G100488


Basic Information

Item Value
gene id G100488
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000016
NCBI id null
chromosome length 12175457
location 11762108 ~ 11785556 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU114338
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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU114338 False 17222 lncRNA 0.37 3 11762108 11785556
TU114339 True 17222 lncRNA 0.37 3 11762108 11785556

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000016_11353238_11464979 TRIO, TRIOB coding downstream 297129 11352733 ~ 11464979 (-)
CI01000016_11167265_11226409 COBL coding downstream 535699 11167265 ~ 11226409 (-)
CI01000016_11161373_11165449 NA coding downstream 596659 11159368 ~ 11165449 (-)
CI01000016_11034620_11091604 GRB10B, GRB10 coding downstream 670504 11034620 ~ 11091604 (-)
CI01000016_10989691_11026452 NA coding downstream 735656 10988377 ~ 11026452 (-)
CI01000016_11866962_11874982 PAPD7 coding upstream 80428 11865984 ~ 11874982 (-)
CI01000016_11876020_11896223 ICE1 coding upstream 89936 11875492 ~ 11896223 (-)
CI01000016_11908468_11923802 PRPF3 coding upstream 122171 11907727 ~ 11925765 (-)
CI01000016_11938043_11946368 NA coding upstream 151891 11937447 ~ 11946561 (-)
CI01000016_12116368_12123187 NA coding upstream 330746 12116302 ~ 12123298 (-)
G100625 NA non-coding downstream 131950 11629855 ~ 11630158 (-)
G100621 NA non-coding downstream 134684 11627188 ~ 11627424 (-)
G100619 NA non-coding downstream 138878 11622980 ~ 11623230 (-)
G100616 NA non-coding downstream 144490 11617398 ~ 11617618 (-)
G100562 NA non-coding downstream 439281 11320886 ~ 11322827 (-)
G100669 NA non-coding upstream 115086 11900642 ~ 11900861 (-)
G100670 NA non-coding upstream 115550 11901106 ~ 11901345 (-)
G100679 NA non-coding upstream 161665 11947221 ~ 11947828 (-)
G100701 NA non-coding upstream 196520 11982076 ~ 11982307 (-)
G100712 NA non-coding upstream 214144 11999700 ~ 12000027 (-)
G100190 NA other downstream 1709719 10051168 ~ 10052389 (-)
G99178 NA other downstream 1947153 9814361 ~ 9814955 (-)
CI01000016_09510177_09512196 ID4 other downstream 2249680 9509622 ~ 9512428 (-)
G98691 NA other downstream 2504497 9256102 ~ 9257611 (-)
G98679 NA other downstream 2522179 9234996 ~ 9239929 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
eurasian perch (Perca fluviatilis) G132349 NA non-coding NC_053124.1 CM020921.1 9912855 ~ 9913121 (-)