RNA id: TCONS_00037595


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00037595
length 122
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_018921
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 24236151 ~ 24236272 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACTTACAGTAACTGTAAGTACCTGGGTATGCCCGATCTTGTCTGATCTCGGAAGTAAAGCAAGGTTGGGCATGGTTAGTACTTgaatgggagaccgcctgggaatacgaGGTTCTTTAAGCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120764

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00039407 lncRNA upstream 927906 23305526 ~ 23308245 (+) True XLOC_018918
TCONS_00039406 lncRNA upstream 1071843 23160137 ~ 23164308 (+) True XLOC_018917
TCONS_00039405 lncRNA upstream 1071947 23160137 ~ 23164204 (+) False XLOC_018917
TCONS_00039403 lncRNA upstream 1184604 23048537 ~ 23051547 (+) False XLOC_018914
TCONS_00037598 lncRNA downstream 186926 24423198 ~ 24438842 (+) False XLOC_018922
TCONS_00037597 lncRNA downstream 186926 24423198 ~ 24438842 (+) False XLOC_018922
TCONS_00039169 lncRNA downstream 187060 24423332 ~ 24424191 (+) False XLOC_018922
TCONS_00039170 lncRNA downstream 187060 24423332 ~ 24438577 (+) True XLOC_018922
TCONS_00039171 lncRNA downstream 199994 24436266 ~ 24436985 (+) True XLOC_018923
TCONS_00037589 mRNA upstream 1079843 23135322 ~ 23156308 (+) False XLOC_018916
TCONS_00037590 mRNA upstream 1089600 23135395 ~ 23146551 (+) True XLOC_018916
TCONS_00037587 mRNA upstream 1104551 23108420 ~ 23131600 (+) False XLOC_018915
TCONS_00037586 mRNA upstream 1104551 23108420 ~ 23131600 (+) False XLOC_018915
TCONS_00037588 mRNA upstream 1109809 23112544 ~ 23126342 (+) True XLOC_018915
TCONS_00037596 mRNA downstream 51131 24287403 ~ 24412427 (+) True XLOC_018920
TCONS_00037599 mRNA downstream 299961 24536233 ~ 24537058 (+) False XLOC_018925
TCONS_00037600 mRNA downstream 299985 24536257 ~ 24537061 (+) False XLOC_018925
TCONS_00037601 mRNA downstream 299993 24536265 ~ 24537061 (+) True XLOC_018925
TCONS_00037605 mRNA downstream 748698 24984970 ~ 25046991 (+) True XLOC_018930
TCONS_00037591 other upstream 551315 23684720 ~ 23684836 (+) True XLOC_018919
TCONS_00037570 other upstream 1573587 22636887 ~ 22662564 (+) True XLOC_018904
TCONS_00037569 other upstream 1598742 22635414 ~ 22637409 (+) False XLOC_018904
TCONS_00037551 other upstream 2199974 22036061 ~ 22036177 (+) True XLOC_018892
TCONS_00037550 other upstream 2315942 21920077 ~ 21920209 (+) True XLOC_018891
TCONS_00037602 other downstream 311252 24547524 ~ 24547600 (+) True XLOC_018926
TCONS_00037603 other downstream 431949 24668221 ~ 24668337 (+) True XLOC_018927
TCONS_00037604 other downstream 513390 24749662 ~ 24749779 (+) True XLOC_018928
TCONS_00037613 other downstream 884295 25120567 ~ 25125462 (+) False XLOC_018933
TCONS_00037614 other downstream 896892 25133164 ~ 25171639 (+) True XLOC_018933