XLOC_009146 (igsf9ba)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_009146
gene name igsf9ba
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 19131702 ~ 19250543 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00018001
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Function

symbol description
igsf9ba Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human IGSF9B (immunoglobulin superfamily member 9B).

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-060503-729 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human IGSF9B (immunoglobulin superfamily member 9B).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000033845

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00018001 False 8807 mRNA 0.46 20 19131702 19250543
TCONS_00018002 False 9597 mRNA 0.46 20 19131849 19250543
TCONS_00018003 True 701 processed_transcript 0.50 4 19135979 19138513

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_009144 arhgap32a coding downstream 2997 19036377 ~ 19128705 (-)
XLOC_009145 AL845312.1 coding downstream 36595 19094511 ~ 19095107 (-)
XLOC_009143 ncam1b coding downstream 556986 18368809 ~ 18574716 (-)
XLOC_009142 zbtb16b coding downstream 770227 18253542 ~ 18361475 (-)
XLOC_009141 or131-2 coding downstream 891503 18238419 ~ 18240199 (-)
XLOC_009147 NA coding upstream 34621 19285164 ~ 19286600 (-)
XLOC_009148 thyn1 coding upstream 80616 19331159 ~ 19334448 (-)
XLOC_009149 esamb coding upstream 103150 19353693 ~ 19443997 (-)
XLOC_009150 BX324206.1 coding upstream 106727 19357270 ~ 19357389 (-)
XLOC_009151 BX324151.1 coding upstream 292277 19542820 ~ 19542934 (-)
XLOC_009135 CR388163.1 non-coding downstream 950878 18177941 ~ 18180824 (-)
XLOC_009132 CR388163.2 non-coding downstream 979922 18151665 ~ 18151780 (-)
XLOC_009127 BX901923.1 non-coding downstream 1261612 17844191 ~ 17870090 (-)
XLOC_009125 NA non-coding downstream 1376776 17751150 ~ 17754926 (-)
XLOC_009152 CU013548.1 non-coding upstream 331364 19581907 ~ 19583015 (-)
XLOC_009157 NA non-coding upstream 533948 19784491 ~ 19793611 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location