RNA id: TCONS_00032467


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00032467
length 49
RNA type TR_J_gene
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_016495
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 31863717 ~ 31863765 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GGCGACTGGATCAAAAGATTTGGATCTGGAACACGCCTGATAGTAACCG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000163969

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033868 lncRNA downstream 248969 31612853 ~ 31614748 (-) True XLOC_016485
TCONS_00032444 lncRNA downstream 250440 31612853 ~ 31613277 (-) False XLOC_016485
TCONS_00033867 lncRNA downstream 754770 31092749 ~ 31108947 (-) True XLOC_016480
TCONS_00033866 lncRNA downstream 763840 31092749 ~ 31099877 (-) False XLOC_016480
TCONS_00033865 lncRNA downstream 766014 31092749 ~ 31097703 (-) False XLOC_016480
TCONS_00033869 lncRNA upstream 18642 31882407 ~ 31883178 (-) False XLOC_016505
TCONS_00032483 lncRNA upstream 33903 31897668 ~ 31898907 (-) True XLOC_016508
TCONS_00033870 lncRNA upstream 331060 32194825 ~ 32201587 (-) True XLOC_016510
TCONS_00032488 lncRNA upstream 353700 32217465 ~ 32220224 (-) False XLOC_016511
TCONS_00033871 lncRNA upstream 353700 32217465 ~ 32232159 (-) False XLOC_016511
TCONS_00032462 mRNA downstream 30370 31830183 ~ 31833347 (-) True XLOC_016490
TCONS_00032461 mRNA downstream 63196 31781843 ~ 31800521 (-) True XLOC_016489
TCONS_00032460 mRNA downstream 65000 31781843 ~ 31798717 (-) False XLOC_016489
TCONS_00032459 mRNA downstream 72084 31781843 ~ 31791633 (-) False XLOC_016489
TCONS_00032458 mRNA downstream 95890 31762852 ~ 31767827 (-) True XLOC_016488
TCONS_00032480 mRNA upstream 27570 31891335 ~ 31937005 (-) False XLOC_016508
TCONS_00032482 mRNA upstream 28600 31892365 ~ 31936966 (-) False XLOC_016508
TCONS_00032481 mRNA upstream 28600 31892365 ~ 31936966 (-) False XLOC_016508
TCONS_00032484 mRNA upstream 252086 32115851 ~ 32119196 (-) True XLOC_016509
TCONS_00032485 mRNA upstream 351507 32215272 ~ 32262287 (-) False XLOC_016511
TCONS_00032466 other downstream 1100 31862569 ~ 31862617 (-) True XLOC_016494
TCONS_00032465 other downstream 1744 31861919 ~ 31861973 (-) True XLOC_016493
TCONS_00032464 other downstream 2319 31861353 ~ 31861398 (-) True XLOC_016492
TCONS_00032463 other downstream 4181 31856242 ~ 31859536 (-) True XLOC_016491
TCONS_00032446 other downstream 235930 31626850 ~ 31627787 (-) False XLOC_016484
TCONS_00032468 other upstream 301 31864066 ~ 31864111 (-) True XLOC_016496
TCONS_00032469 other upstream 634 31864399 ~ 31864450 (-) True XLOC_016497
TCONS_00032470 other upstream 1692 31865457 ~ 31865501 (-) True XLOC_016498
TCONS_00032471 other upstream 2957 31866722 ~ 31867190 (-) True XLOC_016499
TCONS_00032472 other upstream 5356 31869121 ~ 31869554 (-) True XLOC_016500