RNA id: TCONS_00039584


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00039584
length 7621
lncRNA type inter_gene
GC content 0.41
exon number 5
gene id XLOC_019428
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 12495708 ~ 12545977 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTCAGCTTGAAAGTTGAACTTGAGTGGGGAAAGTTAAACATGAGTGGTGTGTTTGTCTTTAAAGTGGCTGTGAaatcaaaattacatttttagatgctagtatcagtatgttagtcctATGgatataccagcctgatctcacgaggaaacgtattatacgttttgctagtttagtggctaattcgtacaaattcgtacgagttcagtcgtacaaaaatgtacaattttaaaaaggaggtgtggcacctaaccccacccctaaactcaaccgtcattgggtgatgagcaaatcatactaaattgtacgaattagattgtacgaattcatacaaattagccactaaatgaaaaagttacgaattgccgtgagattgtgttggatatacACTACCTacaagtcttgtcgcttatccaagttttagaaacaacaaataataacttgacttctagttgatcatttggtatcagaagtggcatatatgaaaggcaaaggcctctagattatgcttattttaccaaaataaaatatgatcatgccttgatttttaattatgtaattacaatttgacacattcaaaccactgcagaaatgttctaaccaacagacCGAAGGTGTGAGCGCAGAGCTTCGatcaacagtgttgccagattgggtggtTTTGAACACGATTGTGcatggaagtggtgttagtgaggccagcagggggtgctcaacgtgtggtctatgtgagtcctaatgccccagtaaaattGAAGGgcacactacactgtcagtgggcgccgtctttcagatgagacgttaaaccgaggtcctgactctctgtggtcaataaaaatcccGTGGCACTTCTCGAAAAAGAGCAGACGTGTAACCCCGGtatcctggccaaagtccctctatcggcccttacgatcatggcctcctaatcatccccatccaccgaattggctctatcactgtcacttcactccaccaatagctagtgtgtggtgagcgcactggcgccgttgtcctgtggcagccgtcgcatcatccaaatggatgctgcacactggtggtggtgtggagagaccccgccctcatgattgtgaagcgctttgggtgtatggccatacacaataaatgcgctatataaatacacattacattatattacatgtATAAAATGACATAGGCGGGTATAGAAAGTTTGGGCGGTTTTGCAACAGAACGTCCGCCCCCCCCTCTACTGTGTTGTCCAGACTATCACAACCCatgctggaatcagtcagctacatctggcaacactgtcaAGCAAATACACTGCCATCCAGTGTTACAATGATGACTTTTCAGACTCCCCATcactgtattttcaaaaaaataaccaGGGAATATTAAGTGTTACTGGAGATTTGTAGAGACTCTCATGTATCTGTGTTATTCTTAACGTTACTCTTCACAACAAGGTGCGGGTGATGCCGTCAATCTTTTCCCCGCCTCGGAGCACTCAAGATGGCATAGTGCCACACAGCCGTCAACAAAAGCATTGAGAGCAGGTCAATCTTAATGTAAagatgttctaaatgaatagggcatagggttGATAAtggggaatagaacacaaccaggaactatgcttatacagctctagaggtgtagttgcagaCGTACAGGTTtgtgaatgttcattggaacgacGATTttggaaacggcaaatcaacgaactatgtttgtaacgacgaaACTTGCGACTTTAGTTAGCTAACAAATGTTTTTGGAAACCCACCCCTGTTCTTTTATTTACTTACAATGGAAAACTAGTATATTTGATACAATGCTTATATTGACATTTATAAATGGGTGGGACATGTAAATACAGATACTGTCAATAGCATGTTCTGAGATGAAACTAATGATTTTTGGTGATAAAAAGGGTTGTGGGAggaatttaattattataagcTATTTGCGTCAATGCTAACACAAATACATATTCAAACATGTAGCAAAAATCTAAGTCATTTTTTCAgtataggtcccctttaaatagaCTCCTACAATACACGTACATTCATCCAACATTCAAACAACAGTTTAATTTtcttacctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgcgtgtgtgcgtgcgtgcgtgcgtgcgtgcgtgagtgcgtgagtgcgtgcgtgcgtgcgtgcgtgcgtgtgtgtgtgtgcgtgtgcgggtgcgtgtgtgtgtgcgtgcgcacccgtgtgtgtgtgtgtgtatatttatagacACAGACGCTGGACTCCCTTGAGCAGGATCATGTGGTTTTGCTGGACTGAACTCCAGACATAGGAACATCTGCTCTACTTCTTCTCAGACTGAGGCCAAATCTCCAACCTGAGCAGACTGAACGCGGCGGGTCAGCATGAGTAATGCACACACGGGAGTTCATTCTATCCCATTTATGACCAGGACCCTCTCAGATGTCCCTATCAAAAAAAGATGTGCGTTACCTCCATAAGTGAGCAAGAGGGAATAGATGTTGTATGATGAGAATGAGATCGATATCAAATGCTACAACAACGCATTTCAACCCTGCTTCAGTGCAACAACTTTATATTGTTTCTTTGAAGTCTCCACATTTTGGAAAGCAGCAGTTCTCACTTGGTTTTGCTTCACAACCCTTGTACGTATGATGTCAAGCGCTGACCAGATGATCTAGATGACAAGTGCCATACCATCCTGTGAGATGTGCCAAGACAGAATGAGCATCTGTCAAAACACGTCGGTCCCAGCGGACGCTTCGCTGATGGACGCAGACATGCAGGAGAGAAAAAGATAGacggaaagagagagagagagagacggacaGGAGAACGGCTGAAAAGAGATGATTTGGTTGGGTGGGGTCTGGTCTTCACCTGCTGCGCCCACCAGCATCCTTGAACCTGCTTCACCTCCATCACTGCGAGGGGTCGACACAAAGGTCTCCACACTGTGccttcctctctctctcgctctattTTGATTGTGCGTGGTTACAAGCATACTAATGAACTCCACAATAGAGCCAGAACAAGAGACGAGAAATGGAAATGAACGCTGCTGCGGCTGCTGAAAAtacaattagttaaaaaaaaaacaacacatttgatTTCTCTTTGCAGTCCAATGCATCTAGGTATTTGAATTGCAAAGGACTATTGAATATTGCTTGCGCAAACGCAATAACAGTGCAAACAAACGCAGTCCCTAAGCCGGTTTTGCACTGTTCTTGCTTAACTTGAATTGGTTTCAACTGGTACGCTAGCTTTTATTTAAAGACACACCAGTGGAAGTGGCCTAATGGGCTTCTTGCAGTTGTTCTTGAATTGTTGGAAGTAACAACTTTGCCTTAAAGGCACATTTCATTTTTGTCACTAGATGGTGGATATTCACAACGTAACAACTttgtcttaaaggcacagtatgtaattttcaccactagagggtgagtattcacaacaaacaaatgtgtaGTTTGATGACGATGTGACTGAGtgtgggagttgtggtcttcgtTACATCCTACAGGACTCCTCAGATATCATGTTTGCTTATGAGTCAAAGTATTCAAAACTTATTATCATGGTAATATAAAGCACAATGAGGCTCTTATTTGAAGACAGACCAGTGGAAGCGGCCTAACGGGATTTTTGCGGCTGTTCTCAAATTGTTTGAAGTAACAAAAttgtcttaaaggcacagtatgtcattttcCCCACTAGATGGAGcaaattcacaacaaacaaatgtgtgGATTGATGACgctgtgactgagtgtggaatcatgagaGTTGTGGTCTTCTTTACATCCTTCAGCACTCCTCAGATTTATGTTTGTTCATGAGCTAAAGTGTTCAAAACTTATTATCATGGTAGCATGAAGCACAGTGAGGCTCTTATTTGAAGACACACCAGTGGAAGTAGCCAAATGGGATTCCTGCAGTTGTTCTTGAATTATTTGAAGTAACAACATTGTcctaaaggcacagtatgtcattttcCCCACTAGAGGGAGCAAATTCACCACAAACAAATGTGTAGTTTGATGGCgctgtgactgagtgtggaatcctgggagttgtggtcttcattacatTCTACAGGACTCCTCAGATATCATGTTAATTGATGAGCTAAAGTACTCAAAACTGATTATCATGGTAGCATGAAGCACAGTGAAGCTTTTATTTGAAGACAAACCAGTAGAAGAGGCCTAATGGGAGCTTTGTCTTAAAAACACAGTATGTCATTTTCCCCACTAGAGGGagcgtattcacaacaaacaaatgtgtgATTTGATGACgctgtgactgagtgtggaatcatgggagttgtggtcttcgtTACATACGGGACTCCTCAGATATCAGGTTTATTGATAAGCTAAAGTATTTAAAACTTGTTATCATGTTTTTAATGCAagattttataattgtactgtttGATTCAGAGGAAGAAAATGAGAACTGCTGATACATTGGAACAATTGATTTCTTACTGATTCTTTATATTTGATACTAAAACTATCTGACTAATATACATCagagtaatgctgtgttcacaccacatGCAGAAGAAGCCTCAATctcgagtgatttacatgttaagtcaatgcaaacgcgcaaatAGACACGCCACGTTAGCCAATCAGGAGATTACTCTTGTGGGGCTGTGATAATGACTctgcgcctgttgttggtgtcccggggggaaatcctcctgcacacaccgacaacagttctTCAAACTGGGCTcgactcagtcagaagcaccgctgaatgcttccatcatccaggttaagtttctggaggagtttaggAGCTTACAGAGcagggtgcacctctgaaaggatctagtggactcagacactgctccaaaTGAATTGATGCTGTTTTTTAGCCTTGATAAAACCCTattaaatccatgttagccatttagcaacgaagctacagtcaccgggcagacagaagccctgcccatgacgcgaat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Function

GO:

id name namespace
GO:0007049 cell cycle biological_process
GO:1903047 mitotic cell cycle process biological_process
GO:0000278 mitotic cell cycle biological_process

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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Expression Profile

//