fam110a (fam110a)


Basic Information

Item Value
gene id fam110a
gene name fam110a
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035911.1
NCBI id CM008314.1
chromosome length 35718434
location 24571423 ~ 24605346 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007249927.3
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AGAAAGATTTTTGCAAAA

Function

symbol description
fam110a Is expressed in margin; pronephric duct; and yolk syncytial layer. Orthologous to human FAM110A (family with sequence similarity 110 member A).

NR:

description
PREDICTED: protein FAM110A-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_022677384.1 False 5018 mRNA 0.45 3 24571423 24605346

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G134093 prim1,LOC107741309 other downstream 940268 23624281 ~ 23631155 (-)
LOC103034468 cdc42,LOC107083933,LOC103386293,LOC100697482,LOC107395067,LOC108435227 other downstream 1655039 22909821 ~ 22916384 (-)
LOC111194123 NA other upstream 16271 24621617 ~ 24631857 (-)
ebp ebp,LOC107672060,LOC107712744 other upstream 201567 24806913 ~ 24809335 (-)
trnah-gug_15 NA other upstream 205085 24810431 ~ 24810502 (-)
G134867 si:rp71-17i16.4,tnnc2,LOC103044939,LOC108434838,LOC107737591,LOC107568845,LOC107672054,LOC101472191 other upstream 1186541 25791887 ~ 25798373 (-)
taf13 taf13,LOC107671955 other upstream 1198731 25804077 ~ 25805824 (-)

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