RNA id: TCONS_00034151



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00034151
length 135
RNA type rRNA
GC content 0.43
exon number 1
gene id XLOC_017119
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 5423962 ~ 5424096 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCAATAGAAATGCAATTTATTCAGTTGttgattaaaactttatttctggCACCAGTTCAACtaagctaagcagggttgagcctggtcagtacctggacgggtgaccacatggaaaaactaggttgctgttggac

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000122838

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00034142 lncRNA upstream 366010 5051189 ~ 5057952 (+) True XLOC_017113
TCONS_00034136 lncRNA upstream 1105489 4311851 ~ 4318473 (+) True XLOC_017108
TCONS_00034135 lncRNA upstream 1111741 4309521 ~ 4312221 (+) False XLOC_017108
TCONS_00034134 lncRNA upstream 1116227 4304457 ~ 4307735 (+) True XLOC_017107
TCONS_00036367 lncRNA upstream 1497042 3925357 ~ 3926920 (+) True XLOC_017100
TCONS_00036542 lncRNA downstream 788714 6212810 ~ 6214789 (+) True XLOC_017124
TCONS_00034179 lncRNA downstream 1903395 7327491 ~ 7351711 (+) False XLOC_017136
TCONS_00036368 lncRNA downstream 1903531 7327627 ~ 7350653 (+) False XLOC_017136
TCONS_00036543 lncRNA downstream 2109620 7533716 ~ 7540142 (+) True XLOC_017139
TCONS_00036369 lncRNA downstream 2477860 7901956 ~ 7902288 (+) True XLOC_017142
TCONS_00034150 mRNA upstream 278629 5132208 ~ 5145333 (+) True XLOC_017118
TCONS_00034149 mRNA upstream 285194 5132138 ~ 5138768 (+) False XLOC_017118
TCONS_00034148 mRNA upstream 303025 5106568 ~ 5120937 (+) True XLOC_017117
TCONS_00034144 mRNA upstream 329539 5074118 ~ 5094423 (+) False XLOC_017115
TCONS_00034145 mRNA upstream 332863 5074123 ~ 5091099 (+) True XLOC_017115
TCONS_00034152 mRNA downstream 138946 5563042 ~ 5700369 (+) False XLOC_017120
TCONS_00034153 mRNA downstream 139946 5564042 ~ 5957633 (+) False XLOC_017120
TCONS_00034154 mRNA downstream 139946 5564042 ~ 5965307 (+) False XLOC_017120
TCONS_00034156 mRNA downstream 561233 5985329 ~ 6010136 (+) True XLOC_017121
TCONS_00034157 mRNA downstream 611331 6035427 ~ 6079923 (+) True XLOC_017122
TCONS_00034147 other upstream 311919 5106568 ~ 5112043 (+) False XLOC_017117
TCONS_00034146 other upstream 348908 5074924 ~ 5075054 (+) True XLOC_017116
TCONS_00034116 other upstream 2515297 2908551 ~ 2908665 (+) True XLOC_017093
TCONS_00034086 other upstream 4031307 1385749 ~ 1392655 (+) True XLOC_017071
TCONS_00034041 other upstream 5105857 262995 ~ 318105 (+) False XLOC_017045
TCONS_00034155 other downstream 249934 5674030 ~ 5697001 (+) True XLOC_017120
TCONS_00034160 other downstream 911200 6335296 ~ 6335411 (+) True XLOC_017125
TCONS_00034173 other downstream 1495652 6919748 ~ 6919864 (+) True XLOC_017131
TCONS_00034180 other downstream 1903717 7327813 ~ 7331330 (+) True XLOC_017136
TCONS_00034181 other downstream 1916982 7341078 ~ 7341194 (+) True XLOC_017137