RNA id: TCONS_00029418


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00029418
length 539
RNA type mRNA
GC content 0.48
exon number 4
gene id XLOC_014910
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 32840143 ~ 32849036 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GGAATGACTGCTGTCTCTTATCAAGTGCGCTTCTTCCTGCACTTGAAGTGGATGTGTGACGATAACACTCACTGTCAAGTGCTCGACTTCAGTCCTGTCAGAGGAACAGGACACGATGGGCTGCACTTCCAGCACTCAGACCACAGCTCAAGACACAACAAGACCCAAACACGATGGATGCGCAGCAGGAACGAGTAATGAAAATGGCGGCCCTGCAGGAGACACTGAGACAATCCTAGACCTAAATGAAGAAGTCCAATGCTCTGCTGCTGCTTCAGCTCACACCGAACCTGAAGCAGCTGTTGCAGAGTCCAACCCCGACCAGCCTGAATCCAACCCGTCTGCCACAGCTGAAAATACTGAAGATCCAGCACCCAGTGAAAACGCAACTGTAGATCAAGCAGAATCCTCTCCTCCAGAGGAAACACCAGCCTCTGGTCAAGATGGTTAAATGTGCATTAACTGGCATGGCTACTACAGGATCCAAATTTTACCACCTGTTTTTGGATTTCATGTGAAtggtttaaatataaaattga

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-060503-352 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000131518

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00029413 lncRNA downstream 208005 32624756 ~ 32632138 (-) True XLOC_014907
TCONS_00029371 lncRNA downstream 1874482 30962723 ~ 30965661 (-) True XLOC_014885
TCONS_00029791 lncRNA downstream 2005046 30831190 ~ 30835097 (-) True XLOC_014883
TCONS_00030294 lncRNA downstream 2117639 30721012 ~ 30722504 (-) True XLOC_014880
TCONS_00030293 lncRNA downstream 2216411 30592319 ~ 30623732 (-) True XLOC_014879
TCONS_00029429 lncRNA upstream 409536 33258572 ~ 33268126 (-) False XLOC_014917
TCONS_00029432 lncRNA upstream 421541 33270577 ~ 33274989 (-) True XLOC_014917
TCONS_00030295 lncRNA upstream 933747 33782783 ~ 33786703 (-) True XLOC_014920
TCONS_00030296 lncRNA upstream 1339156 34188192 ~ 34230285 (-) True XLOC_014927
TCONS_00030297 lncRNA upstream 1432850 34281886 ~ 34283008 (-) True XLOC_014928
TCONS_00029416 mRNA downstream 35608 32766423 ~ 32804535 (-) False XLOC_014909
TCONS_00029415 mRNA downstream 35608 32766423 ~ 32804535 (-) False XLOC_014909
TCONS_00029417 mRNA downstream 56770 32770614 ~ 32783373 (-) True XLOC_014909
TCONS_00029411 mRNA downstream 129221 32623230 ~ 32710922 (-) False XLOC_014907
TCONS_00029410 mRNA downstream 198418 32622177 ~ 32641725 (-) False XLOC_014907
TCONS_00029419 mRNA upstream 15541 32864577 ~ 32888758 (-) True XLOC_014911
TCONS_00029420 mRNA upstream 46343 32895379 ~ 32914305 (-) False XLOC_014912
TCONS_00029421 mRNA upstream 46344 32895380 ~ 32914227 (-) True XLOC_014912
TCONS_00029422 mRNA upstream 67336 32916372 ~ 32928486 (-) False XLOC_014913
TCONS_00029423 mRNA upstream 69095 32918131 ~ 32928470 (-) True XLOC_014913
TCONS_00029414 other downstream 190362 32649667 ~ 32649781 (-) True XLOC_014908
TCONS_00029412 other downstream 214264 32624756 ~ 32625879 (-) False XLOC_014907
TCONS_00029400 other downstream 509513 32330513 ~ 32330630 (-) True XLOC_014901
TCONS_00029399 other downstream 690032 32078951 ~ 32150111 (-) True XLOC_014900
TCONS_00029389 other downstream 1255742 31583252 ~ 31584401 (-) True XLOC_014894
TCONS_00029434 other upstream 523328 33372364 ~ 33372694 (-) True XLOC_014919
TCONS_00029436 other upstream 982333 33831369 ~ 33834435 (-) False XLOC_014921
TCONS_00029437 other upstream 984484 33833520 ~ 33835368 (-) True XLOC_014921
TCONS_00029439 other upstream 998098 33847134 ~ 33850219 (-) True XLOC_014922
TCONS_00029443 other upstream 1039568 33888604 ~ 33915864 (-) False XLOC_014923

Expression Profile

//