RNA id: TCONS_00037550



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00037550
length 133
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_018891
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 21920077 ~ 21920209 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TCTTGCATACAgtacctctgttgtaacgagtggttatttgagttactgttgccccTCACTGAAGCCAAggagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121124

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00037536 lncRNA upstream 165647 21750635 ~ 21754430 (+) True XLOC_018883
TCONS_00037535 lncRNA upstream 175285 21743699 ~ 21744792 (+) False XLOC_018883
TCONS_00039400 lncRNA upstream 267926 21649760 ~ 21652151 (+) True XLOC_018864
TCONS_00037504 lncRNA upstream 572697 21339320 ~ 21347380 (+) False XLOC_018859
TCONS_00039401 lncRNA downstream 178167 22098376 ~ 22103173 (+) True XLOC_018893
TCONS_00039168 lncRNA downstream 305157 22225366 ~ 22225898 (+) True XLOC_018896
TCONS_00037560 lncRNA downstream 449660 22369869 ~ 22372212 (+) False XLOC_018899
TCONS_00037561 lncRNA downstream 449676 22369885 ~ 22371627 (+) True XLOC_018899
TCONS_00037568 lncRNA downstream 715195 22635404 ~ 22637409 (+) False XLOC_018904
TCONS_00037547 mRNA upstream 100756 21817975 ~ 21819321 (+) False XLOC_018889
TCONS_00037546 mRNA upstream 100756 21817975 ~ 21819321 (+) True XLOC_018889
TCONS_00037544 mRNA upstream 106301 21811867 ~ 21813776 (+) False XLOC_018888
TCONS_00037545 mRNA upstream 106438 21812311 ~ 21813639 (+) True XLOC_018888
TCONS_00037542 mRNA upstream 110970 21803596 ~ 21809107 (+) True XLOC_018887
TCONS_00037552 mRNA downstream 204527 22124736 ~ 22142972 (+) False XLOC_018894
TCONS_00037553 mRNA downstream 204540 22124749 ~ 22142967 (+) True XLOC_018894
TCONS_00037554 mRNA downstream 238535 22158744 ~ 22214734 (+) True XLOC_018895
TCONS_00037555 mRNA downstream 317755 22237964 ~ 22309466 (+) False XLOC_018897
TCONS_00037556 mRNA downstream 318501 22238710 ~ 22309466 (+) True XLOC_018897
TCONS_00037548 other upstream 10283 21894067 ~ 21909794 (+) False XLOC_018890
TCONS_00037537 other upstream 157981 21761978 ~ 21762096 (+) True XLOC_018884
TCONS_00037531 other upstream 182750 21736733 ~ 21737327 (+) True XLOC_018880
TCONS_00037528 other upstream 190809 21727264 ~ 21729268 (+) False XLOC_018878
TCONS_00037529 other upstream 191667 21727474 ~ 21728410 (+) True XLOC_018878
TCONS_00037551 other downstream 115852 22036061 ~ 22036177 (+) True XLOC_018892
TCONS_00037569 other downstream 715205 22635414 ~ 22637409 (+) False XLOC_018904
TCONS_00037570 other downstream 716678 22636887 ~ 22662564 (+) True XLOC_018904
TCONS_00037591 other downstream 1764511 23684720 ~ 23684836 (+) True XLOC_018919
TCONS_00037595 other downstream 2315942 24236151 ~ 24236272 (+) True XLOC_018921