RNA id: TCONS_00031153



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00031153
length 357
RNA type mRNA
GC content 0.29
exon number 16
gene id XLOC_015592
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 33664387 ~ 33698458 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CAATATTTTGTAAACATGTATTTTGGGGTTATGTTAGCGAAATACAGCACTTGTGTGTTGATCATGATTTGCTACTTAAAACAGATTTTCTGCATTGGTTTTAATTTTAATgctCGCTGGTTTATCCTGAAAACTcaCAAATACCTGtggagaattttaaaaataaatttagcagtcatgctgaaaactttaaaTGCATCCCTAACCATTTATGTTATAATAAGTGTAATAATAAGTGGTTCAGTTAAATTTCAAAAAATGGCAACATTTAGAATGGCTTCTTTGTTTTGTCAGGGTGTAACTATATATAGAGTAATAATggatattcaattaaaaaatggggctaataatttttcc

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184234

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033598 lncRNA upstream 196217 33467112 ~ 33468170 (+) True XLOC_015590
TCONS_00033597 lncRNA upstream 429130 33222962 ~ 33235257 (+) True XLOC_015586
TCONS_00033596 lncRNA upstream 634959 33001203 ~ 33029428 (+) False XLOC_015584
TCONS_00033272 lncRNA upstream 636531 33022897 ~ 33027856 (+) True XLOC_015584
TCONS_00031134 lncRNA upstream 772382 32866710 ~ 32892005 (+) False XLOC_015584
TCONS_00033273 lncRNA downstream 61159 33759617 ~ 33771872 (+) True XLOC_015601
TCONS_00033274 lncRNA downstream 199012 33897470 ~ 33898732 (+) True XLOC_015603
TCONS_00033600 lncRNA downstream 201094 33899552 ~ 33908702 (+) True XLOC_015604
TCONS_00033601 lncRNA downstream 482687 34181145 ~ 34208131 (+) False XLOC_015610
TCONS_00033602 lncRNA downstream 482687 34181145 ~ 34356669 (+) True XLOC_015610
TCONS_00031151 mRNA upstream 121341 33541928 ~ 33543046 (+) True XLOC_015591
TCONS_00031150 mRNA upstream 198016 33457310 ~ 33466371 (+) True XLOC_015589
TCONS_00031146 mRNA upstream 241589 33368414 ~ 33422798 (+) False XLOC_015588
TCONS_00031156 mRNA downstream 24089 33722547 ~ 33725328 (+) True XLOC_015596
TCONS_00031157 mRNA downstream 28404 33726862 ~ 33728796 (+) True XLOC_015597
TCONS_00031158 mRNA downstream 49051 33747509 ~ 33750290 (+) True XLOC_015598
TCONS_00031159 mRNA downstream 53032 33751490 ~ 33753382 (+) True XLOC_015599
TCONS_00031161 mRNA downstream 97749 33796207 ~ 33821163 (+) True XLOC_015602
TCONS_00031140 other upstream 464019 33189584 ~ 33200368 (+) False XLOC_015585
TCONS_00031127 other upstream 837134 32826503 ~ 32827253 (+) True XLOC_015579
TCONS_00031124 other upstream 873501 32790363 ~ 32790886 (+) True XLOC_015577
TCONS_00031122 other upstream 904055 32758663 ~ 32760332 (+) True XLOC_015576
TCONS_00031120 other upstream 956976 32701851 ~ 32707411 (+) True XLOC_015574
TCONS_00031160 other downstream 57920 33756378 ~ 33757568 (+) True XLOC_015600
TCONS_00031162 other downstream 201977 33900435 ~ 33900512 (+) True XLOC_015605
TCONS_00031163 other downstream 203867 33902325 ~ 33902455 (+) True XLOC_015606
TCONS_00031167 other downstream 228761 33927219 ~ 33933001 (+) True XLOC_015607
TCONS_00031194 other downstream 2132871 35831329 ~ 35831445 (+) True XLOC_015626