RNA id: TCONS_00026322


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00026322
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_013308
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 15036151 ~ 15036269 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aatacaaaccatatcaccctgcagcccaagactggttactcactgaagctataagcagggctgagcctggttatcacatggatgggagaccacattggaAAACTAGGTTgatggtgtta

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118662

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027275 lncRNA downstream 270268 14763903 ~ 14765883 (-) True XLOC_013300
TCONS_00026294 lncRNA downstream 1748500 13281654 ~ 13287651 (-) True XLOC_013291
TCONS_00027274 lncRNA downstream 1921833 13077843 ~ 13114318 (-) True XLOC_013288
TCONS_00027273 lncRNA downstream 2172628 12862604 ~ 12863523 (-) True XLOC_013284
TCONS_00027272 lncRNA downstream 2672822 12358383 ~ 12363329 (-) True XLOC_013278
TCONS_00027276 lncRNA upstream 151748 15188017 ~ 15191812 (-) True XLOC_013310
TCONS_00026327 lncRNA upstream 259767 15296036 ~ 15311911 (-) False XLOC_013312
TCONS_00026328 lncRNA upstream 282117 15318386 ~ 15320930 (-) True XLOC_013312
TCONS_00026330 lncRNA upstream 331231 15367500 ~ 15370455 (-) True XLOC_013313
TCONS_00027277 lncRNA upstream 534642 15570911 ~ 15592525 (-) False XLOC_013318
TCONS_00026318 mRNA downstream 94311 14928040 ~ 14941840 (-) False XLOC_013306
TCONS_00026319 mRNA downstream 98940 14928053 ~ 14937211 (-) True XLOC_013306
TCONS_00026315 mRNA downstream 113279 14906570 ~ 14922872 (-) False XLOC_013305
TCONS_00026316 mRNA downstream 118855 14908964 ~ 14917296 (-) False XLOC_013305
TCONS_00026317 mRNA downstream 119085 14910079 ~ 14917066 (-) True XLOC_013305
TCONS_00026323 mRNA upstream 111662 15147931 ~ 15155962 (-) True XLOC_013309
TCONS_00026324 mRNA upstream 223119 15259388 ~ 15269272 (-) True XLOC_013311
TCONS_00026325 mRNA upstream 250796 15287065 ~ 15329454 (-) False XLOC_013312
TCONS_00026326 mRNA upstream 259650 15295919 ~ 15329471 (-) False XLOC_013312
TCONS_00026329 mRNA upstream 297848 15334117 ~ 15373620 (-) False XLOC_013313
TCONS_00026312 other downstream 165015 14866383 ~ 14871136 (-) True XLOC_013303
TCONS_00026302 other downstream 698693 14336627 ~ 14337458 (-) True XLOC_013296
TCONS_00026298 other downstream 1491784 13544250 ~ 13544367 (-) True XLOC_013294
TCONS_00026297 other downstream 1557929 13477102 ~ 13478222 (-) True XLOC_013293
TCONS_00026288 other downstream 2090420 12945617 ~ 12945731 (-) True XLOC_013286
TCONS_00026338 other upstream 542233 15578502 ~ 15610237 (-) True XLOC_013318
TCONS_00026339 other upstream 551818 15588087 ~ 15588201 (-) True XLOC_013319
TCONS_00026341 other upstream 839393 15875662 ~ 15875780 (-) True XLOC_013321
TCONS_00026386 other upstream 2375601 17411870 ~ 17415589 (-) False XLOC_013343
TCONS_00026401 other upstream 3532972 18569241 ~ 18569322 (-) True XLOC_013355