446544 14112989 ~ 14113488 (+)
CI01000004_12646972_12652534 NA other upstream 984846 12646838 ~ 12652570 (+)
G31865 NA other upstream 1445410 12192130 ~ 12197418 (+)
CI01000004_11666900_11667179 NA other upstream 1972898 11666900 ~ 11667659 (+)
G31710 NA other upstream 1998157 11637251 ~ 11642400 (+)
G30797 NA other upstream 3142769 10497376 ~ 10497788 (+)
CI01000004_15091390_15096502 GA45B, GADD45B, GADD45BB other downstream 1424799 15091200 ~ 15097173 (+)
G34220 NA other downstream 2272912 15939357 ~ 15939950 (+)
G33815 NA other downstream 2396970 16063415 ~ 16066464 (+)
G34400 NA other downstream 3310883 16971995 ~ 17025976 (+)

Expression


Co-expression Network