RNA id: XM_036977284.1



Basic Information


Item Value
RNA id XM_036977284.1
length 11669
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 7
gene id LOC110523614
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 32340876 ~ 32390222 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence


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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU443435 lncRNA upstream 4362 32334608 ~ 32336514 (+) True LOC110523612
TU443434 lncRNA upstream 6578 32333535 ~ 32334298 (+) False LOC110523612
TU443407 lncRNA upstream 22507 32318155 ~ 32318369 (+) True G390610
TU443242 lncRNA upstream 27514 32313137 ~ 32313362 (+) True G390450
TU443238 lncRNA upstream 36047 32304606 ~ 32304829 (+) True G390446
TU443466 lncRNA downstream 12604 32402826 ~ 32403113 (+) True G390649
TU443520 lncRNA downstream 146191 32536413 ~ 32536927 (+) True G390700
TU443554 lncRNA downstream 216933 32607155 ~ 32623203 (+) True LOC110523621
TU443594 lncRNA downstream 263480 32653702 ~ 32654170 (+) True LOC118964584
TU443617 lncRNA downstream 324268 32714490 ~ 32716961 (+) True LOC110523622
XM_036977283.1 mRNA upstream 4431 32333502 ~ 32336445 (+) False LOC110523612
XM_021602468.2 mRNA upstream 70094 32257928 ~ 32270782 (+) False lhx3
XM_021602467.2 mRNA upstream 70094 32260648 ~ 32270782 (+) False lhx3
XM_021602466.2 mRNA upstream 70094 32260650 ~ 32270782 (+) True lhx3
XR_002473470.2 mRNA upstream 180459 32152908 ~ 32160417 (+) False LOC110523608
XM_021602472.2 mRNA downstream 14276 32404498 ~ 32485105 (+) False nup214
XM_021602473.2 mRNA downstream 14276 32404498 ~ 32485105 (+) False nup214
XM_036977288.1 mRNA downstream 14276 32404498 ~ 32485105 (+) False nup214
XM_036977289.1 mRNA downstream 14276 32404498 ~ 32485105 (+) False nup214
XM_036977290.1 mRNA downstream 14276 32404498 ~ 32485105 (+) False nup214
TU443183 other upstream 120343 32220181 ~ 32220533 (+) True G390393
TU442960 other upstream 380131 31960355 ~ 31960745 (+) True G390184
TU440680 other upstream 2053052 30286951 ~ 30287824 (+) True G388019
TU440079 other upstream 2442742 29896986 ~ 29898134 (+) True G387516
TU439971 other upstream 2594682 29741800 ~ 29746194 (+) True tbx5a
TU444420 other downstream 768604 33158826 ~ 33162980 (+) True G391513
TU444741 other downstream 970735 33360957 ~ 33361341 (+) True G391805
TU445804 other downstream 1757252 34147474 ~ 34148701 (+) False G392776
TU448046 other downstream 3514890 35905112 ~ 35905781 (+) True G394882
TU448080 other downstream 3576715 35966937 ~ 36004829 (+) True G394910

Expression Profile